New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4700092 = | 53 (0.830) | 5 (0.080) | 4/254 | NT | 8.9% | coding (596/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | 4700129 = | 52 (0.860) | coding (559/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
CGGCCGCGCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTT > NC_002947/4699945‑4700240 | cGGCCGCGCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGc < 7:168633/149‑1 (MQ=255) ggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGcc < 1:253716‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCCGCGCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGcc > 8:428/1‑149 (MQ=255) gtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCt > 2:360888‑M1/146‑149 (MQ=255) tcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgaactggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCTg < 3:235065‑M1/5‑1 (MQ=255) cgcAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTc > 5:130604/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCggg < 8:90169/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCGCCTCCTGGCCGTGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGc < 2:295702/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCAc < 1:292068/149‑1 (MQ=255) ggCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGAAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATAGATGGCCGCCCTTGCCTCCTCGGGCACGt > 4:32446/1‑148 (MQ=255) gcCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTacac < 6:130604/149‑1 (MQ=255) cctcctGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACAcc < 4:163300/149‑1 (MQ=255) cctcctGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCAGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACAcc > 8:132305/1‑149 (MQ=255) ctGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGc < 2:32043/149‑1 (MQ=255) cgcTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACg > 6:343150/1‑149 (MQ=255) gcTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGc < 5:76134/149‑1 (MQ=255) gATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGt > 4:316984/1‑149 (MQ=255) gtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGtt < 7:148517‑M1/40‑1 (MQ=255) tccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTc > 6:319195‑M1/109‑149 (MQ=255) tccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTc > 6:229999‑M1/109‑149 (MQ=255) gtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcg‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCtctc > 1:345091‑M1/107‑149 (MQ=255) gCCGTGGGCGAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGa < 8:273965/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGa < 1:69839/149‑1 (MQ=255) cgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaagcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGa > 8:148517‑M1/107‑149 (MQ=255) cGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGag > 3:159198/1‑148 (MQ=255) gTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGagca < 6:209968/149‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGag > 7:100975/1‑147 (MQ=255) ccAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCCGTCTGCATGTCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCATGCATTCACTCACGCGTTCGAGCAGctct > 8:329944/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCtctc > 1:256147/1‑149 (MQ=255) ggCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAgg > 1:387020/1‑127 (MQ=255) ggCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAgg < 2:387020/127‑1 (MQ=255) gACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAgg < 6:263334/148‑1 (MQ=255) tGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGAt > 6:291032/1‑149 (MQ=255) agcagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGAt < 5:343150/147‑1 (MQ=255) cagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGag > 3:122618/1‑121 (MQ=255) cagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGag < 4:122618/121‑1 (MQ=255) cagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAg > 5:119142/1‑148 (MQ=255) cggTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGc < 8:318825/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGaa < 4:159198/147‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAAc < 8:100975/148‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGc > 5:320140/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTcc > 6:2004/1‑149 (MQ=255) cTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgca < 4:280166/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgcagca > 7:295285/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAc < 2:256147/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCa < 7:428/149‑1 (MQ=255) gCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTc < 7:130296/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCa < 6:375405/148‑1 (MQ=255) gttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAggg > 5:182308/1‑149 (MQ=255) gCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgcg > 6:133923/1‑148 (MQ=255) gAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCAc > 3:57767/1‑149 (MQ=255) aaaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACt < 7:329944/149‑1 (MQ=255) aaaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTACCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCCATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACt > 1:92984/1‑149 (MQ=255) aaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACtt < 5:2004/149‑1 (MQ=255) aaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACtt < 4:318333/149‑1 (MQ=255) aaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGGGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTg > 1:124109/1‑149 (MQ=255) gCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc > 4:8192/1‑117 (MQ=255) gCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc < 3:8192/117‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGAACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCgg > 2:253716/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGTCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCATCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAAt < 3:32446/149‑1 (MQ=255) cgccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc > 6:44716/1‑149 (MQ=255) cgccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc > 7:35823/1‑149 (MQ=255) cgccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc < 6:260250/149‑1 (MQ=255) cccTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCgg < 6:182308/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGAcc > 6:302632/1‑149 (MQ=255) GCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGAcc > 3:316984‑M1/1‑147 (MQ=255) GCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCtt < 3:72186‑M1/149‑1 (MQ=255) | CGGCCGCGCAAGGCCGGCGCCTCCTGGCCGCGCTGACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTT > NC_002947/4699945‑4700240 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |