New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1092152 | 26 (0.620) | 3 (0.080) | 3/244 | NT | 10.8% | coding (535/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1092194 | 25 (0.630) | coding (577/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
GGCGTTGTGCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCG > NC_002947/1092004‑1092296 | ggCGTTGTGCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCA > 6:38970‑M1/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTg < 3:111397/149‑1 (MQ=255) gtgCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGgt < 7:161577/148‑1 (MQ=255) gtgCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGgt < 6:123505/148‑1 (MQ=255) gTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCgg > 4:72093/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCg < 5:113679/148‑1 (MQ=255) cTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCg < 7:96674/148‑1 (MQ=255) gTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCTTCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCggggg > 3:114037/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGgccgacg > 7:49246/1‑149 (MQ=255) tCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCAggctgtcggcgtcggccatgccacccccggccga > 1:205357‑M1/1‑115 (MQ=255) tCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCAGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGgccgacgc > 2:127841/1‑149 (MQ=255) cTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGgccgacgcc < 3:13016/148‑1 (MQ=255) cGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCGTCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGgcc > 3:137516/1‑131 (MQ=255) cGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCGTCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGgcc < 4:137516/131‑1 (MQ=255) gAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGGTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCAggctgtcggcgtcggccatgccacccccggccgacacaccaatggccat < 5:163027‑M1/149‑50 (MQ=255) aGCGCTGGTGGGCACGGCAACCCACCCGGTGATTGCAGCCCCCATCTGGCTGGTCGGGATTGCCATCCTTGCCCCCAACATCCCCGAAGGTCTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATgg < 6:245411/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCAggctgtcggcgtcggccatgccacccccggccgacacaccaatggccataccttc < 2:205357‑M1/149‑56 (MQ=255) gtggGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGc < 5:242559/149‑1 (MQ=255) tggGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGgt > 6:253009/1‑95 (MQ=255) tggGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGgt < 5:253009/95‑1 (MQ=255) gCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTg < 3:163557/149‑1 (MQ=255) aCGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCa < 7:53866/149‑1 (MQ=255) ggCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGTGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAgg < 1:127841/149‑1 (MQ=255) ggCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAg > 6:272287/1‑148 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGc < 5:26109/149‑1 (MQ=255) gTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAggg > 5:20726/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCTGTTCGTGATTGCCTTCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCt < 4:114037/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTTGTGTGTCGGCCGTGGGTGGGATGGCAGACGCCGACAGGCTGGCCATGTGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGTCTGGTGATCGCGCt < 4:225685/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCAGTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTgg > 2:158012/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTg < 6:103501/145‑1 (MQ=255) gTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAg < 5:51973/148‑1 (MQ=255) ccATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGgggcggg > 2:209407/1‑148 (MQ=255) atTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGc < 5:272287/148‑1 (MQ=255) caacaTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATCGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTc < 1:209407/149‑1 (MQ=255) caacaTCCCCCAAGGTATGGCCATTGGGGTGCCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGTTGATCGCGCTGGTGCTGGCCGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCa < 5:38970/149‑1 (MQ=255) gAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccag < 2:205357‑M2/149‑95 (MQ=255) aTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaccagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgcttc < 5:163027‑M2/149‑101 (MQ=255) gCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCGTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGgcg > 1:191385/1‑148 (MQ=255) gCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGgcg > 3:127436/1‑148 (MQ=255) | GGCGTTGTGCCTGTTCCTGGTCGACCTCAAGGTATCCTGGGCTTCGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCG > NC_002947/1092004‑1092296 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |