New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5533581 | 70 (1.100) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.1% | coding (894/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5533633 | 58 (0.990) | coding (842/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
CCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCGG > NC_002947/5533487‑5533772 | ccTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcg < 2:381054‑M2/149‑3 (MQ=255) cTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcgg < 2:337898‑M2/149‑4 (MQ=255) cTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcgg > 7:256602‑M2/1‑146 (MQ=255) cTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCACAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGCTcgg < 5:176245‑M2/149‑4 (MQ=255) tCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcgg < 6:244064‑M2/148‑4 (MQ=255) tCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcgg < 2:246310‑M2/148‑4 (MQ=255) cccTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcacc < 7:10022‑M2/149‑8 (MQ=255) ccTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcacc < 5:303587‑M2/148‑8 (MQ=255) cTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccga > 5:108857‑M2/1‑140 (MQ=255) cTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccg < 2:138200‑M2/148‑9 (MQ=255) ttGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccgaa > 1:337898‑M2/1‑139 (MQ=255) ttCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAgg < 4:136691/148‑1 (MQ=255) ttCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGAGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGt > 2:284080/1‑149 (MQ=255) cGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCa > 1:52574/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGGGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCTGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGTCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGt < 1:228912/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGt > 3:132550/1‑143 (MQ=255) ttCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTa > 2:286967/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCAATTGAATGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGGGTTGGCGTACTGGGTGTAGTCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCGTCCACCACCGCCTTGCTGTGTGGCAGC‑AGGCGCGGTTCGGCACGGAAGGt < 4:132550/143‑1 (MQ=255) gcgcCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTacac < 7:290680/149‑1 (MQ=255) gcCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGc > 7:140553/1‑149 (MQ=255) ccATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGcc < 7:237315/149‑1 (MQ=255) aTTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGt > 4:359458/1‑149 (MQ=255) aTTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGt > 8:286000/1‑149 (MQ=255) aTTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGt > 5:84225/1‑149 (MQ=255) gAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCaa > 6:158548/1‑149 (MQ=255) gAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCaa > 3:306691/1‑149 (MQ=255) aaaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCaa < 2:221090/148‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑Ta < 1:138200/149‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGAGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑Ta < 1:284080/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TAtt < 1:381054/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTg > 2:24182/1‑149 (MQ=255) cAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTgc < 1:246310/149‑1 (MQ=255) agagCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGcgcc > 1:387164/1‑149 (MQ=255) agagCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGcgcc > 7:72854/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCCCCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACGGAAGGTCATGTACACGCACTCAACC‑TATAGCACGACGAcgg > 6:269673/1‑149 (MQ=255) cAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCcggcgg < 7:87608/149‑1 (MQ=255) cAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCcggcg < 6:303587/148‑1 (MQ=255) gCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTa < 5:244064/149‑1 (MQ=255) gCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCACTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGAACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTa < 7:371139/149‑1 (MQ=255) tAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACGATATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCa < 1:24182/149‑1 (MQ=255) ggCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGt < 4:380792/148‑1 (MQ=255) tACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 8:10022/149‑1 (MQ=255) tACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 4:306691/149‑1 (MQ=255) ggTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGa > 4:304288/1‑149 (MQ=255) gtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTTCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGa > 7:239149/1‑149 (MQ=255) ggTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCatcatc < 4:81180/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTTGCGGCCTTTCGGAACTCCTCCACCTCCGCTTTGCTGTGTGGCAGG‑AGGCGCGGGTCGGGTCGGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGGCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCGATCATCg < 6:176245/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaac < 7:20170‑M2/148‑86 (MQ=255) ttCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGAt > 5:252345/1‑138 (MQ=255) ttCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGAt < 6:252345/138‑1 (MQ=255) ggTGCCGTCCTTGCGGAACTCCTCCACCACAGCATTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgcagctttcaatggcgcgaagtcgaccaaggg < 6:152791‑M2/149‑91 (MQ=255) gCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggc < 6:297587‑M2/147‑92 (MQ=255) ccGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTcggcaccgaacctgagggctacaccctgtacgcctacgcttcgctgcaggctctggctgccgctttcaatggcgcgaagtcgaacaagggcgag > 8:20170‑M2/1‑55 (MQ=255) cGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAc < 8:140553/149‑1 (MQ=255) gCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGAc < 1:286967/147‑1 (MQ=255) ggAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGacac < 5:98271/103‑1 (MQ=255) ggAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGacac > 6:98271/1‑103 (MQ=255) ggAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTcc > 3:244771/1‑149 (MQ=255) ctccACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGc < 7:345688/116‑1 (MQ=255) ctccACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGc > 8:345688/1‑116 (MQ=255) tccACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGcc > 4:369069/1‑149 (MQ=255) ccaccaCCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCTCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGc < 1:262397/147‑1 (MQ=255) ccaccaCCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGc > 2:262397/1‑147 (MQ=255) caccGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCt > 2:298585/1‑149 (MQ=255) ccgcgcctgctgcCAGACAGCAAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCt > 3:290291/8‑149 (MQ=255) ccgcgcctgctgcCAGACAGCAAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑GATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGCTGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCt > 7:298077/8‑149 (MQ=255) ttGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAg > 3:326727/1‑149 (MQ=255) gCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAg < 5:158548/147‑1 (MQ=255) tGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACTCCAGTTCGTCGGTGACAATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTgg > 1:126777/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCtg < 6:18698/138‑2 (MQ=255) gTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCtg > 5:18698/1‑137 (MQ=255) tCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGc < 3:304288/148‑1 (MQ=255) gcagc‑aGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGt < 5:266768/146‑1 (MQ=255) gc‑agGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCTCAGCTGGCGTACCAGc > 7:290026/1‑149 (MQ=255) agGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACAGGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCGGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGTCGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGGTGGCGTACCATCgg < 8:72854/149‑1 (MQ=255) agGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCgg < 2:387164/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCt > 4:270872/1‑132 (MQ=255) gcgGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCt < 3:270872/132‑1 (MQ=255) | CCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGC‑AGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATGTACACGCCGTCAACG‑TATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCGG > NC_002947/5533487‑5533772 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |