New junction evidence | |||||||||||
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CACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGAC > NC_002947/741322‑741609 | cacGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt < 8:85762/149‑1 (MQ=255) cacGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt > 7:152082/1‑149 (MQ=255) cacGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt < 3:238700/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgtg > 6:160501/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgtg < 5:160501/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgtg > 4:127364/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgt > 7:183735/1‑148 (MQ=255) gCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTtgt < 8:183735/148‑1 (MQ=255) gtAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTgcgc > 6:291382/1‑148 (MQ=255) gCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAg < 3:127364/148‑1 (MQ=255) cTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCATTAGTGGTATATGGCGAAGTTTCTCGCTACATGGCACAAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTTTGTgcgc > 1:256457/1‑148 (MQ=255) cTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAgg > 5:270713/1‑148 (MQ=255) cAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGGCGCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCAt > 2:65269/1‑149 (MQ=255) aGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATg < 8:152082/149‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGgcgc > 2:81095/1‑149 (MQ=255) tAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt > 3:296933/1‑127 (MQ=255) tAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCtttttt < 4:296933/127‑1 (MQ=255) gagCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATACAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTg > 5:100043/1‑149 (MQ=255) 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ccTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAgtg < 8:212518/148‑1 (MQ=255) gCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTa < 2:230785/147‑1 (MQ=255) gCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTa < 3:173885/147‑1 (MQ=255) ccAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCgg > 5:169325/1‑149 (MQ=255) cAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCg > 7:71328/1‑147 (MQ=255) aTAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg > 3:230949/1‑149 (MQ=255) tAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATCGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGc < 6:288045/149‑1 (MQ=255) aGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAgggg > 8:10586/1‑131 (MQ=40) aGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAgggg < 7:10586/131‑1 (MQ=40) aGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAgg < 7:153773/149‑1 (MQ=38) gCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAggg > 6:284822/1‑149 (MQ=37) gCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAggg > 3:116779/1‑149 (MQ=37) cGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAggg < 7:100627/123‑1 (MQ=38) cGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTCGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAggg > 8:100627/1‑123 (MQ=38) gtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCgg < 5:284822/148‑1 (MQ=32) tgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGTCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGt < 3:157398/149‑1 (MQ=17) gCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCAAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGt > 2:144209/1‑148 (MQ=17) gggCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGAc > 3:35296/1‑149 (MQ=32) gggCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGAc > 3:230525/1‑149 (MQ=32) | CACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGT‑‑TGGTCTATGGCGA‑‑TTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGAC > NC_002947/741322‑741609 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |