New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4238005 = | 47 (1.110) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 8.3% | coding (245/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
? | NC_002947 | 4238048 = | 44 (1.100) | coding (202/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
CCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTTGTGCGGGCGAATG > NC_002947/4237900‑4238196 | ccctggtgtgattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggacggcatcggtgaagccaacaccatctgtggcctggcgtatggctacgaaagcccctaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCtt > 6:62480‑M1/106‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCtt > 7:245080/1‑148 (MQ=255) gtggtattgcgactgcgctgcatcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGAt > 3:72427‑M1/101‑147 (MQ=255) gAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCgg < 7:249467/149‑1 (MQ=255) aGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg < 8:38955/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTc > 7:200294/1‑149 (MQ=255) cgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCg > 5:41045/1‑149 (MQ=255) tgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTg > 6:87777‑M1/83‑127 (MQ=255) tgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTg < 5:87777‑M1/45‑1 (MQ=255) tCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAg < 4:201015/147‑1 (MQ=255) tCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGc < 8:200294/148‑1 (MQ=255) gATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTTCCCTTGGGCAGCTTGTCCAGGTTGAGCATGGGGTCATTGAGGTTGTCTGCCGGGAGGCCAATCAAAGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCGTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCa < 6:213104/148‑1 (MQ=255) gATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc > 3:24382/1‑132 (MQ=255) gATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc < 4:24382/132‑1 (MQ=255) gATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCa < 5:47352/148‑1 (MQ=255) cGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCAt < 6:31040/144‑1 (MQ=255) cGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCAt > 5:31040/1‑144 (MQ=255) gACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAg < 8:49991/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCAc > 4:142694/1‑149 (MQ=255) ggCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCAc > 6:264231/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCAcc > 7:31962/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCAc < 6:41045/148‑1 (MQ=255) aGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtg < 8:245080/149‑1 (MQ=255) aGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtg < 5:276619/149‑1 (MQ=255) aGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtg < 6:218730/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtgg < 1:12/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtg < 1:142897/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtgg < 3:57152/147‑1 (MQ=255) tgtTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtgg > 4:57152/1‑147 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCt > 3:41055/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggtgg < 1:33648/140‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggtgg > 2:33648/1‑140 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg > 1:116729/1‑98 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg < 2:116729/98‑1 (MQ=255) tcATGGCGGCATTGATGGTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGTCTTATCGCGTCGAAGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATc < 1:86618/148‑1 (MQ=255) ggcggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCtt > 6:136596/1‑134 (MQ=255) ggcggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCtt < 5:136596/134‑1 (MQ=255) gcggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGc < 3:142694/148‑1 (MQ=255) aTTGATGTTGGCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 4:202642/149‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCTGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCg > 2:38477/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATaccac > 6:78958/1‑148 (MQ=255) atcaaggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGATGCAGCGCAGTCGCAATaccac > 3:72427‑M2/48‑147 (MQ=255) gCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAgg > 6:205641/1‑149 (MQ=255) caaggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCa > 6:87777‑M2/46‑127 (MQ=255) caaggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCa < 5:87777‑M2/82‑1 (MQ=255) aaggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTAGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACAGATGGTGTTGGCTTCACCGATGCCGTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATCACACCAggg > 6:62480‑M2/45‑149 (MQ=255) tCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAgg < 3:249488/140‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAgg > 4:249488/1‑140 (MQ=255) ggCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCTGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGgtgt < 1:38477/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGgtgt > 3:104213/1‑149 (MQ=255) a‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGc > 7:57898/1‑148 (MQ=255) gTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATCCCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCt > 6:223218/1‑149 (MQ=255) gTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCt > 4:142451/1‑149 (MQ=255) cGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGACAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCA‑CAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTtgt > 1:158493/1‑149 (MQ=255) gATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTtgt < 5:78958/149‑1 (MQ=255) tGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTTGTGCGGGCGAATg > 7:190355/1‑149 (MQ=255) | CCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTA‑CGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTTGTGCGGGCGAATG > NC_002947/4237900‑4238196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |