| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5482160 | 82 (1.290) | 7 (0.120) | 4/254 | NT | 8.4% | coding (86/1014 nt) | dusB | tRNA dihydrouridine synthase DusB |
| ? | NC_002947 | = 5482198 | 75 (1.240) | coding (124/1014 nt) | dusB | tRNA dihydrouridine synthase DusB | |||||
TTCGGCCCCACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAGGCCAATGTCGA > NC_002947/5482050‑5482346 | ttCGGCCCCACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGgtgt > 5:20619/1‑149 (MQ=255) ccACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt > 7:32096/1‑149 (MQ=255) ccACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt < 6:33129/149‑1 (MQ=255) ccACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAt < 5:331021/149‑1 (MQ=255) cacaACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGTGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGAGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATg < 3:256582/149‑1 (MQ=255) acaacaGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATgg > 2:168310/1‑149 (MQ=255) acaacaGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACAATTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATgg < 6:123901/149‑1 (MQ=255) caGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTATCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGGCGGAAATGGTTag < 4:237838/149‑1 (MQ=255) aGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTag > 3:371688/1‑148 (MQ=255) cTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATg > 2:66748/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGa < 4:385197/147‑1 (MQ=255) tGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGAGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGa < 8:127625/147‑1 (MQ=255) tCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCt > 8:151112/1‑149 (MQ=255) gcggTACGCATCGGCCAATTCACAGTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGTGGTGACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCTGTATGGTGGTGTCGGAAATTGTTAG‑CAGCGACATGAGCCtgtg < 5:259228/149‑1 (MQ=255) gcggTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCtgtg < 8:32096/149‑1 (MQ=255) gcggTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCtgtg < 1:168310/149‑1 (MQ=255) cggTACGCATCGG‑CAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGc < 8:102076/142‑1 (MQ=255) cggTACGCATCGG‑CAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGc > 7:102076/1‑142 (MQ=255) 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aTACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGa < 1:59481/149‑1 (MQ=255) tACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTAAACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAAAGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAg > 1:118389/1‑149 (MQ=255) cacacTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGcc < 4:371688/149‑1 (MQ=255) cacacTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGc < 6:346653/148‑1 (MQ=255) acacTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGc < 1:106078/135‑1 (MQ=255) acacTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGc > 2:106078/1‑135 (MQ=255) acacTACGTAACAACCTGATCCTAGCGCCCATTTCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGAGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGGGTAGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCt > 1:208875/1‑149 (MQ=255) aaacaaCGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCATTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGAATGGTGGTGTCGGAAATGCTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCt > 4:324906/6‑149 (MQ=255) cacTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTg > 5:154349/1‑149 (MQ=255) cTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTgcg > 3:116633/1‑149 (MQ=255) cGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGcgcc < 3:315331/148‑1 (MQ=255) cGTAACAACCTGATCCTCGCCCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCTTAAACTTTGCCAGCGCCTGCGCGCCGGGATGGTCGTGTCGCAAAAGCTTAG‑CAGCGACATCAGCCTGTGGAACATCCGCAAGTCGAGCCAGcgcc > 5:230173/1‑148 (MQ=255) aacaacCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCAt > 6:384255/1‑149 (MQ=255) caacCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATc > 5:56848/1‑148 (MQ=255) aacCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAGCCAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGc < 1:223819/127‑1 (MQ=255) aacCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGc > 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aGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGatgatg > 7:241852/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGatgatg < 6:88960/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGTATGGTGGTGGCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTgc < 2:320829/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTgcggcg < 2:256354/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGcggcgg < 3:314292/149‑1 (MQ=255) gcaggTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGAGCAGATGATGGCTGCggcggc < 6:230173/146‑1 (MQ=255) cGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCggcggc > 4:304597/1‑147 (MQ=255) ggTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCaaa < 8:249849/149‑1 (MQ=255) tATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAgg < 7:3839/149‑1 (MQ=255) gaTGGTGGTGGCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAgg < 6:390408/148‑1 (MQ=255) tggtggTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATGCATGAAGGTGATCGCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGTTGATGGCTGCGGCGGCAAAGGc < 3:324906/148‑1 (MQ=255) tggtggTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAGGc < 5:129098/148‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAGGCCaa > 7:373205/1‑149 (MQ=255) tCGGAAATGTTTAG‑CATCGACATGAGCCTGTGGAACAGACGCAAGTCTAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGACCCACGCTCGGTGCAGATCTCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAGGCCAATGTCGa < 8:315492/149‑1 (MQ=255) | TTCGGCCCCACAACAGGGATCACCTATGTCGGCGGTACGCATCGGCCAATACACACTACGTAACAACCTGATCCTCGCGCCCATGGCCGGGGTCACGGACCAGCCTTTCCGTACACTTTGCCAGCGCCTGGGCGCCGGTATGGTGGTGTCGGAAATGGTTAG‑CAGCGACATGAGCCTGTGGAACAGCCGCAAGTCGAGCCTGCGCCGCATCCATGAAGGTGATCCCGAGCCACGCTCGGTGCAGATCGCCGGCGGCGATGCGCAGATGATGGCTGCGGCGGCAAAGGCCAATGTCGA > NC_002947/5482050‑5482346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |