New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3544818 | 42 (0.660) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 7.3% | coding (617/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3544850 | 36 (0.590) | coding (585/2607 nt) | PP_3130 | hypothetical protein |
GGAACGACAGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGCCCCACGTCCAGCCGCGGTT > NC_002947/3544705‑3544993 | ggAACGACAGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGGATGGCGGGGACTGCAAGGCCGACGCGCGCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGAGGTCGCCGGGCACGTTGCGCCCGGCCTTGAGATGCTGGCGGcc < 1:102418‑M2/149‑3 (MQ=255) cGACAGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGgcgc > 8:253041/1‑149 (MQ=255) gACAGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCCGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCt < 1:353031/149‑1 (MQ=255) aGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGAt < 1:179705/149‑1 (MQ=255) tCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCgg < 6:362304/149‑1 (MQ=255) ccACCGGCGAGGTGCGCCAGGCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCggg < 7:297423/149‑1 (MQ=255) gCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTg < 6:304777/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTagag < 5:79220/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCACCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGTTGATCGGGTCCTTGTagag < 6:44732/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAg < 6:186026/149‑1 (MQ=255) aGCTCGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCAAGCAg > 7:120207/1‑149 (MQ=255) gTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCg > 7:9664/1‑148 (MQ=255) tcatcaGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGa < 5:211622/149‑1 (MQ=255) tcaGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACgg < 2:102418/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCgcgc < 2:123764/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGaaa < 7:253041/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGa < 8:289080/147‑1 (MQ=255) cAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGc < 2:156907/115‑1 (MQ=255) cAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGc < 2:161605/115‑1 (MQ=255) cAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGc > 1:161605/1‑115 (MQ=255) cAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGc > 1:156907/1‑115 (MQ=255) ctcgctGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCg < 1:363435/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGGGCCGAGTTCGATGTAGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGa > 2:82153/1‑148 (MQ=255) gggCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCAt > 2:150026/1‑149 (MQ=255) ccGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGAGCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTc < 8:9664/149‑1 (MQ=255) aGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGAt < 3:99838/149‑1 (MQ=255) ttCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTc > 1:240788/1‑132 (MQ=255) ttCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTc < 2:240788/132‑1 (MQ=255) ttCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGc > 3:160433/1‑149 (MQ=255) ttCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGc > 3:44968/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGccggcgacatcgaactcggcccgacacccagcgagcgcttcggcctggcagaccccgccacctggcctgatgaccagctggactggcgcacctcgccggtggacctgtc < 2:62918‑M2/149‑110 (MQ=255) gCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGccggcgacatcgaactcggcccgacacccagcgagcgcttcggcctggcagaccccgccacctggcctgatgaccagctggactggcgcacctcgccggtggac > 1:320903‑M2/1‑37 (MQ=255) cGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGccggcgacatcgaactcggcccgacacccagcgagcgcttcggcctggcagaccccgccacctggcctgatgaccagctggactggcgcacctcgccggtggacctgtcgttcc > 1:62918‑M2/1‑35 (MQ=255) aCGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGc > 5:234994/1‑149 (MQ=255) aCGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGc < 4:160433/149‑1 (MQ=255) tGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTg > 2:241326/1‑98 (MQ=255) tGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTg < 1:241326/98‑1 (MQ=255) aGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGTGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGcc < 1:82153/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGCCCCa > 6:322978/1‑149 (MQ=255) gAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGCCCCACGTCCAGc > 1:5837/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGAt > 6:269334/1‑113 (MQ=255) aGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGAt < 5:269334/113‑1 (MQ=255) tgGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGCCCCACGTCCAGCCGCGGtt < 4:195427/149‑1 (MQ=255) | GGAACGACAGGTCCACCGGCGAGGTGCGCCAGTCCAGCTGGTCATCAGGCCAGG‑TGGCGGGGTCTGCCAGGCCGAAGCGCTCGCTGGGTGTCGGGCCGAGTTCGATGTCGCCGGTCACGTTGAGCACGGCCTTGAGCTGCTGGCGGCCGGCGCTGATCGGGTCCTTGTAGAGGAATGCACGCAGCTCGGACGGGTTGCCGCGCTCGAAATAGACCTTGGCCAGTGGCGGGTCGAAACGCATTTCGATGCGTCGCCCCTGGTCAGCCTTGCCCCACGTCCAGCCGCGGTT > NC_002947/3544705‑3544993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |