New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1092152 | 26 (0.620) | 3 (0.080) | 3/244 | NT | 10.8% | coding (535/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1092194 | 25 (0.630) | coding (577/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
AGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGATCTGTGCC > NC_002947/1092055‑1092340 | aGCGCTGGTGGGCACGGCAACCCACCCGGTGATTGCAGCCCCCATCTGGCTGGTCGGGATTGCCATCCTTGCCCCCAACATCCCCGAAGGTCTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATgg < 6:245411/149‑1 (MQ=255) gtggGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGc < 5:242559/149‑1 (MQ=255) gCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTg < 3:163557/149‑1 (MQ=255) aCGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCa < 7:53866/149‑1 (MQ=255) ggCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGTGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAgg < 1:127841/149‑1 (MQ=255) ggCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAg > 6:272287/1‑148 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGc < 5:26109/149‑1 (MQ=255) gTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAggg > 5:20726/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCTGTTCGTGATTGCCTTCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCt < 4:114037/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTTGTGTGTCGGCCGTGGGTGGGATGGCAGACGCCGACAGGCTGGCCATGTGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGTCTGGTGATCGCGCt < 4:225685/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCAGTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTgg > 2:158012/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTg < 6:103501/145‑1 (MQ=255) gTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAg < 5:51973/148‑1 (MQ=255) ccATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGgggcggg > 2:209407/1‑148 (MQ=255) atTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGc < 5:272287/148‑1 (MQ=255) caacaTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATCGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTc < 1:209407/149‑1 (MQ=255) caacaTCCCCCAAGGTATGGCCATTGGGGTGCCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGTTGATCGCGCTGGTGCTGGCCGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCa < 5:38970/149‑1 (MQ=255) gAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccag < 2:205357‑M2/149‑95 (MQ=255) aTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaccagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgcttc < 5:163027‑M2/149‑101 (MQ=255) gCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCGTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGgcg > 1:191385/1‑148 (MQ=255) gCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGgcg > 3:127436/1‑148 (MQ=255) gtgtgtCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCt > 7:229495/1‑147 (MQ=255) tCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgcttccggcgaagcccagga > 1:205357‑M2/1‑34 (MQ=255) gCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGcc < 7:203533/120‑1 (MQ=255) gCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGcc > 8:203533/1‑120 (MQ=255) ccgacgccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGgcggcg < 6:20726/149‑1 (MQ=255) cgacgccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGt > 5:82935/1‑149 (MQ=255) gacgccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGtt < 6:82935/149‑1 (MQ=255) gccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGAt < 3:72093/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCCATGTGCATTGACTTTCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGATCTGTGcc < 8:49246/149‑1 (MQ=255) | AGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGAT‑GTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGATCTGTGCC > NC_002947/1092055‑1092340 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |