New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 436208 = | 48 (1.140) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 5.8% | intergenic (+41/+192) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
? | NC_002947 | 436264 = | 51 (1.260) | intergenic (+97/+136) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
GCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTTCTGATCAGCTACG > NC_002947/436118‑436408 | agatacatctacataggttattcacaccctcgtccacgcgctttgtgcacaagctgcttataattgtgcttttttttagcaaaagtgtacAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTa > 8:66695‑M1/91‑149 (MQ=255) gagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTAc > 1:126006‑M1/90‑149 (MQ=255) ccTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTAc > 2:49610/1‑149 (MQ=255) tGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACgg > 3:1726/1‑149 (MQ=255) gCGGATGACTTGATTGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACgg < 4:5045/147‑1 (MQ=255) ggATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGGATCACGTGCCTTGTACGGtttt > 3:57989/1‑149 (MQ=255) gATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 5:214371/1‑149 (MQ=255) aCTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 4:155369/1‑145 (MQ=255) aCTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg < 3:155369/145‑1 (MQ=255) ttGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCaa > 8:133194/1‑148 (MQ=255) gtggAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGc > 3:80518/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGtt < 1:22272/128‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGtt > 2:22272/1‑128 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAAtt < 2:30291/149‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAAt > 5:200457/1‑148 (MQ=255) tGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg > 4:243557/1‑124 (MQ=255) tGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTg < 3:243557/124‑1 (MQ=255) aTTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATca > 6:138811/1‑134 (MQ=255) aTTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATca < 5:138811/134‑1 (MQ=255) aGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCgg < 1:49610/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCggg > 1:133038/1‑149 (MQ=255) gtccATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCACTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCAGGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGTGACGAg < 8:111783/147‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATc < 6:251272/114‑1 (MQ=255) tCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATc > 5:251272/1‑114 (MQ=255) cTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGtgtg > 4:251675/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGcgcg > 8:122912/1‑134 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGcgcg < 7:122912/134‑1 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGa < 5:198432/141‑1 (MQ=255) tGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGa > 6:198432/1‑141 (MQ=255) cGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGgtgt < 6:214371/145‑1 (MQ=255) cGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCAAGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATg > 7:64392/1‑148 (MQ=255) tCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGAt < 4:80518/148‑1 (MQ=255) tCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGAt < 8:64392/148‑1 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCt > 5:37716/1‑75 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCt < 6:37716/75‑1 (MQ=255) aCGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGtc > 6:77238/1‑149 (MQ=255) gtacaaggcacgtgatacctgggctggagaggtacacccccaggttatccacagggccttGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGtctc > 1:126006‑M2/61‑149 (MQ=255) tacaaggcacgtgatacctgggctggagaggtacacccccaggttatccacagggccttGTACACTTTTGCTAAAAAAAAGCACAATTATAAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGTGGACGAGGGTGTGAATAACCTATGTAGATGTatct > 8:66695‑M2/60‑149 (MQ=255) ggAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTg < 6:254588/149‑1 (MQ=255) ggcacgtgatacctgggctggagaggtacacccccaggttatccacagggccttGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcagg < 7:66695‑M2/95‑1 (MQ=255) ccTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggc > 2:19578/1‑147 (MQ=255) cggcggATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTGTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccag < 4:57989/145‑1 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccag < 4:1726/149‑1 (MQ=255) tgGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccaggc < 7:133194/148‑1 (MQ=255) tgGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGgcg < 6:200457/149‑1 (MQ=255) tGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAc > 4:36572/1‑149 (MQ=255) gtACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCa > 1:260425/1‑147 (MQ=255) tACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCagag > 1:109639/1‑149 (MQ=255) ccTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGgt < 5:88770/93‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGgt > 6:88770/1‑93 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTATATGACCTGCAGAGTTTTGa > 8:131448/1‑149 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt < 2:133038/147‑1 (MQ=255) cAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTg < 3:36572/146‑1 (MQ=255) cAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTg < 1:19578/146‑1 (MQ=255) tATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTTCTGa > 7:126564/1‑149 (MQ=255) aTCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtt < 2:134910/133‑1 (MQ=255) aTCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtt > 1:134910/1‑133 (MQ=255) ccttGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTTCTGATCAGCTACg > 8:23681‑M2/5‑149 (MQ=255) | GCCTGGCGGATGACTTGATGGTGGAGTTGAAGCTGCGGGCAGAGGATTGATCAGCAAGCGGCCATCTGCGGTTATCCCGATATCACGGGGAAGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTTCTGATCAGCTACG > NC_002947/436118‑436408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |