New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1462058 = | 60 (0.940) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.0% | coding (867/1458 nt) | algI | alginate O‑acetylase AlgI |
? | NC_002947 | 1462116 = | 56 (0.930) | coding (809/1458 nt) | algI | alginate O‑acetylase AlgI |
CACATGCCGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTGAAGTCGAAG > NC_002947/1461912‑1462205 | aaccccaccacgggcgatgcctggctcggcgccctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAg < 3:116805‑M1/3‑1 (MQ=255) acaTGCCGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGc > 8:123687/1‑149 (MQ=255) cccaccacgggcgatgcctggctcggcgccctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGCCa > 6:233281‑M1/144‑149 (MQ=255) tGCCGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCATTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAg < 1:279349/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAgg > 3:286832/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGt < 5:145269/149‑1 (MQ=255) gTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTc > 4:133112/1‑148 (MQ=255) gggcgatgcctggctcggcgccctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGc > 4:256428‑M1/136‑139 (MQ=255) gggcgatgcctggctcggcgccctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGc < 3:256428‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACa < 6:228345/149‑1 (MQ=255) cgcCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTg < 8:191307/149‑1 (MQ=255) gcCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGa < 3:169656/149‑1 (MQ=255) atgTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAgc < 4:286832/148‑1 (MQ=255) ggTGAAGTTTGCACCGTGCCACTGGCCGCCCAGCAGCATGGGCATGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCgccgcc < 1:166839/149‑1 (MQ=255) ggTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGcgccgc > 6:276545/1‑148 (MQ=255) cctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGCCAg > 6:318468‑M1/115‑121 (MQ=255) cctggcctacaccgcacagctgtacttcgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGCCAg < 5:318468‑M1/7‑1 (MQ=255) gTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGcgccgc > 7:215081/1‑147 (MQ=255) gTGAAGTTTGCACCGTGACACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCAAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGagacgc > 2:290924/1‑147 (MQ=255) cACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTg < 5:276545/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGc > 7:172102/1‑113 (MQ=255) ccACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGc < 8:172102/113‑1 (MQ=255) ccACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGAc < 8:184629/148‑1 (MQ=255) cacaGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTg > 5:161108/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACt > 7:15236/1‑145 (MQ=255) aGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACt < 8:15236/145‑1 (MQ=255) gccgccCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGa < 2:107575/149‑1 (MQ=255) cgacttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacgtcaagcagccctatatCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGat > 3:304397‑M1/88‑147 (MQ=255) cccAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGata > 3:276260/1‑147 (MQ=255) acttcagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAg > 1:169088‑M1/86‑149 (MQ=255) gcagcaTGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTgg < 7:53870/137‑1 (MQ=255) gcagcaTGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTgg > 8:53870/1‑137 (MQ=255) cagcggctacagcgacatggccatcggcctgggcctgatgatgggcttccgcttcatggaaaacttcaagcagccctatatCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAggg > 6:88642‑M1/82‑147 (MQ=255) gTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGaa < 7:123687/149‑1 (MQ=255) gTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTATGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGATGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGa < 1:315523/148‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAg > 3:271428/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGtttt > 7:32274/1‑149 (MQ=255) gAACAGCTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGtttt > 5:134630/1‑149 (MQ=255) aCAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTc < 4:271428/148‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGAc > 8:348504/1‑115 (MQ=255) gTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGAc < 7:348504/115‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCtt > 8:275148/1‑135 (MQ=255) gTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCtt < 7:275148/135‑1 (MQ=255) ggtaggtaTTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGCTCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTc > 4:118289/1‑139 (MQ=255) ggtaggtaTTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTc < 3:118289/139‑1 (MQ=255) gtaTTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGcc > 1:159051/1‑149 (MQ=255) gtaTTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGcc < 8:32274/149‑1 (MQ=255) gtaTTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGcc > 1:355179/1‑149 (MQ=255) ttGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCca < 4:276260/148‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTCATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCcatc > 2:177344/1‑148 (MQ=255) gCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGa > 3:138130/1‑134 (MQ=255) gCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGa < 4:138130/134‑1 (MQ=255) gCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAggg < 2:80252/102‑1 (MQ=255) gCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAggg > 1:80252/1‑102 (MQ=255) aCCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGTTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATg < 1:98158/148‑1 (MQ=255) cGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATg < 4:72055/146‑1 (MQ=255) cGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATg > 3:72055/1‑146 (MQ=255) gCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCa > 6:49769/1‑149 (MQ=255) ccgaGGGTGATGTAGAGATTGTCGCGCAGCGAGGTCGACTGGCTGATTTGCCAGCGCCGCCTGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGgctgc < 7:296432/93‑1 (MQ=255) cccAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGACGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCAt < 1:290924/149‑1 (MQ=255) cccAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATCCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTCATCGACTGGCTGATATAGGgctgc > 8:296432/1‑96 (MQ=255) ccAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATg > 3:327861/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATg < 3:133112/149‑1 (MQ=255) aCAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCg > 7:51149/1‑149 (MQ=255) cAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGc > 6:187112/1‑149 (MQ=255) aGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCt > 7:349055/1‑149 (MQ=255) aGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCt > 2:108286/1‑149 (MQ=255) aGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCt > 4:349136/1‑149 (MQ=255) gATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTg < 8:215081/149‑1 (MQ=255) aTAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGTGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTg > 4:1919/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGAGATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCCTCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTGAAGTCg > 3:264553/1‑148 (MQ=255) cgcAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTGAAGTCGaa < 6:134630/149‑1 (MQ=255) gcAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTGAAGTCGAAg < 6:161108/149‑1 (MQ=255) | CACATGCCGTGCCAGGCGCCCCAGATGATGTAGGTGAAGTTTGCACCGTGCCACAGGCCGCCCAGCAGCATGGTCAGGAACAGGTTGCGGTAGGTATTGAAGGTGCCTTTGCGGTTACCGCCCAGGGTGATGTACAGATAGTCGCGCAGCCAGGTCGACAGGCTGATATGCCAGCGCCGCCAGAACTCGGTGATCGACTGGCTGATATAGGGCTGCTTGAAGTTTTCCATGAAGCGGAAGCCCATCATCAGGCCCAGGCCGATGGCCATGTCGCTGTAGCCGCTGAAGTCGAAG > NC_002947/1461912‑1462205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |