New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3446911 | 55 (0.870) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 5.6% | coding (225/552 nt) | PP_3066 | lytic enzyme |
? | NC_002947 | = 3446953 | 48 (0.780) | coding (267/552 nt) | PP_3066 | lytic enzyme |
CCGCGTTTCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGATGTCCGCCGGCTGG > NC_002947/3446811‑3447100 | ccGCGTTTCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGctc > 4:113857/1‑149 (MQ=255) ccGCGTTTCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGctc > 7:200038/1‑149 (MQ=255) ccGCGTTTCTCGCCCAGATCAGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGctc > 8:321602/1‑149 (MQ=255) gcgTTTCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTa < 1:264104/149‑1 (MQ=255) tttCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcg > 5:256648/1‑149 (MQ=255) ctcGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcgtg < 8:145144/148‑1 (MQ=255) tcGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcgtggt > 3:161376/1‑149 (MQ=255) gCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcgtggtcg > 5:140730/1‑149 (MQ=255) gCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcgtggtcg > 5:269273/1‑149 (MQ=255) cccAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTAtcgtggtcgt < 3:113857/149‑1 (MQ=255) aGATCGGTCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTg‑gg < 6:140730/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCTGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGc < 2:233718/149‑1 (MQ=255) aTCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCt < 8:280216/149‑1 (MQ=255) aTGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAg < 2:388690/149‑1 (MQ=255) aGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGt < 6:159213/148‑1 (MQ=255) aGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGt < 7:321602/148‑1 (MQ=255) ggTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACggg < 6:55821/149‑1 (MQ=255) ttGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGCCGGGCCGCtt > 6:30615/1‑149 (MQ=255) ttGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACAGGCAGGCTGGCTGAGCGCCTGGGAAACACGCCCTAAGCAGATGGCGATTGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCtt > 3:311683/1‑149 (MQ=255) tgcgtgAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAg < 6:256648/149‑1 (MQ=255) gcgtgAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGAAGGGCCGCTTCAATTACGAgg > 5:259633/1‑149 (MQ=255) ttGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCACGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGc > 4:30072/1‑149 (MQ=255) gCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCaa < 5:195184/130‑1 (MQ=255) gCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCaa > 6:195184/1‑130 (MQ=255) gCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAg < 3:30072/149‑1 (MQ=255) aaTGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGc > 4:97455/1‑149 (MQ=255) aTGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGTCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGct > 1:160817/1‑149 (MQ=255) tGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGCGGGCTGCAGCGAgggtg > 4:95095/1‑146 (MQ=255) tGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGctc < 5:354763/149‑1 (MQ=255) aCAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTGAGCTCTATCGTGGTCGAGAGGATTATCAAGGTGCCGGGCCGATGAAATTACGAGGCATGAAGCGAGGctct > 1:126848/1‑149 (MQ=255) aaGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCACCTCTATCGTGCTCGTG‑GGCTTATCCAGGAGACGGGCCGCTTCAATTACGAAGCCTGCAGCGAGGCTCTGtt > 7:161640/1‑149 (MQ=255) gTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCg < 3:96012/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACg > 3:319642/1‑149 (MQ=255) gAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTc > 6:212502/1‑149 (MQ=255) gTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTC‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGcc > 2:373073/1‑149 (MQ=255) gACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACTCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCt < 8:200038/149‑1 (MQ=255) gACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGc > 5:89515/1‑148 (MQ=255) gACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCt < 4:161376/149‑1 (MQ=255) cacCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTc > 7:75309/1‑148 (MQ=255) cggcTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTcagccggccggtgtcgtacttcgacaggtacttgtcattgccaagctcacgcacgtactgcaactgacccgactcatgcccgatctgggcgagaaacgcgg > 5:199321‑M2/1‑48 (MQ=255) cggcTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTcagccggccggtgtcgtacttcgacaggtacttgtcattgccaagctcacgcacgtactgcaactgacccgactcatgcccgatctgggcgagaaacgcgg < 6:199321‑M2/149‑102 (MQ=255) gctggctgAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTcagccggccggtgtcgtacttcgacaggtacttgtcattgccaagctcacgcacgtactgcaactgacccgactcatgcccgatctgggcgagaaacgcggc < 7:356164‑M2/148‑103 (MQ=255) ctggctgAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCaga < 6:269273/149‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAgctgct > 3:275221/1‑149 (MQ=255) cgcCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGa < 4:275221/149‑1 (MQ=255) ggCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGCGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATcc > 5:363261/1‑149 (MQ=255) acacGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGt > 5:138883/1‑148 (MQ=255) cGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCGAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTAc < 3:26156/149‑1 (MQ=255) cGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTAc < 2:126848/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCa > 4:64209/1‑149 (MQ=255) gAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGGCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCGCGAGCATCCGGTCTACGCATc < 4:319642/149‑1 (MQ=255) gCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGAt < 3:157467/149‑1 (MQ=255) aTGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGATGTcc < 8:75309/149‑1 (MQ=255) gATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCa < 6:7454/108‑1 (MQ=255) gATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCa > 5:7454/1‑108 (MQ=255) gTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGATGTCCGCCGGCTgg < 3:64209/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTCTATCGTGGTCATG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGATGTCCGCCGGCTgg > 7:373592/1‑149 (MQ=255) | CCGCGTTTCTCGCCCAGATCGGGCATGAGTCGGGTCAGTTGCAGTACGTGCGTGAGCTTGGCAATGACAAGTACCTGTCGAAGTACGACACCGGCCGGCTGGCTGAGCGCCTGGGCAACACGCCCGAAGCAGATGGCGATGGTCAGCTCTATCGTGGTCGTG‑GGCTTATCCAGGTGACGGGCCGCTTCAATTACGAGGCCTGCAGCGAGGCTCTGTTCGGTGACGGTCGCCTGCTCAATACCCCAGAGCTGCTCGAGCATCCGGTCTACGCATCGATGTCCGCCGGCTGG > NC_002947/3446811‑3447100 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |