New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 75122 | 37 (0.880) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 9.2% | coding (1088/1374 nt) | trkA | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
? | NC_002947 | = 75151 | 44 (1.100) | coding (1059/1374 nt) | trkA | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
GATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACATGATGTTGGCTTCGTCATCGTTG > NC_002947/75007‑75298 | gATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtgg < 2:119254‑M2/149‑5 (MQ=255) tGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcg > 6:3021‑M2/1‑143 (MQ=255) tCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcga > 1:119254‑M2/1‑141 (MQ=255) tCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAg < 4:195551/149‑1 (MQ=255) cTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtgagatcgg < 3:40019‑M2/149‑11 (MQ=255) ccttgccGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGc < 4:33434/143‑1 (MQ=255) ccttgccGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGc > 3:33434/1‑143 (MQ=255) tgccGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATg > 1:25668/1‑149 (MQ=255) gccGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATg < 2:25668/148‑1 (MQ=255) accTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGa > 4:29391/1‑139 (MQ=255) accTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGa < 3:29391/139‑1 (MQ=255) cTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgt < 6:65229‑M2/120‑3 (MQ=255) cTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgt > 5:65229‑M2/1‑118 (MQ=255) cTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGa > 6:98186/1‑149 (MQ=255) cTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGa > 8:159725/1‑149 (MQ=255) tCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCg > 3:249987/1‑149 (MQ=255) tCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCg > 2:117171/1‑149 (MQ=255) gACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTc > 1:183538/1‑140 (MQ=255) gACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTc < 2:183538/140‑1 (MQ=255) gACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGc < 1:117171/148‑1 (MQ=255) ccATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGa < 6:164959/118‑1 (MQ=255) cATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAgg > 4:200068/1‑149 (MQ=255) tgtgCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTc > 8:196215/1‑149 (MQ=255) gATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCgg < 7:107791/147‑1 (MQ=255) tCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGgttg > 4:141090/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGgttgt < 3:141090/148‑1 (MQ=255) ttCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTtga > 1:270128/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTtga > 2:87113/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTtgat < 3:200068/148‑1 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTgatgat > 8:79129/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGatgatg < 7:159725/149‑1 (MQ=255) ccGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGatgatg > 3:253099/1‑149 (MQ=255) cGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATgg > 7:151152/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGtc < 8:112748/146‑1 (MQ=255) cgcgGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGtc > 7:112748/1‑146 (MQ=255) gcAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTg > 2:89195/1‑149 (MQ=255) acTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGgc < 5:132945/149‑1 (MQ=255) cTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcgacatcgtcagtgtgcactcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgatcgaggcggtggcacatgg < 7:207837‑M2/115‑71 (MQ=255) cTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcgacatcgtcagtgtgcactcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgatcgaggcggtggcacatgg > 8:207837‑M2/1‑45 (MQ=255) tGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGgcgc > 6:96118/1‑149 (MQ=255) aCGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCtt > 2:211557/1‑149 (MQ=255) gATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTgg < 8:151152/149‑1 (MQ=255) tGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGc > 5:186766/1‑148 (MQ=255) tCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAg > 8:20904/1‑149 (MQ=255) gCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAga > 4:197321/1‑147 (MQ=255) ccACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGTCCAGc > 6:104755/1‑147 (MQ=255) ccACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCaa < 5:98186/149‑1 (MQ=255) cACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcgacatcgtcagtgtgcactcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgatcgaggcggtggcacatggcgattcgaagtcgagcaag > 1:190164‑M2/1‑32 (MQ=255) cACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGgtggcgacatcgtcagtgtgcactcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgatcgaggcggtggcacatggcgattcgaagtcgagcaag < 2:190164‑M2/121‑90 (MQ=255) cACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCg > 7:75271/1‑96 (MQ=255) cACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCg < 8:75271/96‑1 (MQ=255) ggacgTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGgacgac < 5:96118/149‑1 (MQ=255) cgTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGc < 4:181186/133‑1 (MQ=255) cgTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGc > 3:181186/1‑133 (MQ=255) gTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACatga < 4:253099/149‑1 (MQ=255) tgCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACATGATGTTGGCTTCGTCa < 7:196215/149‑1 (MQ=255) ccGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACATGATGTTGGCTTCGTCATc > 5:210332/1‑149 (MQ=255) ggtggtggCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTgcg < 7:97620/98‑1 (MQ=255) ggtggtggCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTgcg > 8:97620/3‑100 (MQ=255) tggtggCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACATGATGTTGGCTTCGTCATCGTTg < 1:211557/149‑1 (MQ=255) | GATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGCCCAGGCGCTTGGCCAGCAAGGACGACATGATGTTGGCTTCGTCATCGTTG > NC_002947/75007‑75298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |