New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 954579 | 49 (1.160) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.6% | coding (421/888 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
? | NC_002947 | = 954637 | 38 (0.940) | coding (479/888 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
TTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGTGGCACGTGGCATCCTCGCGGCGAAGAAGCAGA > NC_002947/954489‑954783 | ttCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCt < 8:19676/149‑1 (MQ=255) cgcACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTgg > 5:28022‑M2/1‑144 (MQ=255) tGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTgg > 5:92061‑M2/1‑135 (MQ=255) tGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTgg < 6:92061‑M2/137‑3 (MQ=255) cTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCctgc < 5:183689/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCctgc > 1:28770/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGc < 2:28770/149‑1 (MQ=255) tttCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCttt < 2:252819/149‑1 (MQ=255) tCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTg < 3:239891/148‑1 (MQ=255) aCAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCa > 1:61085/1‑148 (MQ=255) cAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGc < 7:172261/146‑1 (MQ=255) cAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCaaa > 8:7829/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAAt < 8:1784/149‑1 (MQ=255) cTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGcc > 1:265044/1‑149 (MQ=255) tgGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGca > 8:64243/1‑149 (MQ=255) gCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGcaca < 7:64243/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGca > 2:257336/1‑147 (MQ=255) aaGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGc < 3:56271/133‑1 (MQ=255) aaGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGc > 4:56271/1‑133 (MQ=255) aGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCttt < 1:257336/149‑1 (MQ=255) gTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGcc < 6:89521/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATcg < 4:132103/149‑1 (MQ=255) aCGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTTGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTc > 1:147020/1‑149 (MQ=255) aCGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTc > 1:142812/1‑149 (MQ=255) cACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCt > 4:90559/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTggctgccgaccaaggtgccgtgcaccgatttacgcttcagccacaggctgtagaaaccgacgtagacgacaaagc < 6:181005‑M2/149‑76 (MQ=255) cTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCa < 6:163641/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGAt > 7:214166/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGAt > 3:96159/1‑148 (MQ=255) ggCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTa < 7:7829/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGGGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAgcg < 6:111906/149‑1 (MQ=255) tGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCt > 3:264411/1‑149 (MQ=255) tGTCGGGTGCCATGCCTCCGGAGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCCGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCt > 5:187413/1‑149 (MQ=255) gTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTggctgccgaccaaggtgccgtgcaccgatttacgcttcagccacaggctgtagaaaccgacgtagacgacaaagccaa < 7:161547‑M2/135‑79 (MQ=255) gTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTggctgccgaccaaggtgccgtgcaccgatttacgcttcagccacaggctgtagaaaccgacgtagacgacaaagccaa > 8:161547‑M2/1‑57 (MQ=255) gTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGcc > 3:5910/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGt < 8:219109/149‑1 (MQ=255) tCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGt < 2:265044/148‑1 (MQ=255) ggCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGTgg < 8:214166/148‑1 (MQ=255) cTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGTGGCACGTg < 4:96159/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAg > 7:251266/1‑101 (MQ=255) aaCAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAg < 8:251266/101‑1 (MQ=255) aCAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTg > 7:251693/1‑105 (MQ=255) aCAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTg < 8:251693/105‑1 (MQ=255) cTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGTGGCACGTGGCATCCTCGCGGCgaag > 6:17013/1‑148 (MQ=255) ccTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGAGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCTAGATTCCGGTCCTGCCTGTGGCACGTGGCATCCTGGCGGCGAAGATGCAGa < 6:187413/149‑1 (MQ=255) | TTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTCGGGTGCCATGCCTCCGGTGATCGGCTACTGCGCCGTGAGCAACAGCTTCGACCTGGCTGCGGTAACCCTGCTGGTGATGTTCAGCCTTTGGCAAATGCCGCACAGCTTTGCCATCGCGATCTTCCGCTTCAAGGATTACAGCGCTGCCAACATTCCGGTCCTGCCGGTGGCACGTGGCATCCTCGCGGCGAAGAAGCAGA > NC_002947/954489‑954783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |