New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1521404 | 51 (1.210) | 5 (0.120) | 5/248 | NT | 9.5% | coding (661/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
? | NC_002947 | = 1521433 | 46 (1.130) | coding (690/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
CACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCAGACGCTGATGCCGGC > NC_002947/1521259‑1521543 | cACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGccc > 1:138364/1‑149 (MQ=255) cACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGccc > 2:216013/1‑149 (MQ=255) aCCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGa < 2:68119/147‑1 (MQ=255) aCCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgc > 6:262229/1‑149 (MQ=255) cAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccg < 6:248596/149‑1 (MQ=255) cTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGgccttccaccgg > 6:166580‑M1/1‑136 (MQ=255) cTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccggcc > 4:262484/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCg < 2:78048/149‑1 (MQ=255) cGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCgg < 5:171227/149‑1 (MQ=255) gTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAATACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTATTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTgg < 1:216013/149‑1 (MQ=255) gTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTgg > 7:78363/1‑148 (MQ=255) gTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTgg > 7:82247/1‑148 (MQ=255) gAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAgg > 4:147004/1‑138 (MQ=255) gAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAgg < 3:147004/138‑1 (MQ=255) gAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCt > 3:237466/1‑149 (MQ=255) aaCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGgccttccaccggcagcggccggctcagggcgtcctggcg < 2:194682‑M1/148‑40 (MQ=255) aaCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGgccttccaccggcagcggccggctcagggcgtcctgg < 5:166580‑M1/146‑38 (MQ=255) aCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGgccttccaccggcagcggccggctcagggcgtcctggc < 5:171358‑M1/146‑39 (MQ=255) aCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGgccttccaccggcagcggccggctcagggcgtcctggc > 6:171358‑M1/1‑108 (MQ=255) aGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCtt < 8:82247/149‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCtt < 8:78363/149‑1 (MQ=255) cGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCg < 7:146485/149‑1 (MQ=255) cacaTGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCaa > 6:166871/1‑149 (MQ=255) tGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAAcccg > 2:165023/1‑149 (MQ=255) aCCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAAcccgccc > 6:1032/1‑149 (MQ=255) cGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGa < 5:1032/149‑1 (MQ=255) cTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCTCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACt > 8:25201/1‑149 (MQ=255) tataGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACtt > 6:205412/1‑149 (MQ=255) ataGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACAGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACtt > 3:58283/1‑148 (MQ=255) taGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTACCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTc < 5:107909/148‑1 (MQ=255) cGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAg < 5:262229/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGc < 1:165023/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCGGCCCGACTTCAAAGCGttt < 4:58283/147‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGttt < 2:17452/147‑1 (MQ=255) ccGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGttt < 2:21626/147‑1 (MQ=255) ggCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGcc > 1:81106/1‑149 (MQ=255) ccaccTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTg < 4:237466/149‑1 (MQ=255) caccTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTAGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTGGGCCTGAGtt > 8:107932/1‑147 (MQ=255) accTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCGAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGaa < 5:205412/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCgat > 1:227217/1‑133 (MQ=255) ccTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGtt < 2:227217/135‑1 (MQ=255) gCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGa > 5:205729/1‑149 (MQ=255) ccGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTgag > 2:61166/1‑148 (MQ=255) tt‑ttCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATAc < 2:138364/149‑1 (MQ=255) tCCGCTGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCt < 5:166871/148‑1 (MQ=255) cccTCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGa < 6:205729/148‑1 (MQ=255) cccGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCt > 3:55841/1‑112 (MQ=255) cccGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCt < 4:55841/112‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGt > 7:238723/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTcc < 1:61166/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTc > 2:195694/1‑148 (MQ=255) gtCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCAGACGCTGAt < 2:81106/149‑1 (MQ=255) ccGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCAGACGCTGATGCCgg < 7:25201/149‑1 (MQ=255) cGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCcgtcctggcggttgaccaccacctggcgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgtt < 2:194682‑M2/148‑110 (MQ=255) cGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCa < 6:86459/134‑1 (MQ=255) cGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCa > 5:86459/1‑134 (MQ=255) cGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCAGACGCTGATGCCGgc > 5:234206/1‑149 (MQ=255) gCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCcgtcctggcggttgaccaccacctggcgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgt > 6:171358‑M2/1‑38 (MQ=255) gCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCcgtcctggcggttgaccaccacctggcgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgt < 5:171358‑M2/146‑109 (MQ=255) gCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTcc > 7:204837/1‑132 (MQ=255) gCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTcc < 8:204837/132‑1 (MQ=255) ccAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCcgtcctggcggttgaccaccacctggcgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgtt < 5:166580‑M2/146‑110 (MQ=255) | CACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATT‑TTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTGGACGGTGAGAAATACCTGGCGTTCGAGTTCCAGACGCTGATGCCGGC > NC_002947/1521259‑1521543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |