New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 497023 | 60 (1.420) | 6 (0.150) | 6/242 | NT | 9.0% | coding (895/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 497096 | 65 (1.640) | coding (968/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
GGCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGT > NC_002947/496878‑497171 | ggCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGt > 6:146563/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTcag > 8:135910/1‑147 (MQ=255) aGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAgcgc < 7:91699/149‑1 (MQ=255) gAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCt > 4:85962/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgc > 2:111788‑M1/1‑131 (MQ=255) cAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGa < 3:100945/149‑1 (MQ=255) aCTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAATATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAgc > 7:82448/1‑149 (MQ=255) aGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTg < 4:238839/149‑1 (MQ=255) gcTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACCCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTg > 8:213135/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGcc < 1:258764/148‑1 (MQ=255) cAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCcgcg > 1:123512/1‑147 (MQ=255) cAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCcgcg < 2:123512/147‑1 (MQ=255) cAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCCGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCcgcgc < 2:188095/148‑1 (MQ=255) gAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGaaa < 7:213135/149‑1 (MQ=255) gAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGaaa < 7:18605/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCTGAGCGAGTCGCAGGGCTTCTGGCACAACATGGCCTTTTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttgt > 6:185290/1‑149 (MQ=255) cgcCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGa < 2:120878/149‑1 (MQ=255) gcCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAg < 1:266978/149‑1 (MQ=255) gcCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAg > 7:160668/1‑149 (MQ=255) cTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGATCATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctc > 1:150954‑M1/1‑91 (MQ=255) cGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAgg > 5:197702/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAgg < 6:197702/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTgcg > 8:20993/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgc > 7:131114‑M1/1‑80 (MQ=255) gCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAg > 7:20993‑M2/1‑148 (MQ=255) ttCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttg < 2:182361/124‑1 (MQ=255) ttCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttg > 1:182361/1‑124 (MQ=255) gCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgc < 2:150954‑M1/149‑82 (MQ=255) cAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgcc < 8:131114‑M1/149‑83 (MQ=255) aGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCgg > 5:13952/1‑149 (MQ=255) aGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCgg > 2:164378/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGc < 7:135910/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGc < 4:155507/149‑1 (MQ=255) ccTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAg > 6:140490/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgccacaccagcgtg < 1:111788‑M1/149‑94 (MQ=255) cTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGt > 1:169762/1‑149 (MQ=255) ttgttgTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGtt > 5:196573/1‑149 (MQ=255) ttgttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc < 2:169762/149‑1 (MQ=255) gttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCa > 8:40952/1‑149 (MQ=255) gtgcGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGGCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTGGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGcc < 3:166405/145‑1 (MQ=255) ttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCAt < 8:160668/149‑1 (MQ=255) ttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCAt < 5:185290/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATc > 6:75927/1‑148 (MQ=255) ggTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCg < 6:13952/148‑1 (MQ=255) gTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGa > 5:23977/1‑148 (MQ=255) tCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATc < 7:40952/149‑1 (MQ=255) tgttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGcc > 8:181865/1‑96 (MQ=255) tgttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGcc < 7:181865/96‑1 (MQ=255) gttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGcc < 8:83699/83‑1 (MQ=255) gttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGcc > 7:83699/1‑83 (MQ=255) tgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt < 2:183314/135‑1 (MQ=255) tgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt > 1:183314/1‑135 (MQ=255) tgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg < 5:75927/148‑1 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt > 5:249562/1‑148 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTa < 6:23977/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGGGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTAt < 6:249562/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATc > 4:50682/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATcc < 8:179752/149‑1 (MQ=255) ttGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCct > 8:89380/1‑149 (MQ=255) ggCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCct < 8:82448/147‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTgg > 8:37556/1‑149 (MQ=255) cACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaag < 1:111788‑M2/149‑57 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTg < 2:239982/146‑1 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTg > 1:239982/1‑146 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa > 8:221244/1‑149 (MQ=255) ggCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctg < 8:131114‑M2/149‑68 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgc < 2:150954‑M2/149‑69 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCg > 8:128703/1‑122 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCg < 7:128703/122‑1 (MQ=255) cAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAg > 4:219485/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTgg > 8:124603/1‑134 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTgg < 7:124603/134‑1 (MQ=255) ctcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaagc > 7:20993‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGT > NC_002947/496878‑497171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |