New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1455374 = | 46 (1.090) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 7.8% | coding (908/1455 nt) | PP_1273 | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
? | NC_002947 | 1455462 = | 50 (1.230) | coding (996/1455 nt) | PP_1273 | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
CCATCGGCTTGCCGTCCGAACTGGCCGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATCGC > NC_002947/1455314‑1455609 | ccATCGGCTTGCCGTCCGAACTGGCCGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGcc < 5:13768/149‑1 (MQ=255) tCGGCTTGCCGTCCGAACTGGCCGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTg < 7:74085/149‑1 (MQ=255) tgcGTGCGAACTGGCCGTGCGGCGCCCGGTCATCCGGCAGGCCGAGGGCCGGCTGCCTGCCGCCACCGGCAGGCTTTGGGTGGCCAATGGGGTTTCTTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCt < 1:203052/146‑1 (MQ=255) cGTCCGAACTGGCCGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCg < 6:11336/149‑1 (MQ=255) ggatgtccGGGCGGCGCTCGGCCATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑c > 3:143505/7‑149 (MQ=255) gatgtccGGGCGGCGCTCGGCCATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑Cg < 4:143505/144‑1 (MQ=255) cGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCt < 4:95397/149‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTg > 1:111315/1‑149 (MQ=255) ggACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGcc < 2:111315/149‑1 (MQ=255) gccATCCGCCAGGCAGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCCTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCACCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGCCCCTGCAGCTGTCGCAATT‑CGGTGGCTGCGATTCGCGCCg > 6:35019/3‑149 (MQ=255) gACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCg > 8:84522/1‑149 (MQ=255) aTCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTgg > 4:253468/1‑131 (MQ=255) aTCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTgg < 3:253468/131‑1 (MQ=255) tCCGCCAGGGCGAGGCGCGGCTGCATGCCGCCTCCGGCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTAGCCCAGCACCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCGTGGAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGttt < 5:35019/149‑1 (MQ=255) gcgaGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGcc < 8:110849/146‑1 (MQ=255) ggCCGAGGCCCTCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCg < 7:252718/149‑1 (MQ=255) cccGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCcac < 1:183523/147‑1 (MQ=255) cccGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCcac > 2:183523/1‑147 (MQ=255) cGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGAt > 6:76748/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGAt > 8:162576/1‑149 (MQ=255) cctggaagccgacactgcccgacaggcggatgctggggtaaaaatccgccttggccacgccaatgctggcggtggcggcatgcaggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCg < 1:130750‑M2/50‑1 (MQ=255) cctggaagccgacactgcccgacaggcggatgctggggtaaaaatccgccttggccacgccaatgctggcggtggcggcatgcaggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCg > 2:130750‑M2/88‑137 (MQ=255) ctggaagccgacactgcccgacaggcggatgctggggtaaaaatccgccttggccacgccaatgctggcggtggcggcatgcaggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTc > 7:68189‑M2/87‑149 (MQ=255) aTGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTg > 6:97290/1‑149 (MQ=255) agccgacactgcccgacaggcggatgctggggtaaaaatccgccttggccacgccaatgctggcggtggcggcatgcaggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGc < 8:68189‑M2/68‑1 (MQ=255) ccgccaccgccaGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCg < 2:188138/149‑1 (MQ=255) caccgccaGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGAttt < 7:207564/149‑1 (MQ=255) caGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAg > 2:158106/1‑149 (MQ=255) caGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAg < 5:124308/149‑1 (MQ=255) aGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGt > 3:139185/1‑130 (MQ=255) aGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGt < 4:139185/130‑1 (MQ=255) aGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAgg < 5:76748/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGcc < 2:70857/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCgg > 6:237765/1‑149 (MQ=255) cGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGaa > 8:209399/1‑139 (MQ=255) cGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGaa < 7:209399/139‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTg > 2:21202/1‑139 (MQ=255) gCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTg < 1:21202/139‑1 (MQ=255) aGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAggg > 3:178358/1‑148 (MQ=255) tt‑tttACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTc > 6:173783/1‑121 (MQ=255) tt‑tttACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTc < 5:173783/121‑1 (MQ=255) cAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTg < 2:176450/119‑1 (MQ=255) cAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTg > 1:176450/1‑119 (MQ=255) cAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGCACTGcgcg > 8:42814/1‑149 (MQ=255) cAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTgcgc > 7:199172/1‑148 (MQ=255) gCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAg < 5:237765/149‑1 (MQ=255) gCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAg < 4:18100/149‑1 (MQ=255) gCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCaa > 2:84691/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCaa > 8:704/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCaa > 2:69346/1‑149 (MQ=255) tCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAAcagca < 7:84522/149‑1 (MQ=255) gggCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAAcagcag < 4:178358/148‑1 (MQ=255) gCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAgg > 8:138179/1‑147 (MQ=255) tCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCcgcg > 2:43468/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGCCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCgcgc > 5:234965/1‑149 (MQ=255) ggCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCt < 1:158106/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTTGCGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGACGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGTAAGCCGCGCt > 1:149234/1‑148 (MQ=255) caggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAgg < 4:41239‑M2/128‑1 (MQ=255) caggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAgg > 3:41239‑M2/6‑133 (MQ=255) ggcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATc < 5:97290‑M2/146‑1 (MQ=255) gcCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATCg > 6:44684‑M2/3‑149 (MQ=255) ccTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATCGc > 1:238734/1‑148 (MQ=255) ccTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATCGc > 1:148228/1‑148 (MQ=255) | CCATCGGCTTGCCGTCCGAACTGGCCGAGCGCCGCCCGGACATCCGCCAGGCCGAGGCCCGCCTGCATGCCGCCACCGCCAGCATTGGCGTGGCCAAGGCGGATT‑TTTACCCCAGCATCCGCCTGTCGGGCAGTGTCGGCTTCCAGGCCCTGCAGCTGTCGGATTT‑CGGTGGCTGGGATTCGCGCCGGTTTGCCTTCGGTCCACAGATGTCGCTGCCGATTTTCGAAGGTGGCCGGCTCAAGGGCACCCTGGAACTGCGCGAGGCGCAACAGCAGGAAGCCGCGCTGAACTATCGC > NC_002947/1455314‑1455609 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |