New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 127347 = | 51 (0.800) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 6.1% | coding (101/288 nt) | PP_0122 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 127394 = | 44 (0.730) | coding (54/288 nt) | PP_0122 | hypothetical protein |
GGCTGGTCGGATCGAATGAAATTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTCTAGCGCC > NC_002947/127200‑127494 | ggCTGGTCGGATCGAATGAAATTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGt > 2:362223/1‑149 (MQ=255) gaggggcgcttggctcatgagcagaatcaaccttttcgacgggtccggcgctagaatagccagaatcattgacgacaaagggactaggttatcatgcgcacactcaatcgcctgttactgctcggcctgttggcaaccatgcctgtcgt < 6:174345‑M1/2‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGATCGAATGAAATTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTc < 6:148475/149‑1 (MQ=255) aaTGAAATTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCgg > 6:101666/1‑149 (MQ=255) aaTTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAg > 2:145751/1‑149 (MQ=255) aacAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCAGTTTTTAGGCGTGATCTTGATCGCATACAGCAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCAGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGTCCGAGGGGGcgt > 2:325155/3‑149 (MQ=255) tCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGcgtc < 1:76411/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGcgtcg > 5:314690/1‑149 (MQ=255) tGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTcc > 6:327419/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTccgc > 5:292381/1‑149 (MQ=255) cATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTccgcc > 7:203765/1‑149 (MQ=255) cATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTccgcc > 5:174345/1‑149 (MQ=255) gcgTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAggg < 8:285423/149‑1 (MQ=255) tACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTga > 2:267403/1‑149 (MQ=255) cAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgac > 7:140830/1‑147 (MQ=255) cAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgac < 8:140830/147‑1 (MQ=255) aGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgacga > 2:395134/1‑148 (MQ=255) gAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACa < 5:327419/149‑1 (MQ=255) ctagtatagccagaatcattgacgacaaagggattaggatatcatgcgctcactcaatcggctgttactgctcggcctgttggcaaccatgcgtgtcGTCACCTCGGGATCGGGCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAg > 1:168782‑M1/98‑149 (MQ=255) aaaaTAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAg < 7:94502/149‑1 (MQ=255) aTAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgac > 4:227623/1‑141 (MQ=255) aTAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgac < 3:227623/141‑1 (MQ=255) tAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCAt > 8:72929/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCAt > 3:376096/1‑149 (MQ=255) aGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATgg < 5:101666/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGtt < 8:203765/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGcc < 1:362223/148‑1 (MQ=255) gCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGc < 2:343700/147‑1 (MQ=255) cGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCaa > 7:9832/1‑148 (MQ=255) gTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCaa > 8:175695/1‑147 (MQ=255) cGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGcc > 4:7290/1‑147 (MQ=255) ggCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAg < 3:24348/149‑1 (MQ=255) tCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTaa > 3:28867/1‑148 (MQ=255) cTTGATCGCATACAGGACGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAAc < 8:236585/148‑1 (MQ=255) gactaggttatcatgcgcacactcaatcgcctgttactgctcggcctgttggcaaccatgcctgtcGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgacga > 5:15145‑M1/67‑115 (MQ=255) gactaggttatcatgcgcacactcaatcgcctgttactgctcggcctgttggcaaccatgcctgtcGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTgacga < 6:15145‑M1/49‑1 (MQ=255) aTCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGc < 8:37408/148‑1 (MQ=255) cGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGAt > 5:58300/1‑149 (MQ=255) gCATACAGGACGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGAtt < 1:145751/149‑1 (MQ=255) gCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGAtt < 7:72929/149‑1 (MQ=255) cATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACa < 4:205154/126‑1 (MQ=255) aTACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGAtt > 1:168505/1‑147 (MQ=255) aTACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGa > 6:379711/1‑149 (MQ=255) aTACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGa < 4:376096/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAgt < 2:291072/148‑1 (MQ=255) aGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAgtgt > 4:46580/1‑149 (MQ=255) aGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGCTTTTATCGCCTTCGGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGTGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTAGCCAACAGGCCGACCAGTAAGAGCCGTTTGAgtgt < 6:45281/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTgc < 7:57051/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCtt > 4:173450/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCttt > 4:8679/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCttt < 6:314690/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCttt < 6:292381/149‑1 (MQ=255) gTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTgtcgtc < 3:7290/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGAGAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTgtc < 6:236174/140‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTgtc > 5:236174/1‑140 (MQ=255) tGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTc < 2:168505/149‑1 (MQ=255) cGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTc > 1:356225/1‑147 (MQ=255) aaTGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTCTAgc < 4:28867/149‑1 (MQ=255) aaTGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTCTAgc < 6:58300/149‑1 (MQ=255) GTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTCTAGCGcc > 7:175695‑M1/1‑148 (MQ=255) | GGCTGGTCGGATCGAATGAAATTGGCATCAGTGCCATCAGCGCGTACCAGAAAATAAGGCTTGCCGTTTTTCGGCGTGATCTTGATCGCATACAGGAAGCCGTTCTGCCGGTATTCCTGGATGGTTTTATCGCCTTCCGTGCGAATGGTCACCTCGGGATCGGCCGAGGGGGCGTCGTCCGCCGCCAGGGTGACGACAGGCATGGTTGCCAACAGGCCGAGCAGTAACAGGCGATTGAGTGTGCGCATGATAACCTAGTCCCTTTGTCGTCAATGATTCTGGCTATTCTAGCGCC > NC_002947/127200‑127494 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |