New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 595686 | 53 (1.260) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 6.8% | coding (468/1266 nt) | PP_0506 | ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 595711 | 59 (1.480) | coding (443/1266 nt) | PP_0506 | ABC transporter permease |
GCCCAGGCTGATATGCAGGGTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCACTCTGTAGCCGCGGT > NC_002947/595539‑595834 | gCCCAGGCTGATATGCAGGGTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGC > 2:63721‑M1/1‑148 (MQ=255) tGATATGCAGGGTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCtcggcgct > 3:127798‑M1/1‑140 (MQ=255) ggTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCt > 1:133405/1‑137 (MQ=255) ggTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCt < 2:133405/137‑1 (MQ=255) gTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGcc > 4:210885/1‑147 (MQ=255) ggggTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAgcactac > 8:49804‑M2/1‑142 (MQ=255) ccGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCtcggcgctgaagtggccgaggcattgcactacaagct < 4:127798‑M1/148‑38 (MQ=255) cGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑Ac > 1:243326/1‑149 (MQ=255) cGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑Ac < 2:243326/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACggg > 8:123798/1‑149 (MQ=255) cgcTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACgg > 5:13609/1‑146 (MQ=255) cgcTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACgg < 6:13609/146‑1 (MQ=255) gcTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCg > 5:25783/1‑149 (MQ=255) ttGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCtcggcgctgaagtggccgaggcattgcactacaagctgg > 2:71982‑M1/1‑102 (MQ=255) ttGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCtcggcgctgaagtggccgaggcattgcactacaagctgg < 1:71982‑M1/141‑40 (MQ=255) cGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCa > 8:128342/1‑149 (MQ=255) gACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑c < 8:248646/149‑1 (MQ=255) gACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑c < 3:175179/149‑1 (MQ=255) aCGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGccc > 2:5547/1‑149 (MQ=255) cGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGcccc > 4:48649/1‑149 (MQ=255) ggaaaaCGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCt > 4:149998/4‑149 (MQ=255) ggTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCt > 8:29163/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAACATCA‑CCCCCCTGGCt > 1:101476/1‑147 (MQ=255) gtcgtcGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGc < 7:123798/148‑1 (MQ=255) gtcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTgg > 1:155650/1‑119 (MQ=255) gtcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTgg < 2:155650/119‑1 (MQ=255) gtcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGa < 4:143176/148‑1 (MQ=255) tcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATg > 6:18313/1‑149 (MQ=255) tcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATg > 3:91482/1‑149 (MQ=255) tcgtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATg > 8:164174/1‑149 (MQ=255) gtGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGc < 5:18313/148‑1 (MQ=255) ttGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTggcg > 5:253299/1‑149 (MQ=255) gACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCt > 8:4938/1‑143 (MQ=255) gACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCt < 7:4938/143‑1 (MQ=255) cAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGGGCCGAGCACTACCTCGATGAAGGGTCGTTGG‑AAACAAACCCCCCCGGGCACAGTTGCCCATGCTggcggcg > 1:86609/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAAc > 6:185652/1‑99 (MQ=255) gCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAAc < 5:185652/99‑1 (MQ=255) gCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATg > 7:62556/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCGTGGGCCAGCAACAGCTTGTAACCAAGCTTGTAGTGCAATTCATCGGCCAATTCATCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGATCGTTGGAAAACTAA‑CGACCCTCGCTAAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTAGTGATAAtc > 2:164832/1‑148 (MQ=255) ccACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATgg > 1:84946/1‑149 (MQ=255) ccACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATgg > 7:246174/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCt > 6:181608/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCt < 3:149998/149‑1 (MQ=255) aCGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCt < 7:29163/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTg > 8:16390/1‑148 (MQ=255) gCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGa < 2:72778/149‑1 (MQ=255) cGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGc > 5:215208/1‑113 (MQ=255) cGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGc < 6:215208/113‑1 (MQ=255) cGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAg < 6:253299/149‑1 (MQ=255) cGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAg < 7:164174/149‑1 (MQ=255) cGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAg < 8:62556/149‑1 (MQ=255) cACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCgtgg < 3:210885/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCgtggt > 5:243266/1‑149 (MQ=255) gTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGcc < 8:246174/147‑1 (MQ=255) cccAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCa > 6:116028/1‑148 (MQ=255) cccAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCa < 5:116028/148‑1 (MQ=255) ccAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAgcactacaagctgggtgacaagctggtgctggcccacggcgtggccgcaatcagtctggtcaagcacgacgacaagccgtttaccgtggtcggcgtactcaa > 2:71982‑M2/1‑39 (MQ=255) ccAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAgcactacaagctgggtgacaagctggtgctggcccacggcgtggccgcaatcagtctggtcaagcacgacgacaagccgtttaccgtggtcggcgtactcaa < 1:71982‑M2/141‑103 (MQ=255) ccAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCAct > 1:263461/1‑149 (MQ=255) aGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAgcactacaagctgggtgacaagctggtgctggcccacggcgtggccgcaatcagtctggtcaagcacgacgacaagccgtttaccgtggtcggcgtactcaagcgcaccgg < 4:127798‑M2/148‑112 (MQ=255) gTAGTGCtcggcgctgaagtggccgaggcattgcactacaagctgggtgacaagctggtgctggcccacggcgtggccgcaatcagtctggtcaagcacgacgacaagccgtttaccgtggtcggcgtactcaagcgcaccggcacccc > 8:49804‑M1/1‑7 (MQ=255) gTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCACTCTGTa < 3:48649/147‑1 (MQ=255) gTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCACTCTGTAg < 5:181608/148‑1 (MQ=255) gTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCt < 6:65993/68‑1 (MQ=255) gTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCt > 5:65993/1‑68 (MQ=255) cAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCACTCTGTAGCCGCGGt > 6:235209/1‑149 (MQ=255) | GCCCAGGCTGATATGCAGGGTGCGGTCGACGGGGGTGCCGGTGCGCTTGAGTACGCCGACCACGGTAAACGGCTTGTCGTCGTGCTTGACCAGACTGATTGCGGCCACGCCGTGGGCCAGCACCAGCTTGTCACCCAGCTTGTAGTGCAATGCCTCGGCCACTTCAGCGCCGAGCACTACCTCGA‑‑ACGGGTCGTTGGCAAACTCA‑CGCCCCTGGCTCAGTTGCAGATGCTGGCGGCGGCCGTACTGATAATGGCTGAAGTAATCCGTGGTGGTGCCCATCACTCTGTAGCCGCGGT > NC_002947/595539‑595834 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |