New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1168581 | 57 (1.030) | 6 (0.120) | 6/240 | 6.2 | 10.8% | intergenic (+98/+155) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
? | NC_002947 | = 1168654 | 50 (1.040) | intergenic (+171/+82) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCT > NC_002947/1168434‑1168717 | ggATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAg < 7:49234/149‑1 (MQ=255) ggATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAg < 7:309206/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑c < 2:333689/149‑1 (MQ=255) aaGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGc > 3:242985/1‑149 (MQ=255) gCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTc > 5:159207/1‑149 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCt < 4:201534/133‑1 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCt > 3:201534/1‑133 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCgg < 6:131607/149‑1 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCgg > 2:305398/1‑149 (MQ=255) gCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTgg > 7:110691/1‑149 (MQ=255) ctgGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGcacac < 2:360241/149‑1 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCggg > 4:152261/1‑149 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCggg > 7:260978/1‑149 (MQ=255) aaCTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCGTGGGGTATTTGCTGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGATCCTACGCACGGATCTGCGGTGGGCACCCACCGGgtgt > 6:222951/1‑149 (MQ=255) aaCTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGgtgt > 6:228297/1‑149 (MQ=255) cTGAAGACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTg > 7:353846/1‑149 (MQ=255) gAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa > 5:358455/1‑149 (MQ=255) aaaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 1:305398/148‑1 (MQ=255) aaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGaca > 5:350741/1‑148 (MQ=255) cAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAg < 6:159207/149‑1 (MQ=255) aGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCg < 2:265343/120‑1 (MQ=255) aGTGGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAgg < 1:150238/149‑1 (MQ=255) gtgtgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCAGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCg > 3:240867/1‑148 (MQ=255) tttACGGCTTGTGGGGTGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGgt > 7:316486/1‑127 (MQ=255) tttACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGtagtag > 5:96436/1‑148 (MQ=255) tttACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGtagtag > 4:297688/1‑148 (MQ=255) ggCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCAGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCgg < 4:240867/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAg < 7:354290/131‑1 (MQ=255) ttGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCg > 4:22516/1‑134 (MQ=255) ttGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCg < 3:22516/134‑1 (MQ=255) gtgGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGtt < 2:210029/147‑1 (MQ=255) tgGGGCGCTTGGGCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGTTGTTGGACACAGGCCGTAGTTGGAGCGGGTTTAc < 6:156013/149‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCggg < 6:238541/141‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCggg > 5:238541/1‑141 (MQ=255) ggCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 3:152261/149‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGTCGGCACCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 7:273856/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGGGCGGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCa < 7:118891/149‑1 (MQ=255) cccTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg > 4:95636/1‑95 (MQ=255) cccTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg < 3:95636/95‑1 (MQ=255) ccTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAg > 6:338805/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAGCCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCcaacaa > 1:265777/1‑148 (MQ=255) ccTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACaaaa > 5:118908/1‑148 (MQ=255) tGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg > 4:49826/1‑125 (MQ=255) tGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 3:49826/125‑1 (MQ=255) gggTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGc < 3:297688/149‑1 (MQ=255) ttGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCAt > 3:9284/1‑149 (MQ=255) tGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCAt < 6:350741/148‑1 (MQ=255) gCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATc > 5:10334/1‑148 (MQ=255) ttGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATg > 6:209781/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCggg < 5:338805/148‑1 (MQ=255) gCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCttt > 1:23466/1‑149 (MQ=255) cccTTTCGCGGTTACA‑CCCGCTCATACGCACCTTTCTGCGTTGGGAACACACGGGGTGTTGCACACTGGCCTTTTTTGGAGGGGGTTTACCCGCTAATGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTtc < 6:118908/149‑1 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTtc > 4:313430/1‑148 (MQ=255) cTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTtct > 4:316358/1‑148 (MQ=255) gcgGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGAAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCGTTTGATGCggg > 7:368270/1‑137 (MQ=37) cgGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCggg < 4:204676/136‑1 (MQ=255) cgGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCggg > 3:204676/1‑136 (MQ=255) | GGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGA‑CCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCT > NC_002947/1168434‑1168717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |