New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1780066 | 34 (0.490) | 13 (0.200) | 11/272 | 2.6 | 29.8% | intergenic (+25/+81) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
? | NC_002947 | 1780129 = | 29 (0.440) | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
GCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGC‑TGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGC > NC_002947/1779925‑1780209 | gcgcAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgccc < 6:280579‑M1/147‑6 (MQ=255) gCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCGGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaa < 7:336152‑M1/147‑11 (MQ=255) ggTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCca < 8:111868/147‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGGAAAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGAGGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCATGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTccgtga < 8:252164/147‑5 (MQ=255) ttGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCcaca < 1:166667/147‑1 (MQ=255) ttGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGGGGGGGATGAGGGGGTGCGGCAAGTACTGGGGGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCcaca < 8:197372/147‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTACCCCAg > 3:367251/1‑147 (MQ=255) cTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttga > 5:156911‑M1/1‑127 (MQ=255) tGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGCCCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTa > 4:242404/1‑144 (MQ=255) tGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTa > 4:247254/1‑144 (MQ=255) tGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTa < 3:247254/144‑1 (MQ=255) tGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTa < 3:242404/144‑1 (MQ=255) tACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcg > 5:175631/1‑147 (MQ=255) aCAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTActgcg < 3:104070/146‑1 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACtgcgctgcgc < 3:229845/147‑1 (MQ=255) cTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACtgcgctgcgc > 5:344822/1‑147 (MQ=255) gCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTACCACAGGTACTgcgcggcgct > 3:151963/1‑146 (MQ=255) tCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaa < 6:199983/147‑1 (MQ=255) cGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGTCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGaaa < 5:120934/147‑1 (MQ=255) cAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCa > 5:171827/1‑147 (MQ=255) gCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAgc < 8:311747/147‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgc > 5:284296‑M1/1‑105 (MQ=255) aCCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAACAgacc > 5:349411/1‑144 (MQ=255) cTGGTGGGGGATGCGGTGGTGCGGCAAGTACGGGGGGCGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGC‑Tg < 8:263451/147‑1 (MQ=255) cTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCAGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGACTGGCCAGAGCGTGAAATTAGCGC‑t > 3:101809/1‑146 (MQ=255) tggtggGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaat < 6:284296‑M1/147‑46 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGACATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaa < 8:138276‑M1/141‑45 (MQ=255) ggggATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGACATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaa > 7:138276‑M1/1‑97 (MQ=255) ggATGTGGTGGTGCGGCATTTACTGGGTGCCGGTGATATGTGTGAGGCTAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGTCCCTATCATGGCCCTTCACGGGCGCGCGGGCTCCGACAGGTACTGCGCTGCGCTTGATATCAGCGC‑TGTACCggtg < 2:41654/147‑1 (MQ=255) gATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCTC‑TGTACCTGTgg < 6:201351/147‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTTCGCTTCGCGTGGAATGAGCGC‑TGTAACggtgaaatc > 1:139333/1‑142 (MQ=255) cAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaatgcgctc > 8:254714‑M1/1‑79 (MQ=255) cAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaatgcgctc < 7:254714‑M1/130‑52 (MQ=255) aGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTACCACAGGTACTGCGCTGCGGTTGGAATCAGGGC‑TGTTCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 7:40656/1‑146 (MQ=255) aCTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCACCCAAAGGGACAGCCCGGCCCGTGTAATGA‑CGCGGGTACCATTGGGCGCGGGGGTGCCCGCGAAg > 2:135511/1‑147 (MQ=255) gTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCTGCGCTTGAAATCAGGGC‑TGTACCGGGGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAgggggg > 8:38867/1‑145 (MQ=38) gATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGC‑TGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCg > 5:374671/1‑147 (MQ=255) gagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGAGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGC‑TGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCa > 8:46981/1‑146 (MQ=255) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCAtgcccgcgaaggggttgatcagc > 6:206798‑M1/1‑48 (MQ=255) cGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCAtgcccgcgaaggggttgatcagc < 5:206798‑M1/71‑24 (MQ=255) aCCTTAGCAAGGCCCTGGGCGGGCGGGCCCGCTCCCACTGGTACTGGGGTGCTGTTTAATACAGCGT‑TTTACGGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCtt < 6:171827/146‑1 (MQ=255) cccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATGAGCGC‑TGTTCCTGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCCGCGGGTTTGCAGGAAGGCGCGAATGGGCTCCGCCCCtg > 6:381804/1‑144 (MQ=38) cTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcgagcggttttgcaggaaggcgcgaatgcgctccgccgcttcgatg > 1:268452‑M1/1‑22 (MQ=255) cTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaatgcgctccgccgcttcgatg < 2:268452‑M1/86‑65 (MQ=255) ggCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTACCACAGGTAATGCCCTGGGGTTGAAATAAGCCC‑TGTACCGGTGGGAGCGGGGCTGCCCGCGAAGGGGGTTAACAGCGGTTTTGCAGGAATGCGCGAATGCGCTACCCCCCGTCGATGCAttag > 8:103252/1‑145 (MQ=255) cgcgGGCGCGCCCGCTCCCACCGGTAAAGCGCGGTGGGTGGAATAACCGC‑TGTTCCGGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAGGGGGTGGTAACCGGTTTTGGAGGCAGGCGCGAATGCGCTCCGCCCCGTCGATGGAGTAGGCCaccc > 2:105864/1‑144 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACCGGTACTGCGCGGCGTTTTAAATCAGCGT‑TGAACGTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCgg < 6:344822/147‑1 (MQ=255) gCGtgcccgcgaaggggttgatcagcggttttgcaggaaggcgcgaatgcgctccgccgcttcgatgcattcggacagcggtgcaaccagtgccatgcgcacgcgcccggcacccgggttcaccccatccacttcacgcgacaggta > 7:8395‑M1/1‑3 (MQ=255) | GCGCAGCGGTTGGAGCTGTACAACCTGCATCGTCAGCACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGC‑TGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGC > NC_002947/1779925‑1780209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |