New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 436208 = | 48 (1.140) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 5.8% | intergenic (+41/+192) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
? | NC_002947 | 436264 = | 51 (1.260) | intergenic (+97/+136) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
ATTGCTGGCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTG > NC_002947/436062‑436354 | aTTGCTGGCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAg > 1:106091/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAg > 7:72945/1‑149 (MQ=255) cgtagctgatcagaaaacgatcaaaactctgcaggtcatgtagcgcctggcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacAAgg > 8:23681‑M1/146‑149 (MQ=255) cTGGCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGcc < 7:31561/148‑1 (MQ=255) ggCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCtg > 8:76037/1‑149 (MQ=255) gTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAAcc > 2:135938/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGACCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGgt > 7:111783/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGgtg < 8:72945/148‑1 (MQ=255) gCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGgt < 2:262785/147‑1 (MQ=255) ccGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGgtgt < 7:76037/148‑1 (MQ=255) cGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTAc < 8:25747/149‑1 (MQ=255) tGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACctc > 4:48319/1‑149 (MQ=255) agaaCTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCtctc > 1:30291/1‑147 (MQ=255) aCTGCAACAGCGGCTTGAGAGCCTGGCTGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGcc < 7:91423/149‑1 (MQ=255) tGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGcc > 5:254588/1‑147 (MQ=255) cGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCAc < 1:135938/149‑1 (MQ=255) cctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGcc < 7:66695‑M1/54‑1 (MQ=255) gagaGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCt < 4:230906/149‑1 (MQ=255) agatacatctacataggttattcacaccctcgtccacgcgctttgtgcacaagctgcttataattgtgcttttttttagcaaaagtgtacAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTa > 8:66695‑M1/91‑149 (MQ=255) gagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTAc > 1:126006‑M1/90‑149 (MQ=255) ccTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTAc > 2:49610/1‑149 (MQ=255) tGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACgg > 3:1726/1‑149 (MQ=255) gCGGATGACTTGATTGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACgg < 4:5045/147‑1 (MQ=255) ggATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGGATCACGTGCCTTGTACGGtttt > 3:57989/1‑149 (MQ=255) gATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 5:214371/1‑149 (MQ=255) aCTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg < 3:155369/145‑1 (MQ=255) aCTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 4:155369/1‑145 (MQ=255) ttGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCaa > 8:133194/1‑148 (MQ=255) gtggAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGc > 3:80518/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGtt > 2:22272/1‑128 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGtt < 1:22272/128‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAAtt < 2:30291/149‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAAt > 5:200457/1‑148 (MQ=255) tGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg < 3:243557/124‑1 (MQ=255) tGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 4:243557/1‑124 (MQ=255) aTTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATca > 6:138811/1‑134 (MQ=255) aTTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATca < 5:138811/134‑1 (MQ=255) aGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCgg < 1:49610/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCggg > 1:133038/1‑149 (MQ=255) gtccATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCACTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCAGGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGTGACGAg < 8:111783/147‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATc < 6:251272/114‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATc > 5:251272/1‑114 (MQ=255) cTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGtgtg > 4:251675/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGcgcg < 7:122912/134‑1 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGcgcg > 8:122912/1‑134 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGa > 6:198432/1‑141 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGa < 5:198432/141‑1 (MQ=255) cGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGgtgt < 6:214371/145‑1 (MQ=255) cGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCAAGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATg > 7:64392/1‑148 (MQ=255) tCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGAt < 8:64392/148‑1 (MQ=255) tCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGAt < 4:80518/148‑1 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCt < 6:37716/75‑1 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCt > 5:37716/1‑75 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGtc > 6:77238/1‑149 (MQ=255) ggAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTg < 6:254588/149‑1 (MQ=255) | ATTGCTGGCGTTGCCGTTGACCTTGCCGCTGGAAGAACTGCAGCAGCGGCTGGAGAGCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTG > NC_002947/436062‑436354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |