New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3164634 | 48 (0.760) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 6.0% | coding (145/1083 nt) | PP_2779 | putative Beta‑ketoacyl synthase |
? | NC_002947 | = 3164662 | 47 (0.760) | coding (173/1083 nt) | PP_2779 | putative Beta‑ketoacyl synthase |
GTTTATATCACTGCGGCGTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGCTGCCATTCCGGAAGTGGATGGCCCCAG > NC_002947/3164514‑3164809 | gTTTATATCACTGCGGCGTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTa > 6:196593/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCGTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCTGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGa < 3:16499/149‑1 (MQ=255) gcgTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGACGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTc < 1:278171/149‑1 (MQ=255) cgTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTcc > 8:327973/1‑149 (MQ=255) ggTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCg > 1:310836/1‑147 (MQ=255) tCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTc > 2:257578/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTc > 7:187017/1‑147 (MQ=255) aaCGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCCCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGACCATTGTGTCGCACCGCCCGCCTTCCCCGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGa > 7:187844/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCCCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGa > 3:46900/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGcc > 4:334423/1‑149 (MQ=255) cTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGgcgc < 5:196593/148‑1 (MQ=255) aTGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGcc < 5:112860/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCct > 3:122819/1‑149 (MQ=255) gTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTgc < 3:133022/149‑1 (MQ=255) gACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTgcgc > 6:171956/1‑149 (MQ=255) aCAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTgcgc < 3:119503/148‑1 (MQ=255) tCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATTGTCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCgccggc > 1:229757/1‑149 (MQ=255) aaCCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGTGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGt < 5:22799/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGc > 5:75968/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTAGCCg > 6:258398/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGcc > 3:30223/1‑147 (MQ=255) gcAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCt > 3:335919/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTg > 3:45524/1‑149 (MQ=255) gCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTg > 6:194907/1‑149 (MQ=255) gATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCt > 4:368637/1‑149 (MQ=255) tt‑tCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGGCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTgg < 8:187017/149‑1 (MQ=255) tt‑tCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTg > 5:359349/1‑148 (MQ=255) tCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGa < 4:46900/148‑1 (MQ=255) tCGACCCGGCACGCCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGa < 8:187844/148‑1 (MQ=255) cGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAg < 3:334423/148‑1 (MQ=255) gACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGATCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTg < 8:154971/144‑1 (MQ=255) gACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGATCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTg > 7:154971/1‑144 (MQ=255) cccGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTTTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGc < 4:83435/149‑1 (MQ=255) cccGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGc < 2:310836/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGc < 3:368637/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGc < 3:333552/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGc < 4:30223/149‑1 (MQ=255) gCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTAcgacacaatgggccagacgtgccgggtcgaaatccagcggttgcgcggcctgaggttgactgtcacgaggcgcacattcagtaccggcagcgttga < 6:156431‑M2/137‑97 (MQ=255) gCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTAcgacacaatgggccagacgtgccgggtcgaaatccagcggttgcgcggcctgaggttgactgtcacgaggcgcacattcagtaccggcagcgttga > 5:156431‑M2/1‑41 (MQ=255) gCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGa < 2:387733/148‑1 (MQ=255) gCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGa < 6:75968/148‑1 (MQ=255) gCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGAt < 2:229757/149‑1 (MQ=255) cccATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATc > 5:224927/1‑149 (MQ=255) aTTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTAcgacacaatgggccagacgtgccgggtcgaaatccagcggttgcgcggcctgaggttgactgtcacgaggcgcacattcagtaccggcagcgttgagtaccgacgccgcagt < 8:53578‑M2/149‑113 (MQ=255) aTTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCa < 1:257578/149‑1 (MQ=255) gtCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGAc > 7:10771/1‑149 (MQ=255) tCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGtctc < 6:223650/98‑1 (MQ=255) tCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGtctc > 5:223650/1‑98 (MQ=255) gCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGc > 5:213290/1‑149 (MQ=255) cgccTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGCTGCCATTc < 6:213290/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGCTGCCATTCCGGAAGTGGATgg > 7:106941/1‑149 (MQ=255) tACGACCGGAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGGCCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGCTGCCCTTCCGGAAGTGGATGGccgcgg > 8:247783/1‑145 (MQ=255) tACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGCGCGGATCGCATTGACCGCTGGCATTCCGGTAGTGGATGGCCGCAg > 4:38109/1‑149 (MQ=255) | GTTTATATCACTGCGGCGTCGGTACTCAACGCTGCCGGTACTGAATGTGCGCCTCGTGACAGTCAACCTCAGGCCGCGCAACCGCTGGATT‑TCGACCCGGCACGTCTGGCCCATTGTGTCGCAGCGCCCGCCTTGCCGGCGGGTGTGTACGACCGCAGACTGTCCCGCAGCCTCGAGCCTCAGGGCGCGCGCCTGCTGTATTGCGCCGGCCGTCTCGCCGAGACCTTGCGTGGGCTGGAGCTGCCCGACGAGCGGATCGCATTGACCGCTGCCATTCCGGAAGTGGATGGCCCCAG > NC_002947/3164514‑3164809 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |