| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5482160 | 82 (1.290) | 7 (0.120) | 4/254 | NT | 8.4% | coding (86/1014 nt) | dusB | tRNA dihydrouridine synthase DusB |
| ? | NC_002947 | = 5482198 | 75 (1.240) | coding (124/1014 nt) | dusB | tRNA dihydrouridine synthase DusB | |||||
GGTATCATGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGAT > NC_002947/5482017‑5482308 | ggTATCATGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTacac < 2:7903/149‑1 (MQ=255)ggTATCATGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTacac > 7:352037/1‑149 (MQ=255) aTCATGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACACATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACttt > 6:343663/1‑149 (MQ=255) tGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCa < 3:332851/149‑1 (MQ=255) ccAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAAAACGCACTACGTAACGCCCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAgc > 1:320829/1‑149 (MQ=255) aaCCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAgcgc > 7:127625/1‑149 (MQ=255) aaCCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGACGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAgcgc > 6:259228/1‑149 (MQ=255) ccTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCACTAACAGGTATCACCTATGTCGGAGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCt > 1:36063/1‑149 (MQ=255) gAACTCCTAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGACGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCg < 6:347016/148‑1 (MQ=255) gAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCgg > 6:331021/1‑149 (MQ=255) tCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtg > 4:111014/1‑149 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGacaccaccataccggcgcccaggcgctggca > 3:349062‑M1/1‑116 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGacaccaccataccggcgcccaggcgctggca > 3:354857‑M1/1‑116 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCa < 2:334390/128‑1 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCa > 1:334390/1‑128 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggt > 5:88960/1‑149 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggt > 2:358512/1‑149 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggt > 4:199530/1‑149 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggt > 4:315331/1‑149 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggt < 2:277178/149‑1 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtgg < 7:373154/148‑1 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtgg < 2:374933/148‑1 (MQ=255) cAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtg < 3:291877/147‑1 (MQ=255) aaGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtggtg < 3:199530/149‑1 (MQ=255) gATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATggtggt < 8:352037/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGgtgt > 5:20619/1‑149 (MQ=255) ccAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGacaccaccataccggcgcccaggcgctggcaaagtgtacggaaag < 4:354857‑M1/149‑46 (MQ=255) ccAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGacaccaccataccggcgcccaggcgctggcaaagtgtacggaaag < 4:349062‑M1/149‑46 (MQ=255) ccAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt > 7:32096/1‑149 (MQ=255) ccAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt < 5:331021/149‑1 (MQ=255) ccAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt < 6:33129/149‑1 (MQ=255) cac‑aACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGTGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGAGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATg < 3:256582/149‑1 (MQ=255) cc‑aacagGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGacaccaccataccggcgcccaggcgctggcaaagtgtacggaaaggc < 1:339197‑M1/148‑48 (MQ=255) ac‑aacaGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATgg > 2:168310/1‑149 (MQ=255) ac‑aacaGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACAATTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATgg < 6:123901/149‑1 (MQ=255) caGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTATCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGGCGGAAATGGTTag < 4:237838/149‑1 (MQ=255) aGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTag > 3:371688/1‑148 (MQ=255) ggATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtg > 6:121253/1‑126 (MQ=255) ggATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTAtg < 5:121253/126‑1 (MQ=255) cTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATg > 2:66748/1‑149 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ccATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAg > 7:98650/1‑149 (MQ=255) gTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGt < 7:151112/149‑1 (MQ=255) tCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTg > 3:1433/1‑149 (MQ=255) aCGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCa > 3:352437/1‑149 (MQ=255) ggACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGa < 3:111014/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCg > 8:607/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGc > 2:97038/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGc > 6:129098/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGc > 8:337324/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGc > 5:246627/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTcggaaaggctggtccgtgaccccggccatgggcgcgaggatcaggttgttacgtagtgtgtattggccgatgcgtaccgccgacataggtgatccctgttgg < 1:339197‑M2/149‑103 (MQ=255) gCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTcggaaaggctggtccgtgaccccggccatgggcgcgaggatcaggttgttacgtagtgtgtattggccgatg < 2:194262‑M2/119‑73 (MQ=255) gCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTcggaaaggctggtccgtgaccccggccatgggcgcgaggatcaggttgttacgtagtgtgtattggccgatg > 1:194262‑M2/1‑47 (MQ=255) gCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCcg < 6:20619/149‑1 (MQ=255) ccTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGTTATGGTGGTGGCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGACTGCGCCGCTTCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCATATCGCcgg < 2:36063/149‑1 (MQ=255) cTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTcggaaaggctggtccgtgaccccggccatgggcgcgaggatcaggttgttacgtagtgtgtattggccgatgcgtaccgccgacataggtgatccctgttgtgg < 4:349062‑M2/149‑105 (MQ=255) cTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTcggaaaggctggtccgtgaccccggccatgggcgcgaggatcaggttgttacgtagtgtgtattggccgatgcgtaccgccgacataggtgatccctgttgtgg < 4:354857‑M2/149‑105 (MQ=255) tttCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCcggcg > 1:95233/1‑149 (MQ=255) tCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCcggcg < 1:66748/147‑1 (MQ=255) gTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGAt < 7:607/149‑1 (MQ=255) gTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGAt < 6:154349/149‑1 (MQ=255) | GGTATCATGCCAACCCTTTTTCGAACTCCAAGATTCGGCCCCAC‑AACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGAT > NC_002947/5482017‑5482308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |