New junction evidence | |||||||||||
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GCCAGGCCCGGGATGACCGCAGTGCCGCCGCGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGAACGGAATGACTGCGTGTTTGAGCATGGTGGCCTCATTGTTGTCATTTTTTGGATGAGGTGGCCTCGTGAGCCGACCTGCGGATACTTAT > NC_002947/1028513‑1028803 | gCCAGGCCCGGGATGACCGCAGTGCCGCCGCTCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGtt < 8:291610/149‑1 (MQ=255) aGGCCCGGGATGACCGCAGTGCCGCCGCGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGa < 4:367332/149‑1 (MQ=255) cGGGATGACCGCAGTGCCGCCGCGCGCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCGCGGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCgg < 3:322065/149‑1 (MQ=255) ctcaaacacgcagtcattccgttcctgctgggtgcaggcttgctcagcggcgcaccgtcggccgttgccgcatccaaccTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAg < 4:277177‑M1/55‑1 (MQ=255) ctcaaacacgcagtcattccgttcctgctgggtgcaggcttgctcagcggcgcaccgtcggccgttgccgcatccaaccTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAg > 3:277177‑M1/80‑134 (MQ=255) cGCAGTGCCGCTGCGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGcc > 2:260047/1‑148 (MQ=255) cGCAGTGCCGCCGCGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGAGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCg > 7:157441/1‑149 (MQ=255) gccgccGCGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTg > 2:124440/1‑149 (MQ=255) cgccgcGCTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCGAAAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTgc > 1:300560/1‑149 (MQ=255) gcTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTg > 7:328350/1‑149 (MQ=255) gcTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTg < 5:54977/149‑1 (MQ=255) gcTCGAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCGTCGGAGCAGAACACCAGGGTGGATGCGGC‑‑A‑CCGGCCGCCGGTGCGCCGCTg > 2:153842/1‑149 (MQ=255) gAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGa > 6:294295/1‑146 (MQ=255) gAACTGGGTCAGGCGGTTGAACACGGTCTCTGCCGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGa < 5:294295/146‑1 (MQ=255) 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ccGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGAACGGAATGACt < 6:285937/146‑1 (MQ=255) ccGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGAACGGAATGACTGCg > 3:114107/1‑149 (MQ=255) cGAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGCACTACAGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGCCCGACGGTGCGCCGCTCAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGCACGCAATCACTGCgt > 7:364195/1‑149 (MQ=255) gAGGCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGAACGGAATGACTGCgtg < 1:260047/149‑1 (MQ=255) gCATCG‑AAGTCGGTCCCGGTGGTGTACTGCCCCGGATCGAAGCCGGCCGGGCTGCCTTCGGAGCAGAACACCAGGTTGGATGCGGC‑‑A‑ACGGCCGACGGTGCGCCGCTGAGCAAGCCTGCACCCAGCAGGAACGGAATGACTGCGTGttt < 8:157441/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |