New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 452193 | 31 (0.730) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 8.2% | coding (111/1281 nt) | aruC | acetylornithine aminotransferase |
? | NC_002947 | = 452231 | 37 (0.900) | coding (149/1281 nt) | aruC | acetylornithine aminotransferase |
TGAACCTGTTCAACCTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGC > NC_002947/452084‑452376 | tGAACCTGTTCAACCTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAg > 3:193640‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGTTCAACCTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGCACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTc > 7:166385/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTtgt > 5:180166/1‑149 (MQ=255) cgccgcTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTgg < 4:196766/147‑1 (MQ=255) cgcTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACaa > 7:161185/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCa < 6:180166/148‑1 (MQ=255) ccgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTAc < 8:171768/149‑1 (MQ=255) ccgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTAc > 7:207572/1‑149 (MQ=255) cgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACt > 8:106394/1‑149 (MQ=255) cccAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACtt < 8:176206/146‑1 (MQ=255) cccAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACtt > 7:176206/1‑146 (MQ=255) gCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAgg > 7:81659/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAgg < 8:161185/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAggg > 3:120967/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCGGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGgcg < 8:173686/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGgcg < 8:207572/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGgcggtg < 4:120967/149‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAAc < 5:125075/149‑1 (MQ=255) tGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGc > 6:37994/1‑149 (MQ=255) aCGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGc < 5:37994/149‑1 (MQ=255) gcgTCTGAGCTGTCGGCTGACGGCCTGATGGCCGGCACCGAACGTGCAGCGGATGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGc < 8:166385/147‑1 (MQ=255) gTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCcaca < 7:233341/149‑1 (MQ=255) tGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTgg > 4:34888/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCTTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTg < 1:220563/145‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTg > 2:220563/1‑145 (MQ=255) gcCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCaaa < 3:34888/149‑1 (MQ=255) ccTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAg > 7:7302/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAg > 7:11268/1‑149 (MQ=255) cTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAgggcatcaggcgctcaggcgactgctcagacgcgtgcggcacgatcaccggcgcacgcttgggctcggcggcggcggcaggagccgagcggcgcaggttgaa < 3:257463‑M2/149‑103 (MQ=255) tGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAgggcatcaggcgctcaggcgactgctcagacgcgtgcggcacgatcaccggcgcacgcttgggctcggcggcggcggcaggagccgagcggcgcaggttgaa < 5:86300‑M2/148‑103 (MQ=255) gATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGt > 2:158436/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAgggcatcaggcgctcaggcgactgctcagacgcgtgcggcacgatcaccggcgcacgcttgggctcggcggcggcggcaggagccgagcggcgcaggttgaacagg > 4:257463‑M2/1‑43 (MQ=255) tGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTg < 1:158436/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAg > 6:94215/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGt < 5:94215/149‑1 (MQ=255) cAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGAt > 6:32556/1‑149 (MQ=255) gTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCaa > 5:170863/1‑149 (MQ=255) tATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAc < 1:237651/149‑1 (MQ=255) ttCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAccc < 7:106394/149‑1 (MQ=255) gtgcgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgg < 5:32556/148‑1 (MQ=255) gcgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGc > 4:241736/1‑101 (MQ=255) gcgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGc < 3:241736/101‑1 (MQ=255) gCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgggctcgggc > 1:15707/1‑149 (MQ=255) | TGAACCTGTTCAACCTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGC > NC_002947/452084‑452376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |