New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 440717 | 46 (0.930) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.3% | coding (658/1059 nt) | bioB | biotin synthase |
? | NC_002947 | = 440759 | 45 (0.960) | coding (700/1059 nt) | bioB | biotin synthase |
GCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAGGCCCTGGCCT > NC_002947/440624‑440906 | gCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCgct < 4:213151/149‑1 (MQ=255) gATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCgctggct > 8:267392/1‑148 (MQ=255) aTGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGa < 4:264434/149‑1 (MQ=255) aTCTGCTCTGGTGGCATTCTGTGCATGGGTTAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACGCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAaga < 8:10197/149‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCAGGCTGAGGAAGAGGAc > 8:124725/1‑149 (MQ=255) ctctGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGa < 8:123335/147‑1 (MQ=255) gtggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCAGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAc < 7:124725/149‑1 (MQ=255) gtggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGACGGCCTGCTGATCCAGCTGGACAACCTGCCGGAAAACCCGGACTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTAAAGGAGCACGCCACGACGCAGGCTAAGTAACAAGACGtaac > 5:139806/1‑145 (MQ=255) tggCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAcc > 3:266772/1‑149 (MQ=255) ggCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGAc < 7:267392/147‑1 (MQ=255) cATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTa < 2:145211/149‑1 (MQ=255) tGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGAACGGGTCGAcgtcctc < 4:42245/149‑7 (MQ=255) gTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCg > 6:146366/1‑148 (MQ=255) tGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTa < 4:266772/149‑1 (MQ=255) gAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGt > 6:285969/1‑133 (MQ=255) gAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGt < 5:285969/133‑1 (MQ=255) aCCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGcc > 8:124364/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGCCGGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGccc < 8:296757/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGc > 7:50204/1‑141 (MQ=255) cGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGc < 8:50204/141‑1 (MQ=255) gATACAGCTGGCCAACCTGCCTGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGccc < 6:139806/148‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGccc < 5:146366/147‑1 (MQ=255) aGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGATGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGtc > 6:226073/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCAGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGAACCTCATGCCCAActct > 4:142139/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGtct > 7:240721/1‑148 (MQ=255) aCCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTgcgc < 7:124364/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGcc > 4:107328/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattttcatcccggcgtcgcg < 6:70044‑M2/149‑101 (MQ=255) tGCCGTAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattt > 3:18228‑M2/1‑48 (MQ=255) tGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattt < 4:18228‑M2/132‑85 (MQ=255) cGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGt > 2:199775/1‑132 (MQ=255) cGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGt < 1:199775/132‑1 (MQ=255) ggAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTccg > 7:79900/1‑149 (MQ=255) acCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCAGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCgccggc > 4:280631/1‑149 (MQ=255) ccGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCgccggccg > 3:104502/1‑149 (MQ=255) cGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGccggcaggttggccagctggatcagcaggccggcgcggtcatccagcgattcacccatgcccagaatgccaccagagcagattttcatcccggcgtcgcgcacgtaggccagg > 5:70044‑M2/1‑36 (MQ=255) gTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGAt < 3:107328/149‑1 (MQ=255) gATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATc < 2:265405/97‑1 (MQ=255) gATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATc > 1:265405/1‑97 (MQ=255) aTCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAAc > 6:111819/1‑147 (MQ=255) aTCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCAAGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAAc > 7:251364/1‑147 (MQ=255) tCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGa < 5:226073/148‑1 (MQ=255) aCATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGa > 7:274619/1‑37 (MQ=255) aCATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGa < 8:274619/37‑1 (MQ=255) tGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAg > 4:220524/1‑149 (MQ=255) tGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCACGAGCAGATGAACGAGCAGATGc < 1:182080/147‑1 (MQ=255) tGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCACGAGCAGATGAACGAGCAGATGc > 2:182080/1‑147 (MQ=255) gTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAg < 8:240721/147‑1 (MQ=255) gTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAGGc > 4:280164/1‑149 (MQ=255) gCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAGGCCCTGGCCt > 3:52651/1‑148 (MQ=255) | GCCGGGATGAAAATCTGCTCTGGTGGCATTCTGGGCATGGGTGAATCGCTGGATGACCGCGCCGGCCTGCTGATCCAGCTGGCCAACCTGCCGGAACACCCGGAGTCGGTGCCGATCAACATGCTGGTCAAGGTGGCCGGCACGCCGCTGGCTGAGGAAGAGGACGTCGACCCGTTCGACTTTATCCGTATGCTGGCCGTGGCCCGGATCCTCATGCCCAAGTCTCACGTGCGCCTGTCCGCCGGCCGCGAGCAGATGAACGAGCAGATGCAGGCCCTGGCCT > NC_002947/440624‑440906 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |