New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1320342 | 46 (1.090) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.1% | coding (2389/2586 nt) | PP_1154 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 1320375 | 48 (1.190) | coding (2356/2586 nt) | PP_1154 | sensory box protein |
CCTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATGCGC > NC_002947/1320230‑1320521 | ccTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACGGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcag < 1:24687‑M2/149‑4 (MQ=255) ccTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACGGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcag < 1:64877‑M2/149‑4 (MQ=255) ttGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggc < 8:123183‑M2/149‑6 (MQ=255) cACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGc < 5:75505/149‑1 (MQ=255) aCTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCt > 4:135596/1‑149 (MQ=255) cATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtga < 1:82845/147‑1 (MQ=255) tGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACGGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGaa < 2:24687/149‑1 (MQ=255) tGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACGGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGaa < 2:64877/149‑1 (MQ=255) gCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCt < 7:34818/149‑1 (MQ=255) ggTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTg < 5:8166/149‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGt < 7:136706/149‑1 (MQ=255) tCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTc > 2:147229/1‑149 (MQ=255) cTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGa < 2:213074/149‑1 (MQ=255) cTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGa > 4:43610/1‑149 (MQ=255) gACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCt > 7:52053/1‑149 (MQ=255) gAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCg > 2:98422/1‑148 (MQ=255) gTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAAc > 6:102930/1‑149 (MQ=255) gTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAAc > 8:238190/1‑149 (MQ=255) ttGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtgatga > 6:215380/1‑119 (MQ=255) ttGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtgatga < 5:215380/119‑1 (MQ=255) ttGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGATGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACg < 1:157069/149‑1 (MQ=255) gATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtgat > 7:145702/1‑115 (MQ=255) gATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtgat < 8:145702/115‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggtagg > 7:49523/1‑148 (MQ=255) gCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggtaggt < 4:103690/147‑1 (MQ=255) gCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGGTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggtaggt > 3:103690/1‑147 (MQ=255) tCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGAAGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCAGTTGTTGTTCAGGCCCCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGATGTCTAAAGGGTAGTTACGCAg > 5:135660/1‑149 (MQ=255) aCGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTa < 1:6639/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGc < 3:43610/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGc < 7:238190/149‑1 (MQ=255) ttCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGccc > 6:40542/1‑148 (MQ=255) gCTGACAGTGACAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGAt > 6:74402/1‑113 (MQ=255) gCTGACAGTGACAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGAt < 5:74402/113‑1 (MQ=255) ctgtcactgtcaGGCCCATCGCCTCGCCCTGGTTGATGATGGCCTGGAGCACAGCGCGGTGGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGGCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCGAacgac < 4:264633/149‑1 (MQ=255) ctgtcactgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAacgac < 8:49523/149‑1 (MQ=255) actgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCgttgttgtt > 3:165677/1‑74 (MQ=255) actgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCgttgttgtt < 4:165677/74‑1 (MQ=255) aGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCgg < 1:98422/148‑1 (MQ=255) gCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTg < 5:102930/149‑1 (MQ=255) cATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGcc < 3:206977/147‑1 (MQ=255) cATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGcc > 4:206977/1‑147 (MQ=255) gcctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAacga < 7:140643/128‑1 (MQ=255) gcctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAacga > 8:140643/1‑128 (MQ=255) gcctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAat < 6:110376/148‑1 (MQ=255) gccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATcc < 3:135596/148‑1 (MQ=255) cccAGGGTGATTATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCAt < 3:57822/149‑1 (MQ=255) tgatgGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtgacagccgaaggcgtggaaagcgaacagcaactcaagtcgctggaaaaggaccgctgccatgaag < 3:11531‑M2/149‑107 (MQ=255) tgGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtgacagccgaaggcgtggaaagcgaacatcaactcaagtcgctggaaa > 4:205325‑M2/1‑40 (MQ=255) tgGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtgacagccgaaggcgtggaaagcgaacatcaactcaagtcgctggaaa < 3:205325‑M2/128‑89 (MQ=255) ggACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAacgac > 4:188506/1‑104 (MQ=255) ggACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAacgac < 3:188506/104‑1 (MQ=255) cacaGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCt > 3:94190/1‑149 (MQ=255) caGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTa > 5:19468/1‑141 (MQ=255) caGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTa < 6:19468/141‑1 (MQ=255) aGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCtt > 3:122745/1‑147 (MQ=255) cgcgGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTCTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGc < 7:123183/149‑1 (MQ=255) ccgccgTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATg < 5:40542/147‑1 (MQ=255) gccgTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGc > 4:228274/1‑149 (MQ=255) ttgttgttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTaa < 4:94190/149‑1 (MQ=255) tgttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATgc < 8:52053/148‑1 (MQ=255) gttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATgcgc > 3:264245/1‑149 (MQ=255) | CCTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATGCGC > NC_002947/1320230‑1320521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |