New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2362137 | 65 (1.540) | 4 (0.100) | 3/244 | NT | 7.7% | coding (1740/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3838131 = | 34 (0.850) | coding (1726/2673 nt) | PP_3388 | hypothetical protein |
ATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGATGACGCTGA > NC_002947/2361991‑2362283 | aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAAcgc > 1:56655/1‑149 (MQ=39) gggCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGa > 4:236537/1‑149 (MQ=39) gCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACg < 2:56655/149‑1 (MQ=39) gCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTAc < 1:143307/149‑1 (MQ=39) ccGCTACGTTCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCa < 2:98766/149‑1 (MQ=255) cGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCGACGCGACGTACCa < 6:237064/148‑1 (MQ=255) cGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCGACGCGACGTACCa > 5:237064/1‑148 (MQ=255) tACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCAGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCa > 8:79510/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACa < 7:79510/149‑1 (MQ=39) tGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACa < 1:144887/149‑1 (MQ=39) cTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCAt < 2:25703/141‑1 (MQ=39) cTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCAt > 1:25703/1‑141 (MQ=39) ttCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa > 3:133343/1‑149 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCg > 3:202176/1‑149 (MQ=39) aaTATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgc < 5:41952/149‑1 (MQ=39) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGAAGCTGGCCGtgc < 4:223267/142‑1 (MQ=255) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGAAGCTGGCCGtgc > 3:223267/1‑142 (MQ=255) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑ACCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 7:17181/1‑149 (MQ=255) cGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCtt > 7:191654/1‑149 (MQ=40) tCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCa < 3:105672/148‑1 (MQ=255) aTGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCt > 1:112478/1‑149 (MQ=255) aTGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCt > 3:50277/1‑149 (MQ=255) tGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTGCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCt > 1:63799/1‑149 (MQ=255) tGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTg > 7:239201/1‑149 (MQ=255) aCCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt > 6:30012/1‑148 (MQ=255) gAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGctct < 5:160931/130‑1 (MQ=40) gAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGctct > 6:160931/1‑130 (MQ=40) gAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATa > 5:44888/1‑149 (MQ=255) gAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATa > 4:134448/1‑149 (MQ=255) aGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATa > 8:241603/1‑147 (MQ=255) cGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAgg < 4:133343/149‑1 (MQ=255) aCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCT‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGgtg < 8:239201/149‑1 (MQ=255) aGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTg < 3:236537/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAggg > 4:77131/1‑141 (MQ=255) tCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAggg < 3:77131/141‑1 (MQ=255) cAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgc < 7:227824/149‑1 (MQ=255) ccGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGcc > 4:13359/1‑149 (MQ=255) aaCCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTTATGCGCCCAAAg < 8:191654/149‑1 (MQ=255) aaCCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAg < 5:30012/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCa > 4:86113/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAt < 1:263243/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt < 6:44888/147‑1 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt < 4:202176/147‑1 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTgg < 7:241603/149‑1 (MQ=255) aGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGc > 3:171232/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTGGGGGTGGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAGCagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgca < 8:173132‑M1/134‑94 (MQ=255) tGCTGTTGGGGGTGGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAGCagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgca > 7:173132‑M1/1‑41 (MQ=255) tGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGc < 4:50277/149‑1 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctga < 3:33291‑M1/120‑83 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcgc < 2:196234/116‑1 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcgc > 1:196234/1‑116 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTg > 2:158608/1‑149 (MQ=255) gTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTgg > 5:238757/1‑149 (MQ=255) ggggTGGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCCAACagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaactgctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacc > 4:143155‑M1/1‑34 (MQ=255) gggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgc < 1:158608/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGGTGCGCATCACTTGCCG‑CCACAACGCCACGTACCAGGCATACAGGCCGAAGCTGGCCGTGCTGCTCTTTGATTGCATCTGTTCATACACGGTGTTGATGCGCCAAAAGGCATTCGCAGATACATGGCCTTGCCTGGCAAgcg > 2:225732/1‑149 (MQ=14) ggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGt > 3:252923/1‑88 (MQ=255) ggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGt < 4:252923/88‑1 (MQ=255) gTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGa > 7:120859/1‑127 (MQ=255) gTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGa < 8:120859/127‑1 (MQ=255) gTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgcgc < 2:112478/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTg > 7:212631/1‑132 (MQ=40) ggTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTg < 8:212631/132‑1 (MQ=40) gcagcaCTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCAt < 6:102027/73‑1 (MQ=39) gcagcaCTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCAt > 5:102027/1‑73 (MQ=39) gcagcaCTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGc < 6:247145/124‑1 (MQ=40) gcagcaCTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGc > 5:247145/1‑124 (MQ=40) cTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAg < 4:171232/149‑1 (MQ=39) cg‑ccCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGATGa > 3:184309/1‑149 (MQ=39) ccccAACagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacccacaacgcagcgcaggccaggtatc > 7:46304‑M1/1‑7 (MQ=255) ccccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGATGACg > 5:254709/1‑149 (MQ=39) cccAACagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacccacaacgcagcgcaggccaggtatcaag < 7:30938‑M1/149‑144 (MQ=255) cccAACagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacccac < 6:35061‑M1/124‑119 (MQ=255) cccAACagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgactttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacccac > 5:35061‑M1/1‑6 (MQ=255) cccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGAGCGAAGGATGACGc > 6:72528/1‑149 (MQ=255) ccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAg < 6:6009/89‑1 (MQ=255) ccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAg > 5:6009/1‑89 (MQ=255) ccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAg < 2:247051/89‑1 (MQ=255) ccAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAg > 1:247051/1‑89 (MQ=255) cAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg > 4:117058/1‑98 (MQ=40) cAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 3:117058/98‑1 (MQ=40) cAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGATGACGCt > 8:125029/1‑148 (MQ=39) aaCagcatggaccgcgcgctgcaccagggtttgcggctgattttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatcaacccacaacgcagcgcaggccaggtatcaaggta > 5:122184‑M1/1‑3 (MQ=255) | ATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGT‑CCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCG‑CCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGATGACGCTGA > NC_002947/2361991‑2362283 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |