New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1039885 | 45 (1.070) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 6.4% | coding (242/921 nt) | PP_0899 | ferredoxin reductase |
? | NC_002947 | = 1039923 | 46 (1.160) | coding (280/921 nt) | PP_0899 | ferredoxin reductase |
CGCTGCCTGGAAGGGCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTGGCCAGCCTGCCGGGCGA > NC_002947/1039776‑1040071 | cgcTGCCTGGAAGGGCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGc < 5:277133‑M2/149‑2 (MQ=255) cTGGAAGGGCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGcgcaggt < 1:221055‑M2/149‑8 (MQ=255) ggAAGGGCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCt < 4:158231/149‑1 (MQ=255) gCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGt > 8:170832/1‑149 (MQ=255) aaCCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTTCGTTg < 7:170832/149‑1 (MQ=255) cGGCAGACGCTTTGCGCGATGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGAc < 3:5786/149‑1 (MQ=255) gCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTg > 2:109525/1‑149 (MQ=255) gAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGtt < 2:221055/149‑1 (MQ=255) attggcattggAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGtt > 4:229567/1‑123 (MQ=255) attggcattggAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGtt < 3:229567/123‑1 (MQ=255) cattggAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGc > 6:91507/1‑131 (MQ=255) cattggAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGc < 5:91507/131‑1 (MQ=255) attggAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGt > 3:190269/1‑149 (MQ=255) gagaAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTgcg > 7:78254/1‑149 (MQ=255) gagaAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTgcg > 8:177777/1‑149 (MQ=255) gagaAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTAGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTgc < 4:100023/148‑1 (MQ=255) ccgaGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGGAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCgg < 1:109525/146‑1 (MQ=255) ccAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTg > 6:253485/1‑103 (MQ=255) ccAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTg < 5:253485/103‑1 (MQ=255) cAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGggt > 6:250069/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCTATCGGTTGGTGCGTTa < 6:153218/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTgc < 3:137278/121‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTgc > 4:137278/1‑121 (MQ=255) ttGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCtgt > 7:135420/1‑79 (MQ=255) ttGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCtgt < 8:135420/79‑1 (MQ=255) ttGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGTGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCgg > 6:68449/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCgggg < 5:250069/148‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTATCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCgggg > 3:215999/1‑147 (MQ=255) gggTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACgtg < 4:190269/149‑1 (MQ=255) gtggtCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACgtggt < 7:177777/149‑1 (MQ=255) tggtCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACgtggtg < 6:277133/149‑1 (MQ=255) cGAGGACCTCCGTGTCGCGTTGTACGACCCCCACCAGGGTGGCGTACCGGAGCAGGTCTGTGAGTTGGACTGGATTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTCCGCCCCGATCGGGTGGTCAGTTACCACGCGGGGCAGCACgtggtcatgt > 4:250005/1‑144 (MQ=255) gAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCtgtg > 4:15156/1‑149 (MQ=255) aGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGcgcaggtcctcgaccacccggcactggcaagccagacgccagccctgggcatgtttctccaatgccaatgcctcgggcaaagcgtctgccggttgcccttc < 1:95215‑M2/149‑102 (MQ=255) gACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGcgcaggtcctcgaccacccggcactggcaagccagacgccagccctgggcatgtttctccaatgccaatgcctcgggcaaagcgtctgccggttgcccttcca > 2:95215‑M2/1‑46 (MQ=255) gACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACCACGTGCtgccc > 8:179317/1‑144 (MQ=255) gACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACCACGTGCtgccc < 7:179317/147‑4 (MQ=255) gACCTGCGTGTCGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGAGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGAGTGGCAGCACGTGGTGCTGAGGc > 3:91676/1‑148 (MQ=255) ccTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGcgcaggtcctcgaccacccggcactggcaagccagacgccagccctgggcatgtttctccaatgccaatgcctcgggcaaagcgtctgccggttgcccttccagg < 3:227595‑M2/149‑106 (MQ=255) cTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAgg > 7:192892/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAgg > 2:143932/1‑149 (MQ=255) gCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTAc > 6:266529/1‑115 (MQ=255) gTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCgg < 8:192892/148‑1 (MQ=255) tACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGcc > 7:56995/1‑149 (MQ=255) cccccAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTGTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTAtt > 1:22113/1‑149 (MQ=255) ccccAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTc < 2:61685/149‑1 (MQ=255) cccAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTcc < 3:250005/149‑1 (MQ=255) cagcagGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGGTGGACTGGTTTCGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTCTGGCTAGCCGAGGTTGCTCGGCCTTAATCCtt > 5:217423/1‑149 (MQ=255) tgcagGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTg < 1:29473/148‑1 (MQ=255) agcagGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTg < 1:182800/149‑1 (MQ=255) gcagGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTgg < 3:15156/149‑1 (MQ=255) cagGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTg > 2:29473/1‑147 (MQ=255) gTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCACCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAgg < 6:143750/113‑1 (MQ=255) gTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCACCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGCGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAgg > 5:143750/1‑113 (MQ=255) aCCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTGGCAAGCCTGCCgg > 8:25981/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTGGCCAGCCTGCCGGGc > 2:91883/1‑147 (MQ=255) gcgcAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTGGCCAGCCTGCCGGGCGa < 8:78254/149‑1 (MQ=255) | CGCTGCCTGGAAGGGCAACCGGCAGACGCTTTGCCCGAGGCATTGGCATTGGAGAAACATGCCCAGGGCTGGCGTCTGGCTTGCCAGTGCCGGGTGGTCGAGGACCTGCGTGTGGCGTTGTACGACCCCCAGCAGGGTGGCGTACCGGCGCAGGTCTGTGCGTTGGACTGGTTTGGCGATGTGTTGCGCCTGCGGTTGCGCCCCGATCGGGTGGTGCGTTACCAGGCGGGGCAGCACGTGGTGCTGTGGCTAGGCGCGGTTGCTCGGCCTTATTCCTTGGCCAGCCTGCCGGGCGA > NC_002947/1039776‑1040071 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |