| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1200950 | 60 (0.940) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 6.1% | coding (147/432 nt) | xcpU | type II secretion pathway protein XcpU |
| ? | NC_002947 | = 1200974 | 66 (1.070) | coding (171/432 nt) | xcpU | type II secretion pathway protein XcpU | |||||
CTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCG > NC_002947/1200828‑1201122 | cTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATgc < 2:176503‑M2/149‑3 (MQ=255) tCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCTAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCgggg < 3:91053/149‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGACCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGc > 1:352555/1‑148 (MQ=255) ctgGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCACCTgcg > 4:234009/1‑149 (MQ=255) gtggtgTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCgg < 4:157174/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCgg > 2:147306/1‑149 (MQ=255) tggtgTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCggg > 5:152346/1‑149 (MQ=255) tggtgTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCggg > 1:147694/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGtt > 3:282841/1‑149 (MQ=255) tgtTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTg < 8:54824/149‑1 (MQ=255) ggCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCt > 4:60243/1‑149 (MQ=255) ggCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCt > 6:339295/1‑149 (MQ=255) gCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCt < 1:147306/148‑1 (MQ=255) gCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTg < 2:152018/149‑1 (MQ=255) tATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCACCGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTgg > 6:317208/1‑148 (MQ=255) gCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATg < 1:101254/148‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATg < 2:382111/148‑1 (MQ=255) ccGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGc < 8:280670/149‑1 (MQ=255) atgaCCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGAcc > 3:177237/1‑149 (MQ=255) gaCCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCg > 3:287377/1‑148 (MQ=255) aCCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCg > 4:149992/1‑147 (MQ=255) cGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGt < 1:176503/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTccg > 3:304685/1‑149 (MQ=255) ccggccTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAg < 3:60243/149‑1 (MQ=255) ccggccTGGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAg < 8:104995/149‑1 (MQ=255) cggccTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTc < 7:338922/136‑1 (MQ=255) cggccTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTc > 8:338922/1‑136 (MQ=255) gccTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAggg > 2:18265/1‑148 (MQ=255) ggCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATg < 2:147694/148‑1 (MQ=255) ggCAACGGCCAGGCCAGTGGCGCGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGGCCGCCGCGAGGGCAAt < 2:344927/147‑1 (MQ=255) cAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAggg > 4:87365/1‑141 (MQ=255) cAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAggg < 3:87365/141‑1 (MQ=255) cAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCt < 4:287377/149‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTg > 5:177075/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAAt < 8:306996/144‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATgagat > 7:306996/1‑145 (MQ=255) aCGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTgg < 5:339295/149‑1 (MQ=255) ggccaggccaGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGggt < 3:274281/149‑1 (MQ=255) ggccaggccaGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGggt < 4:282841/149‑1 (MQ=255) cagTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAg > 6:115020/1‑149 (MQ=255) tgtCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGGCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGTGTGGTCGAAGCgg < 4:8289/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGAGCTGGAATGGCCAGCGACCGAATTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGTTTGTAGAAGCGGtaac > 2:353209/1‑146 (MQ=255) gCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGc > 6:189558/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGc > 3:97024/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCg > 5:324758/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGAATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCgg > 5:273693/1‑149 (MQ=255) cAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTg < 6:152346/149‑1 (MQ=255) cAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTg < 7:27778/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGc > 6:113792/1‑149 (MQ=255) cGGTCAAGGTCCGCGACCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGc < 2:352555/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCt > 5:64072/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATgcggaccttgaccgccagccgttgcagggcctgctcgacactggcctggccgttgccaaggccggccaccgccagcccggtcatcagcccggcgatagccaacaccaccagc > 8:279256‑M2/1‑34 (MQ=255) cAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATgcggaccttgaccgccagccgttgcagggcctgctcgacactggcctggccgttgccaaggccggccaccgccagcccggtcatcagcccggcgatagccaacaccaccagc < 7:279256‑M2/146‑113 (MQ=255) aaGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCa > 6:100235/1‑149 (MQ=255) aGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATgcggaccttgaccgccagccgttgcagggcctgctcgacactggcctggccgttgccaaggccggccaccgccagcccggtcatcagcccggcgatagccaacaccaccagcagctc < 2:1238‑M2/149‑118 (MQ=255) ggTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCt > 2:218565/1‑144 (MQ=255) ggTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCt < 1:218565/144‑1 (MQ=255) ggTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCAcc > 3:238532/1‑149 (MQ=255) tCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCg > 6:115803/1‑149 (MQ=255) gcgGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGAc < 1:18265/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTg < 4:75219/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTg > 7:374116/1‑124 (MQ=255) gCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTg < 8:374116/124‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGGCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTgg < 5:317208/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGCACTGGCCCGTCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTggcc > 1:239000/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCACTGGCCCGGCATgcggaccttgaccgccagccgttgcagggcctgctcgacactggcctggccgttgccaaggccggccaccgccagcccggtcatcagcccggcgatagccaacaccaccagcagctcgatcaggctgaa > 1:1238‑M2/1‑20 (MQ=255) aGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTggccg < 5:115020/149‑1 (MQ=255) gCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTggccggc < 5:189558/149‑1 (MQ=255) ccGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTggccggcc < 6:177075/149‑1 (MQ=255) ccGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCGGGAATGGCCAGCGCCCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCGGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTggccggcc > 3:116232/1‑149 (MQ=255) tGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCg > 1:249844/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAgg > 1:10657/1‑118 (MQ=255) gCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAgg < 2:10657/118‑1 (MQ=255) aTGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACcgcgc < 4:238532/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACcgcgcg < 3:149992/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACcgcgcg > 2:163116/1‑149 (MQ=255) | CTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGCAACGGCCAGGCCAGTGTCGAGCAGGCCCTGCAACGGCTGGCGGTCAAGGTCCGCGGCCAGGCCGCACTGGCCCGGCATGCGGGGCAACTGCGCGGGTTGCGCTGGAATGGCCAGCGACCGGAGTTCGTCCGCCGCGAGGGCAATGCCTGGGTGGTCGAAGCGGTCCCGCTCGGCGACTGGCCCAAGGGCCTGCACCCGGACTGGCCGGCCAGCCCGCAACCGCGCG > NC_002947/1200828‑1201122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |