New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 460798 | 40 (0.950) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 9.4% | coding (1667/2301 nt) | pqqF | coenzyme PQQ synthesis protein F |
? | NC_002947 | = 460842 | 39 (0.960) | coding (1623/2301 nt) | pqqF | coenzyme PQQ synthesis protein F |
CTGCCAGCGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAGGGCAGCCAGCAACTGGCAGG > NC_002947/460695‑460985 | ctgcCAGCGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTg < 8:25677/148‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGt < 3:18761‑M2/149‑2 (MQ=255) aGCGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGt > 7:105472/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTtg > 5:92813/1‑149 (MQ=255) gtTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTgctgct < 8:5216/149‑1 (MQ=255) tGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTggg < 1:188558/149‑1 (MQ=255) ccAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGt > 6:248201/1‑147 (MQ=255) gTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGt < 6:70313/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTgc < 5:122081/148‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTgc < 4:18761/148‑1 (MQ=255) gCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAggcaggca > 4:218528/1‑149 (MQ=255) cTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCAc < 6:92813/149‑1 (MQ=255) gAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTggggg < 3:119487/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGc < 3:218528/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAg < 5:61681/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAgg < 6:267943/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTAcc > 6:8830/1‑149 (MQ=255) cAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTAccc < 1:10633/149‑1 (MQ=255) aGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAgg < 6:6155/142‑1 (MQ=255) aGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAgg > 5:6155/1‑142 (MQ=255) ggCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTggggg > 7:233338/1‑136 (MQ=255) ggCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTggggg < 8:233338/136‑1 (MQ=255) ggCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCg > 4:19822/1‑148 (MQ=255) ggCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGt < 5:248201/149‑1 (MQ=255) cTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACcg > 5:41953/1‑149 (MQ=255) cagcgcagcgCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTg > 5:163688/1‑149 (MQ=255) cgcagcgcCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCa < 6:163688/149‑1 (MQ=255) agcgcCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCGGTACCGCGTCTGGCAGtt < 7:149231/149‑1 (MQ=255) cTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAggg > 5:177861/1‑149 (MQ=255) cgGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGtcgaggataccgcgctaaaggccttgggcgctgcgctggaacagtgccctgggcaaggctcgcgacctagccccctgccaacctgggcaaac < 4:168068‑M2/148‑93 (MQ=255) cTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGtcgaggataccgcgctaaaggccttgggcgctgcgctggaacagtgccctgggcaaggctcgcgac > 1:18499‑M2/1‑49 (MQ=255) cTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGtcgaggataccgcgctaaaggccttgggcgctgcgctggaacagtgccctgggcaaggctcgcgac < 2:18499‑M2/115‑67 (MQ=255) cTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGAt > 8:30650/1‑147 (MQ=255) gAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAggg < 7:30650/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCgg > 3:155433/1‑149 (MQ=255) ccatgccatgCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAgc > 4:215843/1‑149 (MQ=255) catgccatgcCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAgcg > 1:72086/1‑149 (MQ=255) catgccatgcCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAgcg > 7:147792/1‑149 (MQ=255) atgccatgccACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAgcgc < 3:215843/149‑1 (MQ=255) ccatgccaCTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGtcgaggataccgcgctaaaggccttgggcgctgcgctggaacagtgccctgggcaaggctcgcgacctagccccctgccaacctgggcaaaccaccgctggcagcatgcccaagtgcca > 3:168068‑M2/1‑30 (MQ=255) ccatgccaCTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAAGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGt > 3:10542/1‑149 (MQ=255) catgccaCTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTg > 4:13904/1‑149 (MQ=255) ccaCTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCATGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAgg < 4:10542/149‑1 (MQ=255) caCTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAggg > 5:84982/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAGGGcagc < 6:41953/148‑1 (MQ=255) ccACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAGGGCAGCCAGCAACTgg > 3:245107/1‑149 (MQ=255) aGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAGGGCAGCCAGCAACTGGCAgg > 5:176271/1‑149 (MQ=255) | CTGCCAGCGGTGGTTTGCCCAGGTTGGCAGGGGGCTAGGTCGCGAGCCTTGCCCAGGGCACTGTTCCAGCGCAGCGCCCAAGGCCTTTAGCGCGGTATCCTCGAAGCCTGCGGCCATGCCATGCCACTCGGTGTGCAGCCACAGGCTGTCGAGTTGCTGCTGGGTCAGCGTGCAGGCAGGCACCGCTGGGGGCAGGCTACCCCGTACCGCGTCTGGCAGTTGCTTGAGCAGGGCCCTGATGGGGATCAGGGCCGGGGGCAGCGCCGTGCAGGGCAGCCAGCAACTGGCAGG > NC_002947/460695‑460985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |