New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4520708 | 58 (0.940) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 7.2% | coding (1030/1257 nt) | icd | NADP(+)‑specific isocitrate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4520754 | 48 (0.810) | coding (984/1257 nt) | icd | NADP(+)‑specific isocitrate dehydrogenase |
GGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCGGCGATGGCGTCCT > NC_002947/4520609‑4520899 | ggTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGgcg < 4:32700‑M2/149‑4 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGgcg < 3:115829‑M2/149‑4 (MQ=255) ggcggcCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCg < 3:32700/149‑1 (MQ=255) ggcCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCgggg < 4:115829/149‑1 (MQ=255) ggTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAAt < 4:25111/147‑1 (MQ=255) tCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGGCAGGTTGGGGCGCGGGGCAATGCCg > 4:211597/1‑149 (MQ=255) cACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGa < 1:234675/148‑1 (MQ=255) cACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTCTCGGACAGGTTCGCGCCCGGGGCAATGCCGa > 8:153152/1‑148 (MQ=255) aCCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATa < 5:71372/149‑1 (MQ=255) ccATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCg > 3:67534/1‑149 (MQ=255) ccATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCg < 6:214579/149‑1 (MQ=255) aTGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCTAGAGTAGCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGcc < 6:12471/149‑1 (MQ=255) cgcAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGGCTCGACCAGGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCAGTGGCAATGCCGATACCGCCCACTTc > 6:104630/1‑149 (MQ=255) cagcaTCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTg < 5:235746/149‑1 (MQ=255) agcaTCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGc > 3:344616/1‑149 (MQ=255) gcaTCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGTCAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCg < 1:75141/149‑1 (MQ=255) catcatCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCgg > 4:381056/1‑149 (MQ=255) tctcTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAgg > 3:181846/1‑149 (MQ=255) tGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAggg < 5:385406/146‑1 (MQ=255) tGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAgg < 3:381056/145‑1 (MQ=255) ccGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCg > 8:21217/1‑149 (MQ=255) gagGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGa > 6:245033/1‑147 (MQ=255) tCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAg > 2:368835/1‑149 (MQ=255) ccGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGATCATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCa > 7:363700/1‑149 (MQ=255) cccGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgtt > 8:216404/1‑149 (MQ=255) cccGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgtt < 5:245033/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCC‑GGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgtt > 1:143671/1‑147 (MQ=255) cGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttga < 7:216404/149‑1 (MQ=255) gggTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttgag < 4:67534/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGCGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttgagg < 8:43342/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttgaggttga < 3:211597/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCTAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGttgaggttgagg < 4:344616/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGttgaggttgagg > 6:325528/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCGTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCCCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGAAGAGGGTGGCGAt > 1:325712/1‑148 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATc < 7:285802/148‑1 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCC‑GGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCa < 2:143671/148‑1 (MQ=255) gCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCAcgtc > 8:87534/1‑149 (MQ=255) tACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGgcgcccaagtatgccgggcaggacaaggtcaaccagggctcggtgatcctctcggcagagatgatgctgcgccaaatggggtggaccgaggc < 8:232186‑M2/149‑93 (MQ=255) aCTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGgcgcccaagtatggcgggcaggacaaggtccacccgggctcggtgatcctatcggcagagatgatgctgcgccacatggggtggaccgaggcc < 3:295654‑M2/149‑94 (MQ=255) ttGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGgcgcccaagtatgccgggcaggacaaggtcaacccgggctcggtgatcctctcggcagagatgatgctgcgccacatggggtggaccgaggccgc < 8:350849‑M2/149‑96 (MQ=255) ttGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTc > 8:44814/1‑149 (MQ=255) gcAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCgg > 7:40932/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGc > 7:201540/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGc > 1:327392/1‑149 (MQ=255) ccGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATAGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTa < 5:124145/148‑1 (MQ=255) gTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCg > 7:296949/1‑88 (MQ=255) gTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCg < 8:296949/88‑1 (MQ=255) aGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAgg < 7:21217/148‑1 (MQ=255) gTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGAt < 7:87534/149‑1 (MQ=255) cTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATctgct > 1:29107/1‑149 (MQ=255) ggCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATgg > 1:234417/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCgg < 1:368835/149‑1 (MQ=255) tCGGACAGGTTGgcgcccaagtatgccgggcaggacaaggtcaacccgggctcggtgatcctctcggcagagatgatgctgcgccacatggggtggaccgaggccgccgacctgatcatcaagggcaccaatggcgccattgcggccaa > 7:350849‑M2/1‑12 (MQ=255) gcGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAAGGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCGGCGAt < 7:153152/148‑1 (MQ=255) ggACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCGGCGATg < 5:325528/148‑1 (MQ=255) gACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCGGCGATGGc > 4:29196/1‑149 (MQ=255) gtgggCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCAAGGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCCTCGGCGATGGCGTCCt > 5:266374/4‑149 (MQ=255) gTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTgca > 6:155390/1‑125 (MQ=255) gTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTgca < 5:155390/125‑1 (MQ=255) gTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCATCGGCGATGGCGTCCt > 5:266379/1‑149 (MQ=255) | GGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTACTCGGCCGGGCGTAGCAGGATCTGCTGCAGCATGGCGTCGGCGATGGCGTCCT > NC_002947/4520609‑4520899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |