| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5686182 = | 83 (1.340) | 4 (0.070) | 3/256 | NT | 5.1% | coding (711/4941 nt) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
| ? | NC_002947 | 5686222 = | 70 (1.170) | coding (671/4941 nt) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver | |||||
AGGCTTCCACGTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGAACGCAGCGCATCGCGCC > NC_002947/5686076‑5686366 | aGGCTTCCACGTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCa < 4:6682/149‑1 (MQ=255)aGGCTTCCACGTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCa < 7:139505/149‑1 (MQ=255) gacttgatgcgaagcatggagcgcctggaccagttcgggcgcggcgaccgtcagcaccgcgaacagctcgatgcgctgttggcgccgttgcgccaggtggctgaCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGGCAg > 5:18453‑M1/105‑148 (MQ=255) acttgatgcgcatcaaggagcgcctggaccagttcgggcgcggcgaccgtcagcaccgcgaacagctcgatgcgctgttggcgccgttgcgccacgtggctgaCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGcc > 7:307367‑M1/104‑149 (MQ=255) aCGTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCCCCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTg > 3:217653/1‑149 (MQ=255) gTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGgc < 5:252634/149‑1 (MQ=255) caacaGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGgcgc < 7:342402/148‑1 (MQ=255) agcgCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACgg > 7:153303/4‑149 (MQ=255) atcacccGCCACAACCATCAACACCGAGTCCTCCACCGCCAGCTCGACCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGCTTCCTCAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGgcg > 7:124810/5‑149 (MQ=255) cccccGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGgcgc > 8:100139/1‑148 (MQ=255) cccccGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGgcgc > 3:225841/1‑148 (MQ=255) cccGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCaa > 4:175431/1‑149 (MQ=255) acaTCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAgcgc < 8:105046/149‑1 (MQ=255) acaTCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAgcgc < 8:123887/149‑1 (MQ=255) acaTCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAgcgc < 3:274920/149‑1 (MQ=255) ccatcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATc > 5:237507/1‑148 (MQ=255) ccatcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATc > 1:118839/1‑148 (MQ=255) catcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCg < 4:217653/148‑1 (MQ=255) atcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCCGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAg < 1:12825/149‑1 (MQ=255) atcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAg < 5:327664/149‑1 (MQ=255) atcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAg > 3:95658/1‑149 (MQ=255) atcAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAg < 2:274449/149‑1 (MQ=255) aaCACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTg > 2:80845/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTg > 6:195418/1‑149 (MQ=255) acCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTc < 8:19984/149‑1 (MQ=255) acCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTc > 3:23903/1‑149 (MQ=255) gcggcgaccgtcagcaccgcgaacagctcgatgcgctgttggcgccgttgcgccacgtggctgaCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAg > 3:301056‑M1/65‑108 (MQ=255) gcggcgaccgtcagcaccgcgaacagctcgatgcgctgttggcgccgttgcgccacgtggctgaCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAg < 4:301056‑M1/44‑1 (MQ=255) ccGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTcg > 5:6812/1‑149 (MQ=255) tcgtcCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTg < 5:234469/149‑1 (MQ=255) cACCGCCCGCGCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGAc < 4:10788/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACg > 1:297386/1‑149 (MQ=255) gcccgcTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTc > 2:243992/1‑149 (MQ=255) cccgcTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcg > 3:276981/1‑149 (MQ=255) cgcTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCACCGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGGCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgcc < 7:119931/149‑1 (MQ=255) cgcTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACCCCAGCACCTCGGCGATGATCACCCGCCGCGGATGCTGAAAGCGCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgcc < 8:14161/149‑1 (MQ=255) cgcTCGCCCTCAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGGTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGTGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgcc < 3:228055/149‑1 (MQ=255) gcTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTCCCGCCCGGGTGTCAGCCACGTGGCGCACAGGCGCCAAGAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGGG‑CTGACGGTcgccg > 5:369028/1‑149 (MQ=255) ccTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGgcgc > 4:324173/1‑103 (MQ=255) ccTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGgcgc < 3:324173/103‑1 (MQ=255) aGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGaa < 4:95658/147‑1 (MQ=255) gCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTg > 6:92562/1‑149 (MQ=255) ccAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCGGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTgg < 3:102962/149‑1 (MQ=255) ccAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTgg > 6:11214/1‑149 (MQ=255) tGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCg < 6:367462/106‑1 (MQ=255) tGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCg > 5:367462/1‑106 (MQ=255) tGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCa < 7:203447/149‑1 (MQ=255) ccTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAg < 6:255490/148‑1 (MQ=255) aCGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTcc > 8:335674/1‑149 (MQ=255) aCGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTcc < 4:276981/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCt < 2:297386/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgccgc < 3:165855/123‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgccgc > 4:165855/1‑123 (MQ=255) ccAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTg < 5:11214/149‑1 (MQ=255) aGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGAt < 8:169228/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTGACTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATgcg < 1:80845/149‑1 (MQ=255) tGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCa > 5:22780/1‑148 (MQ=255) gTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTTAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCa < 6:237507/149‑1 (MQ=255) 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atgatCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTc < 7:100139/149‑1 (MQ=255) tgatCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCa < 3:175431/149‑1 (MQ=255) ctgccaccctggcggtactgggctttcagcaaccgcggcgggtgTCAGCCACCTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCATGCTTCGCATCAAGTc > 5:18453‑M2/45‑148 (MQ=255) ctgacaccctggcggtactgggctttcagcaaccgcggcgggtgTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgccgc < 4:301056‑M2/64‑1 (MQ=255) ctgacaccctggcggtactgggctttcagcaaccgcggcgggtgTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTcgccgc > 3:301056‑M2/45‑108 (MQ=255) gatCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCAt > 3:189236/1‑149 (MQ=255) CCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGcac > 6:6812‑M1/1‑149 (MQ=255) CCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGcaca > 4:23903‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGca < 6:225131‑M1/146‑1 (MQ=255) CGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCCCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGcaca > 5:225131‑M1/1‑148 (MQ=255) gccgcGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGt > 4:348516/1‑149 (MQ=255) gccgcGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGCGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGt < 2:85433/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGt > 6:160595/1‑148 (MQ=255) gCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTcac > 5:251599/1‑148 (MQ=255) tGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAgg < 1:313308/105‑1 (MQ=255) tGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAgg > 2:313308/1‑105 (MQ=255) gAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCaccacc > 6:254474/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTcaccac < 3:109529/147‑1 (MQ=255) aGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGaa < 8:153303/149‑1 (MQ=255) cAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGAACg > 1:243549/1‑147 (MQ=255) aGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCTGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGACATCCAACAGTGCAGTCACCACCGAACGCAg > 4:273873/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAAc < 7:305990/80‑1 (MQ=255) ccAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAAc > 8:305990/1‑80 (MQ=255) gggtgTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGAACGCAGCGCATCgcgc < 5:92562‑M2/144‑1 (MQ=255) ggtgTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGAACGCAGCGCATCGCGcc > 6:344844‑M2/5‑149 (MQ=255) | AGGCTTCCACGTACAACAGAGCCCCCGCCACATCCATCAACACCGCGTCGTCCACCGCCCGCTCGCCCTGAGCCAATGCCTGCAACGCCAGCACCTGGTCGATGATCACCCGCCGCGGTTGCTGAAAGCCCAGTACCGCCAGGGTGTCAGCCACGTGGCGCAACGGCGCCAACAGCGCATCGAGCTGTTCGCGGTG‑CTGACGGTCGCCGCGCCCGAACTGGTCCAGGCGCTCCTTGATGCGCATCAAGTCATCGCACAGTGCAGTCACCACCGAACGCAGCGCATCGCGCC > NC_002947/5686076‑5686366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |