New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3529386 = | 37 (0.880) | 5 (0.130) | 5/244 | NT | 13.0% | coding (1203/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
? | NC_002947 | 3529437 = | 32 (0.800) | coding (1254/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
CATCACCGAGCTTGACCCCATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATG > NC_002947/3529239‑3529531 | cATCACCGAGCTTGACCCCATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCgg > 2:114601/1‑148 (MQ=255) aTCACCGAGCTTGACCCCATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCTCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGAAGTTGACTTCGAGCAAGACCGGCGCGAGGAGGTGCTCCAGTAGGTGTACCGTCGCTATGGCCGGCa > 4:102309/1‑149 (MQ=255) aTCACCGAGCTTGACCCCATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCa > 3:70822/1‑149 (MQ=255) cccATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCAc > 6:224438/1‑149 (MQ=255) cATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTTTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGggcgg < 2:123157/140‑1 (MQ=255) cATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGggcgg > 1:123157/1‑140 (MQ=255) gAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCgg > 8:189150/1‑149 (MQ=255) caccacCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCTGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGt < 6:89664/149‑1 (MQ=255) caccacCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGt < 1:102148/149‑1 (MQ=255) gaaaccggcctcggccaggcgctggtcatcgggtatgcgatcgctccagcgaccacaacatttggccagggcatccacctgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgcaccGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGt < 2:189565‑M1/27‑1 (MQ=255) accaccTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGt > 2:60474/1‑148 (MQ=255) caccTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCaa < 1:60474/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAacac > 4:225907/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCa > 2:139756/1‑149 (MQ=255) gAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATg < 5:224438/148‑1 (MQ=255) gcgcTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATgccg > 2:168504/1‑149 (MQ=255) cTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGccgccg < 4:70822/149‑1 (MQ=255) gctggtcatcgggtatgcgatcgctccagcgaccacaacatttggccagggcatccacctgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgcaccGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCcgg > 1:104559‑M1/102‑149 (MQ=255) atcgggtatgcgatcgctccagcgaccacaacatttggccagggcatccacctgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgcaccGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCcggtgcggt > 1:189565‑M1/95‑148 (MQ=255) gcgAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGtgcggtgcgg > 4:252679/1‑149 (MQ=255) aaCGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAac > 8:186674/1‑114 (MQ=255) aaCGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAac < 7:186674/114‑1 (MQ=255) aCATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTgggg < 1:168504/149‑1 (MQ=255) acaacatttggccagggcatccacctgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgcaccGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCcggtgcgg > 6:31216‑M1/68‑120 (MQ=255) acaacatttggccagggcatccacctgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgcaccGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCcggtgcgg < 5:31216‑M1/53‑1 (MQ=255) gTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGGCGCTCTGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGGAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGTGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGc < 3:102309/149‑1 (MQ=255) ggACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCg < 7:189150/149‑1 (MQ=255) cTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGAt > 5:216507/1‑148 (MQ=255) cTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGGGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATc < 6:216507/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTc < 8:23465/84‑1 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTc > 7:23465/1‑84 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCt > 3:200225/1‑91 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCt < 4:200225/91‑1 (MQ=255) gAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGt < 1:139756/149‑1 (MQ=255) aGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTg > 4:76476/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCt < 5:123687/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTgg > 6:120889/1‑149 (MQ=255) ggaggTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAAt > 4:204851/1‑149 (MQ=255) gTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAAtgttg > 4:97232/1‑149 (MQ=255) tgtTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAg < 3:225907/148‑1 (MQ=255) cGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGAt > 4:69121/1‑147 (MQ=255) cGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGAt < 3:69121/147‑1 (MQ=255) tATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATAcc > 7:242004/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATAccc < 5:8342/148‑1 (MQ=255) tGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCAACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCg < 3:76476/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGa > 5:16615/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATg < 4:8273/149‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATg < 3:97232/149‑1 (MQ=255) | CATCACCGAGCTTGACCCCATGAAACACCACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATG > NC_002947/3529239‑3529531 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |