| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5864144 = | 68 (1.070) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.3% | coding (2007/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
| ? | NC_002947 | 5864222 = | 43 (0.710) | coding (1929/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase | |||||
CCTGACGAAGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGA > NC_002947/5864075‑5864364 | ccTGACGAAGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCa > 5:335079/1‑149 (MQ=255)ccTGACGAAGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCa > 7:291717/1‑149 (MQ=255) cTGACGAAGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCAt > 1:92788/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCAcc < 6:189848/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCAccc < 7:106312/149‑1 (MQ=255) ccGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGCTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCACCGCCGGGGCGTCGATGATTCCGTCACAGACCATGCCCACCCGa > 6:100872/1‑149 (MQ=255) cGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGAt > 1:1576/1‑149 (MQ=255) cGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGAt < 3:187183/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCtt < 5:235611/148‑1 (MQ=255) gcgcAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTtgt < 2:92788/148‑1 (MQ=255) aaGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCAt > 6:266710/1‑125 (MQ=255) aaGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCAt < 5:266710/125‑1 (MQ=255) accattgaggcgttgtacgcacaaggccatcgggtgggcatgGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGAcc > 7:12584‑M1/43‑121 (MQ=255) accattgaggcgttgtacgcacaaggccatcgggtgggcatgGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGAcc < 8:12584‑M1/79‑1 (MQ=255) gTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCt > 4:64903/1‑149 (MQ=255) gcgcCACATCGGCCGTCTTGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGtt < 5:62916/149‑1 (MQ=255) cacaTCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCGCCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGtttt > 6:141535/1‑147 (MQ=255) caTCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGc > 7:33294/1‑149 (MQ=255) tctcGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCCCCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggcc > 7:133993/1‑149 (MQ=255) tctcGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCGCAATGGTTTTCAGCTTGTcggcc > 6:288974/1‑149 (MQ=255) gATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg < 6:368971/146‑1 (MQ=255) gATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg < 7:66731/146‑1 (MQ=255) gATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg < 5:75082/146‑1 (MQ=255) gATGGCGGTGTAGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGTTTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGTGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCGACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg < 1:187316/146‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAgg > 5:391131/1‑149 (MQ=255) ggtcggtgacggcatcaacgacgccccggcgctggcccgcgccgaaatcggttttgccatggctgctgccggcaccgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGt < 8:12584‑M2/42‑1 (MQ=255) ggtcggtgacggcatcaacgacgccccggcgctggcccgcgccgaaatcggttttgccatggctgctgccggcaccgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGt > 7:12584‑M2/80‑121 (MQ=255) TCGGTGCCGGCAGCAGCCATTGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCTCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGcc > 5:100872‑M1/1‑149 (MQ=255) TCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGcc < 3:7390‑M1/149‑1 (MQ=255) ggtgacggcatcaacgacgccccggcgctggcccgcgccgaaatcggttttgccatggctgctgccggcaccgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCt > 7:120818‑M2/76‑149 (MQ=255) gTGCCGGCAGCAGCCATGGAAAAACCGATTTCTGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGACGTCACCGACCATGCCCAACCTATGGCCTTGTGCGTAGAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTAGGCCGGCGACAGGTTGCCCTc > 4:348992/1‑149 (MQ=255) GTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTc < 8:30772‑M1/149‑1 (MQ=255) GTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTc < 4:330659‑M1/149‑1 (MQ=255) TGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCg > 6:397690‑M1/1‑149 (MQ=255) ggCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGtt < 5:127769/138‑1 (MQ=255) ggCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGtt > 6:127769/1‑138 (MQ=255) agcCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGa < 5:257483/149‑1 (MQ=255) agcCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGa < 1:300599/149‑1 (MQ=255) aTGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTcc < 3:64903/149‑1 (MQ=255) tGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTccc < 6:335079/149‑1 (MQ=255) aCCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACgg > 5:316291/1‑149 (MQ=255) ccGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCATgg > 3:217858/1‑148 (MQ=255) tttCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGgcagc > 4:310851/1‑148 (MQ=255) cGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg < 8:226437/102‑1 (MQ=255) cGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTcggccg > 7:226437/1‑102 (MQ=255) ggCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATg < 8:291717/148‑1 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGTTGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTgc > 3:219029/1‑149 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTgc > 2:10294/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCa < 8:109953/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCTACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTgcg > 6:187535/1‑146 (MQ=255) cAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCTACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTgcg < 5:187535/146‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAg > 7:189064/1‑148 (MQ=255) cGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCg > 6:348988/1‑149 (MQ=255) ggggCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCg > 8:5846/1‑148 (MQ=255) gCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGAtt < 2:1576/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGAtt < 4:7390/149‑1 (MQ=255) gtcgtTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGc > 5:257357/1‑129 (MQ=255) gtcgtTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGc < 6:257357/129‑1 (MQ=255) gTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCa > 5:109396/1‑149 (MQ=255) accgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGt > 1:187837‑M2/7‑134 (MQ=255) accgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGt < 2:187837‑M2/128‑1 (MQ=255) accgacCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGa > 7:259348‑M2/7‑149 (MQ=255) | CCTGACGAAGGCCGGGATTTTGCGCAAGTCATCGTCCATCAGCGCCACATCGGCCGTCTCGATGGCGGTGTCGGTGCCGGCAGCAGCCATGGCAAAACCGATTTCGGCGCGGGCCAGCGCCGGGGCGTCGTTGATGCCGTCACCGACCATGCCCACCCGATGGCCTTGTGCGTACAACGCCTCAATGGTTTTCAGCTTGTCGGCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGA > NC_002947/5864075‑5864364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |