| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1499507 = | 24 (0.380) | 12 (0.190) +GCG |
9/260 | NT | 20.7% | intergenic (+84/‑80) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | = 5594166 | 70 (1.100) | intergenic (‑113/+32) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase | |||||
GATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTC > NC_002947/5594020‑5594314 | gATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAg > 2:40412/1‑149 (MQ=255) gggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTc < 3:78150/149‑1 (MQ=255) ggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTcc > 2:297174/1‑149 (MQ=255) ccaaCTGGCTGGGGCATGGCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGACGTTACGGGGCATACACCACCCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcaca < 5:316070/147‑1 (MQ=25) tgtgggtggTTGCTGTAATGGTCATGCCCGCAGTTGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg < 8:182270/146‑1 (MQ=21) aCTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAggg < 7:293234/149‑1 (MQ=255) tggctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑TCAACGGAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgggg > 8:263684/1‑147 (MQ=255) tggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAACCTGCAAATCCGGTTCCAT‑GAAACGCAGTACTTGCTTAGCCGGCAAGCCCGCTCCCACACGGTAAGGt > 7:364049/1‑149 (MQ=37) tGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCCCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGGTGCgg > 5:213378/1‑149 (MQ=255) tGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCACGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCgg > 7:187692/1‑149 (MQ=255) tGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGACAGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCACTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCgg > 7:182629/1‑149 (MQ=255) gtcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGATCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGt > 4:286016/1‑149 (MQ=255) gaatgtccatgTCCGACGTAGTCATTTTAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCTGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGtt < 8:187692/142‑1 (MQ=21) tCCGCAGGAGTGTTGTTAAGGGGCATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCCCCGCAGTGCTTGCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtgt < 1:344487/148‑1 (MQ=37) cGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTgg > 1:260016/1‑148 (MQ=255) gAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAACACCGGCCAAGCCCGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTAGCCGGCAAGCCCGCAACCCCAAGGTAAGGTGCGGCGGTTTTGACGTTGTGGTACAgc > 4:383130/1‑149 (MQ=25) tGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCACAgg > 1:340273/1‑112 (MQ=255) ttttttAAGTGCCATACACCACCTTGTGGGAGGGGGCTTGCCCGCTAACACGGTCAATGCGGGTGCATT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctgg < 4:145100/144‑1 (MQ=255) aTGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGGAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGGTTGCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCCCAGGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAgctggct > 1:354857/1‑149 (MQ=37) gTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCGTTCCCCCCCCCACCCGCCAAGCCGGTGGCCT‑GGACCCGCGTGCATGCATAGCGGGCCACCCCGCGCCCACAGGGGAAGGTGCTGCGGGTTGGAAGTTGTGGTTCACCAGGCTGc > 8:168933/1‑149 (MQ=255) aaGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCt < 2:260016/148‑1 (MQ=255) aGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTc > 4:312125/1‑149 (MQ=255) tGGCATACACCACCGTGTGGGTGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGAAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTGGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCt < 7:168933/149‑1 (MQ=37) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCCGCAAAGCCCGTGCCCT‑GCACCGCAGTGCTTTCTTAGCGGGCAAGCCCGCGACCACCGGGTAAGGTGCTGCGGttt > 6:116274/1‑117 (MQ=25) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTGGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGttt < 5:116274/117‑1 (MQ=255) cATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑Gc < 3:112127/149‑1 (MQ=255) aTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCg > 1:56148/1‑149 (MQ=255) caccacCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGTGGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGaa < 8:166724/149‑1 (MQ=255) caccacCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTGCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGaa < 1:297174/149‑1 (MQ=255) accaccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAAc < 7:263684/149‑1 (MQ=255) caccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCg > 2:91471/1‑149 (MQ=255) accCTGTGTGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAAGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGc > 6:182946/1‑149 (MQ=255) gggAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGcc > 1:74693/1‑149 (MQ=255) gtgCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGTGCCAG‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTATGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGc < 5:128721/147‑1 (MQ=255) gAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGc < 5:355306/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCt > 6:280755/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 6:40897/1‑148 (MQ=255) gCCCGCGAACACGGGCAACCCGGGGGCATT‑CCACCGCTGTGCTGGCTTGGCGGTCATGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGc < 8:160625/149‑1 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccaccgactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactccct < 5:78080‑M2/147‑94 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCATTCGTG‑GCGGAACCGATCGGCCTGATCACGCATGCCt > 1:195689/1‑149 (MQ=255) cgcgAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactccct < 3:249817‑M2/146‑94 (MQ=255) cgcgAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCGGCCTTCCTGTGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCt < 1:40412/149‑1 (MQ=255) ctaaCACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCCCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGc < 6:213378/147‑1 (MQ=255) aaCACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTc < 5:280755/149‑1 (MQ=255) cacCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCgc > 4:64515/1‑148 (MQ=255) acCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGTGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAc > 8:150741/1‑149 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGc > 6:59676/1‑137 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGc < 5:59676/137‑1 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAcc > 6:252537/1‑148 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAcc < 5:252537/148‑1 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCg > 2:306326/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTGTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACAGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAcagg > 3:44277/1‑146 (MQ=255) aaaGCCGGTGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTG‑TTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgtttttt > 1:337308‑M2/1‑39 (MQ=255) aaaGCCGGTGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTG‑TTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgtttttt < 2:337308‑M2/103‑65 (MQ=255) aaGCCGGTGCCAT‑GCACCGCCGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTcaca < 3:286016/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTcaca < 8:244242/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATc > 4:252048/1‑148 (MQ=255) cGGTGCCAT‑CCACCGCAGTGCGTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCa < 5:318569/149‑1 (MQ=255) gTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCACTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACg > 8:17933/1‑149 (MQ=255) tGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccaccgactgattgccattaagcgggcctctcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctga > 6:78080‑M2/1‑32 (MQ=255) tGCCAT‑GCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctga > 3:136600‑M2/1‑32 (MQ=255) gCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGc < 7:161597/149‑1 (MQ=255) ccAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGcc < 1:306326/149‑1 (MQ=255) cAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGCACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCt > 4:299736/1‑149 (MQ=255) cAT‑GCACAGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCt > 7:257389/1‑149 (MQ=255) t‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGa > 1:242969/1‑129 (MQ=255) t‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGa < 2:242969/129‑1 (MQ=255) t‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCACTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCg < 7:17933/149‑1 (MQ=255) gCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAAcc > 6:192659/1‑98 (MQ=255) gCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAAcc < 5:192659/98‑1 (MQ=255) aCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATc > 2:111768/1‑149 (MQ=255) cattgcttgctTCGCGGCCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTgg < 2:354857/146‑1 (MQ=255) gTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCa < 5:40897/149‑1 (MQ=255) gccggtgttcgcgggcAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttct < 2:179230‑M2/142‑133 (MQ=255) ccggtgttcgcgggCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttct > 2:269393‑M2/7‑16 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACTCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc > 5:292796/1‑148 (MQ=255) cggtgttcgcggGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgct < 1:70937‑M2/112‑103 (MQ=255) cggtgttcgcggGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgct > 2:70937‑M2/6‑15 (MQ=255) gcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACTCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTa < 1:91471/148‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTc > 2:33476/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGAACTTGGCAGCGTACt > 3:133340/1‑148 (MQ=255) gcgGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttcttccatgacgc > 4:79953‑M2/1‑7 (MQ=255) cgGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttcttccatgacgcg > 1:179230‑M2/1‑6 (MQ=255) gggCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttattccatgacgcgg < 7:47276‑M2/149‑145 (MQ=255) gCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttcttccatgacgcggcg < 2:389974‑M2/149‑147 (MQ=255) gCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACt < 8:257389/149‑1 (MQ=255) acgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttcttccatgacgcggcgca > 6:204001‑M2/1‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTc < 6:292796/149‑1 (MQ=255) | GATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAT‑GCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTG‑GCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTC > NC_002947/5594020‑5594314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |