New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 345396 = | 41 (0.830) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.8% | coding (207/1068 nt) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
? | NC_002947 | 345422 = | 44 (0.940) | coding (181/1068 nt) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
GCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAGGGCAGGT > NC_002947/345249‑345541 | gCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCg > 6:114718/1‑149 (MQ=255) tggtatgacgagcacggccggcacgacctgccctggcaacagggcatcacgccgtaccgggtgtgggtgtcggaaatcatgttgcagcagacccaggtcagcaccgtgctcaattacttcgaccgcttcatgcaggccctgccaaCGGt < 8:250007‑M1/4‑1 (MQ=255) cAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGt < 8:20591/149‑1 (MQ=255) gctgctCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAg < 1:226077/139‑1 (MQ=255) gctgctCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAg > 2:226077/1‑139 (MQ=255) ctCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTg > 1:148088/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGc > 6:304155/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGc < 5:290402/149‑1 (MQ=255) cTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGc < 2:148088/149‑1 (MQ=255) cgcgGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCt < 5:114718/148‑1 (MQ=255) ggAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCAt > 8:9860/1‑148 (MQ=255) gAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATg > 7:197315/1‑148 (MQ=255) gccgccATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGt > 7:100051/1‑149 (MQ=255) cgccATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCgg > 2:77241/1‑100 (MQ=255) cgccgtaccgggttgggtgtcggaaatcatgttgcagcagacccaggtcagcaccgtgctcaattacttcgaccgcttcatgcaggccctgccaaCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑Agg > 8:222804‑M1/96‑129 (MQ=255) cgccgtaccgggttgggtgtcggaaatcatgttgcagcagacccaggtcagcaccgtgctcaattacttcgaccgcttcatgcaggccctgccaaCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑Agg < 7:222804‑M1/34‑1 (MQ=255) ttGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAAt < 8:100051/149‑1 (MQ=255) gCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAAtt > 2:142137/1‑148 (MQ=255) gacgacgacCTTGGCGGCCTTTTGCAGGATGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCa > 5:31722/1‑149 (MQ=255) cgacgacCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACg > 4:86076/1‑149 (MQ=255) gacgacCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTTTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTTCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGc < 1:38243/146‑1 (MQ=255) gacgacCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGc > 2:38243/1‑145 (MQ=255) ccTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCt > 3:241880/1‑148 (MQ=255) ttGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGAc < 4:188443/149‑1 (MQ=255) ggaaatcatgttgcagcagacccaggtcagcaccgtgctcaattacttcgaccgcttcatgcaggccctgccaaCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTg > 5:223050‑M1/75‑103 (MQ=255) ggaaatcatgttgcagcagacccaggtcagcaccgtgctcaattacttcgaccgcttcatgcaggccctgccaaCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTg < 6:223050‑M1/29‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTctg < 3:86076/147‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTctgct < 8:197315/148‑1 (MQ=255) cgtgcgCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAg > 7:268520/1‑108 (MQ=255) cgtgcgCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAg < 8:268520/108‑1 (MQ=255) cgtgcgCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGa < 6:31722/148‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTc > 5:9231/1‑149 (MQ=255) gcgGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTcc > 2:35725/1‑148 (MQ=255) gcgGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCg < 4:241880/149‑1 (MQ=255) gggTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGac < 1:142137/149‑1 (MQ=255) gtagtaGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGacacc > 1:172882/1‑148 (MQ=255) agtagCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGacacccac > 7:169948/1‑149 (MQ=255) gtagCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGGCTGCTGGAACATGATTTCCGacacccaca > 5:263341/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCg > 8:195240/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCgg > 3:180126/1‑149 (MQ=255) ccGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGc > 1:316795/1‑149 (MQ=255) ccGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGc > 7:250007/1‑149 (MQ=255) ccGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGc > 3:195826/1‑149 (MQ=255) acaGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATg > 7:217968/1‑149 (MQ=255) gcaCTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGacacccacacc > 1:200731/1‑125 (MQ=255) gcaCTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGacacccacacc < 2:200731/125‑1 (MQ=255) gcaCTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGAGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGc > 1:281032/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAgg > 1:294115/1‑149 (MQ=255) gTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAGGGCa < 1:35725/149‑1 (MQ=255) tcctccGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAGGGCAg < 2:316795/149‑1 (MQ=255) ctccGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAGGGCAGGt > 2:121199/1‑149 (MQ=255) | GCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGC‑AGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTGCTGCAACATGATTTCCGACACCCACACCCGGTACGGCGTGATGCCCTGTTGCCAGGGCAGGT > NC_002947/345249‑345541 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |