New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3638056 | 36 (0.580) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 7.3% | coding (52/993 nt) | PP_3205 | fumarylacetoacetate hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 3638098 | 42 (0.720) | coding (94/993 nt) | PP_3205 | fumarylacetoacetate hydrolase family protein |
TCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCCGCGTGCCAG > NC_002947/3637953‑3638243 | tCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGcca < 3:90599‑M2/149‑4 (MQ=255) cATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGccacc > 7:253131‑M2/1‑142 (MQ=255) tCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTAGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCt < 6:391394/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCtt > 2:299899/1‑149 (MQ=255) tgctgGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTg > 7:331513/1‑148 (MQ=255) ctgGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGc < 7:201404/147‑1 (MQ=255) ctgGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAg < 8:35904/149‑1 (MQ=255) cGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGTCACGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGACACCAGCTTGCAGGTCGCGCTg > 1:240117/1‑149 (MQ=255) cGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTg > 2:147340/1‑149 (MQ=255) gTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTgg > 2:76744/1‑149 (MQ=255) ttATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGa < 1:299899/149‑1 (MQ=255) cGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTg < 4:90599/149‑1 (MQ=255) cGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTg > 5:66525/1‑149 (MQ=255) acacTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGccc < 1:147340/149‑1 (MQ=255) acTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCTCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGccc > 6:362403/1‑147 (MQ=255) acTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGccc > 4:54580/1‑147 (MQ=255) acTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGccc < 3:54580/147‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGaa > 1:75889/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGca > 6:379658/1‑148 (MQ=255) cATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTg > 3:121367/1‑148 (MQ=255) aTGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCTCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCa < 5:362403/149‑1 (MQ=255) gAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTcgcg < 4:105494/112‑1 (MQ=255) aaGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGgc > 4:186001/1‑149 (MQ=255) cTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCt < 6:66525/149‑1 (MQ=255) ttCGAAGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTAGCACGCGCTGTATcagca > 2:303252/1‑149 (MQ=255) acgGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAac > 7:293752/1‑149 (MQ=255) ccGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATg < 6:8079/149‑1 (MQ=255) gTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCg > 7:321733/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGt < 4:151960/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGccaccagcaggcgaccatcgcggctgccgtcgtcgaacgtggcgagcttcatggcagcagctccttgagtgtctcggcataacgcccatccagcag < 1:114065‑M2/149‑97 (MQ=255) ctgctgGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGccaccagcaggcgaccatcgcggctgccgtcgtcgaacgtggcgagcttcatggcagcagctccttgagtgtctcggcataacgcccatccagcag < 8:279918‑M2/148‑97 (MQ=255) tgctgGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGcc > 3:367561/1‑149 (MQ=255) ctgGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGcc < 5:379658/147‑1 (MQ=255) ctgGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCtt > 4:236933/1‑149 (MQ=255) gtggtggCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGccaccagcaggcgaccatcgcggctgccgtcgtcgaacgtggcgagcttcatggcagcagctccttgagtgtctcggcataacgcccatccagcaggatgaa > 7:279918‑M2/1‑46 (MQ=255) gtggCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCgcgc < 2:75889/148‑1 (MQ=255) tggCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTc < 4:367561/149‑1 (MQ=255) ggCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTc > 7:294656/1‑148 (MQ=255) gCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGa < 8:293752/149‑1 (MQ=255) aCCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACctcgct < 3:186001/149‑1 (MQ=255) cTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACctcgctc > 3:369868/1‑148 (MQ=255) gggCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGAc < 8:321733/148‑1 (MQ=255) cGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTAt < 2:388668/86‑1 (MQ=255) cGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTAt > 1:388668/1‑86 (MQ=255) gATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCt > 6:231451/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTg < 8:294656/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGc > 6:89721/1‑149 (MQ=255) ccAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCcg > 8:148320/1‑149 (MQ=255) aGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCcgcg > 8:685/1‑149 (MQ=255) aGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCcgcg > 5:392233/1‑149 (MQ=255) gCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCCGCGt > 2:262016/1‑149 (MQ=255) cATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCCGCGTgcca < 5:274006/149‑1 (MQ=255) aTCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCCGCGTgccag > 5:201886/1‑149 (MQ=255) | TCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGATGGTCGCCTGCTGGTGGTGGCCCGTGACCTCGGGCATGCGGTCGATGCCAGCGACATCGCCACCAGCTTGCAGGTCGCGCTGGAAAACTGGCCCCAGGTCGAAGCCCGCTTGCAGGCGCTGTATCAGCAGCTCAACGACGATGCGGTTGCGGGTGCCTTCGCGCTCGACCTCGCTCGACTGGCTGCGCCCCTGCCGCGTGCCAG > NC_002947/3637953‑3638243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |