New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 266739 = | 58 (1.170) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 7.6% | coding (449/1260 nt) | PP_0215 | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 266776 = | 42 (0.900) | coding (486/1260 nt) | PP_0215 | two‑component system response regulator |
CCTGCACCCCACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAGTTACGGCGGTGCTGATC > NC_002947/266593‑266884 | ccTGCACCCCACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGag > 1:280669/1‑148 (MQ=255) gCACCCCACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGagcagc > 5:18280/1‑149 (MQ=255) cacggtgcaatgccgcactattggcggcagcgatcagcaccgccgtaacttgcggatcgttacgcacttcctcttcgagcaccctgaggttcaggccctgggggttcagcgctcgattgatcgcaacctgcacatcggccAGCAGCg > 6:237352‑M1/141‑147 (MQ=255) cccACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCggcc > 3:135045/1‑146 (MQ=255) ccACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTcgc < 5:279403/149‑1 (MQ=255) cACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTcgcg > 8:193746/1‑149 (MQ=255) tACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTAccgc < 8:56882/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGAtg > 8:13045/1‑149 (MQ=255) aGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGAtg < 7:13045/148‑1 (MQ=255) acAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGAtggt < 1:208502/148‑1 (MQ=255) cAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGAtggtg > 7:101738/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCAGGCCGATGCCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCCGCGTTGCAGGCCGGGGCCACCCTGTCAGCCTCCCTTGAGCCGCGTCGCGCTACCGCCGAtgctg > 5:238495/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGAtggtgg > 4:244240/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCt > 6:197323/1‑134 (MQ=255) aGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCt < 5:197323/134‑1 (MQ=255) gCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGc > 8:208677/1‑149 (MQ=255) gCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCgc > 7:283252/1‑149 (MQ=255) cggAACCTGGCTAACCTGCGCAAGCGACTGCATGAGTAGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCACCGGCGCGCTAGCGCCGATGGTGGGCCgct < 6:238495/147‑1 (MQ=255) gcagcgatcagcaccgccgtaacttgcggatcgttacgcacttcctcttcgagcaccctgaggttcaggccctgggggttcagcgctcgattgatcgcaacctgcacatcggccAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCgctg < 1:135177‑M1/35‑1 (MQ=255) aaCCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCgctgct < 2:29166/149‑1 (MQ=255) gcgatcagcaccgccgtaacttgcggatcgttacgcacttcctcttcgagcaccctgaggttcaggccctgggggttcagcgctcgattgatcgcaacctgcacatcggccAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGctgctg > 2:135177‑M1/112‑149 (MQ=255) cTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGa < 2:242788/131‑1 (MQ=255) atGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGa > 1:242788/2‑131 (MQ=255) aTAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGAt < 5:176326/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGc < 4:220689/149‑1 (MQ=255) gcAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGtt < 6:18280/149‑1 (MQ=255) cAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTg < 7:208677/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGa > 8:176419/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGa < 3:154688/149‑1 (MQ=255) ttgcggatcgttacgcacttcctcttcgagcaccctgaggttcaggccctgggggttcagcgctcgattgatcgcaacctgcacatcggccAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCgctgc < 6:119114‑M1/36‑1 (MQ=255) ttgcggatcgttacgcacttcctcttcgagcaccctgaggttcaggccctgggggttcagcgctcgattgatcgcaacctgcacatcggccAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCgctgc > 5:119114‑M1/92‑127 (MQ=255) cgcCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGa > 2:283082/1‑148 (MQ=255) cgcCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGa < 1:283082/148‑1 (MQ=255) cgcCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGAt < 7:46994/149‑1 (MQ=255) cacgagTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGTTCGCCGGCCCGGTACCGGCGGTGCCGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCg < 8:196885/89‑1 (MQ=255) cAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCg > 7:196885/1‑92 (MQ=255) aaGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATc > 5:7386/1‑147 (MQ=255) ttGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCt < 5:324293/149‑1 (MQ=255) ctgGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAAc < 8:283252/147‑1 (MQ=255) ctgGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAAc < 7:176419/147‑1 (MQ=255) ggCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGACCAATCGAGCGCTGAAcccc > 6:26352/1‑148 (MQ=255) ccGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGAtg > 6:132148/1‑114 (MQ=255) ccGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGAtg > 6:136951/1‑114 (MQ=255) ccGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGAtg < 5:136951/114‑1 (MQ=255) ccGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGAtg < 5:132148/114‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAgg > 7:119525/1‑149 (MQ=255) gaggagATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGaa > 6:301048/1‑149 (MQ=255) tCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAgg < 3:244240/149‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAgg < 6:7386/149‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGACCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAgg < 5:26352/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAGCCTCAGGGTGc > 4:60096/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGc < 7:16635/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGc > 2:177171/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAgg < 7:230055/148‑1 (MQ=255) ccGGCGGTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGa < 8:101738/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGt < 1:177171/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGc < 8:119525/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGAGCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGc > 3:10712/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCAACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAAc > 1:60126/1‑149 (MQ=255) gggggCCACCCTGTCAGCCTAGCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATc < 2:280669/149‑1 (MQ=255) ccACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCaa < 7:193746/149‑1 (MQ=255) cACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAg > 8:208542/1‑149 (MQ=255) ccTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAGTTACGGCGGTg > 4:101728/1‑149 (MQ=255) tACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAGTTACGGCGGTGCt > 7:239030/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAGTTACGGCGGTGCTGATc > 7:58944/1‑149 (MQ=255) | CCTGCACCCCACGGCGTACCTGAGCAAGCCGCTGAACCTGGATAACCTGCGCAAGCGCCTGCAAGAGTTGCTGCTGGCCGTTGGCGAGGAGATCGCCTGCCCGGTACCGGCGTTGCAGGCGGGGGCCACCCTGTCAGCCTACCTTGAGCAGCGTCGCGCTACCGCCGATGGTGGGCCGCTGCTGGCCGATGTGCAGGTTGCGATCAATCGAGCGCTGAACCCCCAGGGCCTGAACCTCAGGGTGCTCGAAGAGGAAGTGCGTAACGATCCGCAAGTTACGGCGGTGCTGATC > NC_002947/266593‑266884 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |