New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 428054 | 40 (1.250) | 3 (0.110) +CGCGGCTATCAACCCTTTGATACGAC |
3/238 | 4.0 | 8.7% | coding (953/957 nt) | PP_0351 | transmembrane sensor |
? | NC_002947 | 3279267 = | 37 (1.150) | coding (17/183 nt) | PP_2878 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGCACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGAG > NC_002947/427908‑428199 | cgccccGGCCGCTTCGCGGGTGAACCCGCGCCTACGACGACCCCGAGGTGGGGCCACCCCCGGGGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTAttt < 5:142499/144‑1 (MQ=14) gCACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTAttt > 2:155000/1‑147 (MQ=255) ccGGCGTCTTCGCGGGGGACCCCGCCCCTCCGCCGCCCCCGAGGTGGGGCCCCCCCCGGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGaa < 5:14544/148‑1 (MQ=17) ccGGCCTCTTGGGGGGGCAACCCGCGCCTTCGACCCCCCCGTCGGGGGGCCACCACCGGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCTAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGaa < 4:28591/148‑1 (MQ=17) gggCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCGTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAg < 4:43920/147‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTg > 6:140847/1‑148 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCGGAACGACTGGGGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTg > 3:30776/1‑148 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCTTTTTGTGTCCACCACCGTGGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTca < 8:66590/147‑1 (MQ=255) ccggCTCCTAGGACGCCTCCGATGGGTGTGCACCACCGTGGTTGGAGGGGGTTTACCCGGGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACt < 4:138769/144‑1 (MQ=21) ccGCGCCTACGACGCCCCCGATGGGTGGCCACCACCGTGGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGGTCACCCACCACTGc < 5:120909/148‑1 (MQ=18) gCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGGGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGt < 3:128124/148‑1 (MQ=255) tCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTAt < 6:175407/148‑1 (MQ=255) cTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTTACGTTCACCCACCACTGCGTATGc > 4:91385/1‑148 (MQ=255) gtgtCCACCACCGTGGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGc < 8:75104/148‑1 (MQ=255) cggggTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGGGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCAc < 5:39381/145‑1 (MQ=255) tGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCa < 3:148709/148‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAg > 5:60027/1‑147 (MQ=255) ccGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGt > 2:157082/1‑148 (MQ=255) gcgAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCg < 4:74494/148‑1 (MQ=255) gAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGgt < 5:130944/148‑1 (MQ=255) aaTACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTACGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGgtg < 1:37726/148‑1 (MQ=255) aCGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTg < 6:38416/148‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGGCAACGCTGAAAGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTgg > 4:55632/1‑147 (MQ=255) cgccggcAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCg < 3:137206/145‑1 (MQ=255) ggcAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGATGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATGTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGaa < 4:109553/148‑1 (MQ=255) cAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGc < 4:173071/148‑1 (MQ=255) gCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGcc > 7:93748/1‑148 (MQ=255) cGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCAc < 3:29777/148‑1 (MQ=255) gACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCAcg < 8:86031/148‑1 (MQ=255) tggAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTTAGGCCAGCGCCAGGTCGGTTTTGGTCAGCGGTAAGCTGACGGTCACGCGCAg < 4:126319/147‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGAc > 2:83852/1‑148 (MQ=255) gCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCCGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGAcc > 2:174940/1‑148 (MQ=255) aGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTg < 5:140847/148‑1 (MQ=255) aGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTg < 2:135191/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACATTGGCATc < 6:110291/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCCCGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATcc > 5:43233/1‑148 (MQ=255) tATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGa > 3:134086/1‑148 (MQ=255) tttGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGAg > 4:105942/1‑147 (MQ=255) tttGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGAg > 3:171069/1‑147 (MQ=255) tttGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGAg > 7:13926/1‑147 (MQ=255) | AGCACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGACCCCGATGTGTGTCCACCACCGTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGCTGAACGACTGGTGGAGATTGGCCAGCAAGCCCGGCCTATTTGGAAGTGACGTTCACCCACCACTGCGTATGCCGCTCGATCTTGACCGGCAACGCCGGCACCAGTGAGGCCAGCGCCAGGTCGGTGTTGGTCAGCGGGAAGCTGCCGGTCACGCGCAGGTCGGCGACCTTGGCATCCACCCCGAG > NC_002947/427908‑428199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |