New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 440717 | 46 (0.930) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.3% | coding (658/1059 nt) | bioB | biotin synthase |
? | NC_002947 | = 440759 | 45 (0.960) | coding (700/1059 nt) | bioB | biotin synthase |
CCACGCGTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCG > NC_002947/440574‑440864 | ccacGCGTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAacac > 1:145211/1‑149 (MQ=255) cacGCGTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACAcc > 7:4185/1‑149 (MQ=255) cgcgTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCg < 5:194563/149‑1 (MQ=255) cgTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGa < 3:278696/149‑1 (MQ=255) tACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCGTGGCCTAGGTGCGCGACGCCGGTATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCATGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGt < 6:264863/149‑1 (MQ=255) tACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGt < 4:52545/149‑1 (MQ=255) cTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCgg < 8:4185/149‑1 (MQ=255) cTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCgg > 7:123335/1‑149 (MQ=255) tACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGt > 1:184357/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGt < 5:219643/147‑1 (MQ=255) cTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACAt > 3:42245/1‑149 (MQ=255) cAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCt < 2:184357/149‑1 (MQ=255) gACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTgg < 8:40714/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGt > 2:81200/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGccaccttgaccagcatgttgatcggcaccgactccg > 5:70044‑M1/1‑113 (MQ=255) ccTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTc > 3:264434/1‑148 (MQ=255) gCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAg < 1:81200/147‑1 (MQ=255) cgcgACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGccaccttgaccagcatgttgatcggcaccgactccgggtgttccggcag < 6:70044‑M1/149‑50 (MQ=255) gCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCgct < 4:213151/149‑1 (MQ=255) gATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCgctggct > 8:267392/1‑148 (MQ=255) aTGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGa < 4:264434/149‑1 (MQ=255) gAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAAc > 8:94729/1‑112 (MQ=255) gAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAAc < 7:94729/112‑1 (MQ=255) aaaTCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGccaccttgaccagcatgttgatcggcaccgactccgggtgttccggca < 4:18228‑M1/132‑49 (MQ=255) aaaTCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGccaccttgaccagcatgttgatcggcaccgactccgggtgttacggca > 3:18228‑M1/1‑84 (MQ=255) aTCTGCTCTGGTGGCATTCTGTGCATGGGTTAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACGCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAaga < 8:10197/149‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCAGGCTGAGGAAGAGGAc > 8:124725/1‑149 (MQ=255) ctctGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGa < 8:123335/147‑1 (MQ=255) gtggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCAGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAc < 7:124725/149‑1 (MQ=255) gtggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGACGGCCTGCTGATCCAGCTGGACAACCTGCCGGAAAACCCGGACTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTAAAGGAGCACGCCACGACGCAGGCTAAGTAACAAGACGtaac > 5:139806/1‑145 (MQ=255) tggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAcc > 3:266772/1‑149 (MQ=255) cATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAAc < 4:208048/94‑1 (MQ=255) cATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAAc > 3:208048/1‑94 (MQ=255) ggCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGAc < 7:267392/147‑1 (MQ=255) cATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTa < 2:145211/149‑1 (MQ=255) tGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAACGGGTCGAcgtcctc < 4:42245/149‑7 (MQ=255) gTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCg > 6:146366/1‑148 (MQ=255) tGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTa < 4:266772/149‑1 (MQ=255) gAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGt > 6:285969/1‑133 (MQ=255) gAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGt < 5:285969/133‑1 (MQ=255) aCCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGcc > 8:124364/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGCCGGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGccc < 8:296757/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGc > 7:50204/1‑141 (MQ=255) cGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGc < 8:50204/141‑1 (MQ=255) gATACAGCTGGCCAACCTGCCTGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGccc < 6:139806/148‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGccc < 5:146366/147‑1 (MQ=255) aGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGATGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGtc > 6:226073/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCAGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGAACCTCATGCCCAActct > 4:142139/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGtct > 7:240721/1‑148 (MQ=255) aCCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTgcgc < 7:124364/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGcc > 4:107328/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattttcatcccggcgtcgcg < 6:70044‑M2/149‑101 (MQ=255) tGCCGTAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattt > 3:18228‑M2/1‑48 (MQ=255) tGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattt < 4:18228‑M2/132‑85 (MQ=255) cGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGt < 1:199775/132‑1 (MQ=255) cGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGt > 2:199775/1‑132 (MQ=255) ggAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTccg > 7:79900/1‑149 (MQ=255) | CCACGCGTACCTACAGCGAGCGCCTGCAGACCCTGGCCTACGTGCGCGACGCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCG > NC_002947/440574‑440864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |