New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5533581 | 70 (1.100) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.1% | coding (894/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5533633 | 58 (0.990) | coding (842/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAC > NC_002947/5533437‑5533728 | ctcACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCgg < 2:23568/146‑1 (MQ=255) ctcACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTAAAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCt > 6:303171/1‑149 (MQ=255) tcACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCtt > 3:81180/1‑149 (MQ=255) aCCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGc > 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tGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAAc < 7:259957/149‑1 (MQ=255) gTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAActcctc < 8:235626/149‑1 (MQ=255) tGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTATCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTccac > 2:228912/1‑149 (MQ=255) tGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTccac > 2:368660/1‑149 (MQ=255) cACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTccacca < 6:48112/149‑1 (MQ=255) 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tACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 8:10022/149‑1 (MQ=255) tACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 4:306691/149‑1 (MQ=255) ggTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGa > 4:304288/1‑149 (MQ=255) gtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTTCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGa > 7:239149/1‑149 (MQ=255) ggTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCatcatc < 4:81180/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTTGCGGCCTTTCGGAACTCCTCCACCTCCGCTTTGCTGTGTGGCAGGAGGCGCGGGTCGGGTCGGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGGCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCGATCATCg < 6:176245/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaac < 7:20170‑M2/148‑86 (MQ=255) ttCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaa > 1:337898‑M1/1‑10 (MQ=255) ttCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGAt < 6:252345/138‑1 (MQ=255) ttCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGAt > 5:252345/1‑138 (MQ=255) tCGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaag > 5:108857‑M1/1‑9 (MQ=255) cGGTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaag < 2:138200‑M1/148‑141 (MQ=255) ggTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaaggg < 7:10022‑M1/149‑143 (MQ=255) ggTGCCGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagg < 5:303587‑M1/148‑142 (MQ=255) ggTGCCGTCCTTGCGGAACTCCTCCACCACAGCATTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgcagctttcaatggcgcgaagtcgaccaaggg < 6:152791‑M2/149‑91 (MQ=255) gCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggc < 6:297587‑M2/147‑92 (MQ=255) ccGagccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctgtggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgag < 5:176245‑M1/149‑147 (MQ=255) ccGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgag > 7:256602‑M1/1‑3 (MQ=255) ccGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgag < 2:337898‑M1/149‑147 (MQ=255) ccGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcga < 6:244064‑M1/148‑146 (MQ=255) ccGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcga < 2:246310‑M1/148‑146 (MQ=255) ccGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgag > 8:20170‑M2/1‑55 (MQ=255) cGacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtggaggagttccgcaaggccggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgagg < 2:381054‑M1/149‑148 (MQ=255) cGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAc < 8:140553/149‑1 (MQ=255) | CTCACCCATGACGGTCTGCACCGGGTTGGCCTTGAGCCACTTGGCAGCGTCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAC > NC_002947/5533437‑5533728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |