New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6059891 | 56 (0.880) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.6% | coding (931/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
? | NC_002947 | = 6059929 | 47 (0.770) | coding (969/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
ACCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGTGCC > NC_002947/6059783‑6060076 | aCCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCTCTTCAGTTTAAGCCTTACTGGAAACAATAGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTAct > 8:97638‑M2/1‑147 (MQ=255) attgAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCCCCCCCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGCCTGAC‑CTACCTGGACGGGCTActg < 6:98429‑M2/147‑4 (MQ=255) tGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTActgcac > 7:344518‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACt > 7:63374/1‑149 (MQ=255) aCCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCg < 5:92731/149‑1 (MQ=255) aCCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCg > 1:275364/1‑149 (MQ=255) aaaGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTa > 3:20926/1‑149 (MQ=255) aaGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTAc > 1:152893/1‑149 (MQ=255) cAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctg > 6:231198/1‑147 (MQ=255) aaCCGCAGCATGCCACTGAATACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctgctg < 4:20926/149‑1 (MQ=255) aaCCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACAGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctgctg > 4:197802/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctgctgc < 5:212236/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTgg > 8:241305/1‑149 (MQ=255) agGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCAc < 3:197802/149‑1 (MQ=255) agGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCAc < 7:241305/149‑1 (MQ=255) tgaagCCTTAGTGGAAACAATAGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACgt < 4:292286/144‑1 (MQ=255) aTCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGgcgc < 1:151552/125‑1 (MQ=255) aTCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGgcgc > 2:151552/1‑125 (MQ=255) cacCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGAtt < 2:275364/145‑1 (MQ=255) acCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgccg > 5:384831/1‑149 (MQ=255) ccgccgCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgccgc > 7:86733/1‑149 (MQ=255) cgccgcGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgcc > 5:253076/1‑146 (MQ=255) cgccgcGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgcc < 6:253076/146‑1 (MQ=255) gATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTg > 3:10625/1‑149 (MQ=255) tcatcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGCC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTGCCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCCCTTCTGGCTGATTGGCCGCCACCTTGAg > 4:214097/1‑149 (MQ=255) tcatcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAg > 5:335706/1‑149 (MQ=255) tcatcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAg < 8:111901/149‑1 (MQ=255) atcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCCCTTCACGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGt > 5:10795/1‑149 (MQ=255) tcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGt > 1:232150/1‑148 (MQ=255) gAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCaa > 5:13989/1‑149 (MQ=255) aGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAAcc > 3:368799/1‑149 (MQ=255) gCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCg > 2:11323/1‑149 (MQ=255) cTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCa < 8:63374/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTc > 5:307561/1‑138 (MQ=255) aCCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTc < 6:307561/138‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCAttt > 4:352864/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCATGCCTCCTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGCGCTACTGCACAACTTCGCCTACCAGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCACGCAGATTACCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCAtttc > 6:298066/1‑147 (MQ=255) cgcgCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGaa < 2:232150/149‑1 (MQ=255) gcgcCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAAc < 6:13989/149‑1 (MQ=255) gcgcCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAAc > 3:171221/1‑149 (MQ=255) ccATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACcac < 6:362793/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCacac < 6:60646/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttggtctttgggtaggc < 1:233830‑M2/149‑103 (MQ=255) cTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAt > 7:42114/1‑149 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACGCTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttggtctttgg < 1:235421‑M2/143‑97 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttggtctttgg > 2:235421‑M2/1‑46 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAtg > 1:215280/1‑149 (MQ=255) gTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAtgtg < 3:352864/149‑1 (MQ=255) aGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGc < 5:231198/149‑1 (MQ=255) aGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGc < 1:247567/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGGACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTTTGTGGAGCAACACTTGCTgg < 6:384831/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTgg < 5:98429/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGaa > 8:78002/1‑146 (MQ=255) tGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCAGCGaa > 8:319856/1‑146 (MQ=255) ggCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACGACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAg < 2:254427/143‑1 (MQ=255) ggCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACAACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAg > 1:254427/1‑143 (MQ=255) cTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGTGc < 4:171221/149‑1 (MQ=255) cTACTGCACAACTTCGGCTACATGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGTGc > 6:341120/1‑149 (MQ=255) tACTGCACAACTTCGGCTACCTCCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCACGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCACCCCGCATTTGAACCACACCTAGGTGGAGCACCACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGTGcc > 3:94109/1‑149 (MQ=255) | ACCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGCCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGAC‑CTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGTGCC > NC_002947/6059783‑6060076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |