New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4557241 = | 49 (1.160) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 5.7% | coding (236/984 nt) | gntZ | 6‑phosphogluconate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 4557288 = | 52 (1.270) | coding (189/984 nt) | gntZ | 6‑phosphogluconate dehydrogenase |
GGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGATGGCAT > NC_002947/4557098‑4557376 | caaggcgcctgatgcgcgccggtcaccgcaccgtggtgcacgaccgcaaccgtgatgccctcaccggcctggagggcgaaggcgcccagggtgcgcctgaccgcggtgcactggtacaaacgctgaacgcgccgcgcgcgggatggggg < 1:153657‑M1/6‑3 (MQ=255) cccACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATg < 1:243499/149‑1 (MQ=255) ggAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTgg > 7:202042/1‑149 (MQ=255) ccGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCAc < 3:29446/148‑1 (MQ=255) ccGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCAc > 4:29446/1‑148 (MQ=255) gACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAg > 6:2500/1‑149 (MQ=255) ccAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCgg > 4:100813/1‑148 (MQ=255) cAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCgg > 3:137267/1‑147 (MQ=255) cacgaccgcaaccgtgatgccatcaccggcctggagggcgaaggcgcccagggtgcgcatgacctcggtgcactggtacaaaagctgaaagcgccgcgcgcggtaTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCAc < 8:54268‑M1/44‑1 (MQ=255) gaccgcaaccgtgatgccatcaccggcctggagggcgaaggcgcccagggtgcgcatgacctcggtgcactggtacaaaagctgaaagcgccgcgcgcggtaTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCa > 7:54268‑M1/103‑149 (MQ=255) ccgcaaccgtgatgccatcaccggcctggacggcgaaggcgcccagggtgcgcatgacctcggtgcactggtacaaaagctgaaagcgccgcccgcggtaTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATa > 1:26723‑M1/101‑149 (MQ=255) cgcgCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCCCCAGCCGGCAGCATCACCCATAcc > 6:6591/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCgcgg < 4:137267/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCa > 7:133310/1‑132 (MQ=255) ccAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCa < 8:133310/132‑1 (MQ=255) cAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCgcggcg > 5:122008/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCttt > 5:56408/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAg > 6:57515/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCt < 4:91990/143‑1 (MQ=255) cAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCt > 3:91990/1‑143 (MQ=255) gcggcgCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCGCCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCtttt > 4:83905/1‑149 (MQ=255) gcggcgCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCtttt < 5:208014/149‑1 (MQ=255) cggcgCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGACGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCCCCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTg > 2:60915/1‑149 (MQ=255) gcgcATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTa > 7:151063/1‑149 (MQ=255) cATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCa < 3:111582/149‑1 (MQ=255) cATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCa < 8:202042/149‑1 (MQ=255) aaTGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCa < 4:242968/148‑1 (MQ=255) tGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGt < 5:2500/149‑1 (MQ=255) cTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTTCCAGTGCAcc > 5:161459/1‑147 (MQ=255) ttGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGc < 8:180695/129‑1 (MQ=255) ttGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGc > 7:180695/1‑129 (MQ=255) tAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGt > 6:222426/1‑148 (MQ=255) aGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCa > 4:166644/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCa < 6:191884/148‑1 (MQ=255) gtgtTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCCCCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTGTCAGCGTTTGTCCCAGTGCACCGAGGTCATgcgc > 2:153657/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCAcc < 5:109178/149‑1 (MQ=255) ccgccgTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTg < 6:56408/149‑1 (MQ=255) gccgTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTggg < 3:198847/149‑1 (MQ=255) gatgatCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAgg > 2:48869/1‑127 (MQ=255) atgatCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGGCTGCTCGGGGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTGTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTc < 1:199548/149‑1 (MQ=255) tgatCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCg < 3:100813/149‑1 (MQ=255) tcgcatcgcCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGccc > 3:24948/1‑149 (MQ=255) cgcatcgcCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCt > 2:39219/1‑149 (MQ=255) catcgcCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTc > 3:157778/1‑148 (MQ=255) cccGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGTGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTc < 2:9095/143‑1 (MQ=255) cccGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGTGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTc > 1:9095/1‑143 (MQ=255) cccGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGcc > 8:103434/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCCCCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCg > 3:67537/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCg < 8:151063/149‑1 (MQ=255) tCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGTAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGAt > 5:136031/1‑149 (MQ=255) aGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGATgg > 7:65702/1‑148 (MQ=255) gCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGATGGCa > 4:89417/1‑149 (MQ=255) aTTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGATGGCAt > 2:33882/1‑148 (MQ=255) ccAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCgg < 6:208669/132‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCgg > 5:208669/1‑132 (MQ=255) | GGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTTGTAGAAGGTGTTGCCGCCGTCGATGATCGCATCGCCCGGCTCCAGCATTTCGGCCAGCTGGGCGATGGTCTGCTCGGTGGCGTCACCAGCCGGCAGCATCACCCATACCGCGCGCGGCGCTTTCAGCTTTTGTACCAGTGCACCGAGGTCATGCGCACCCTGGGCGCCTTCGCCCTCCAGGCCGGTGATGGCAT > NC_002947/4557098‑4557376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |