New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 936444 = | 45 (0.910) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.5% | coding (9178/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 936481 = | 43 (0.910) | coding (9141/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CTTCCACCTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGCTCGCCACGGCCAGACAC > NC_002947/936300‑936591 | gccgacgtggtggcaagcgatggcagcctggccgtgtctggccgtggcgagcccggtgccacagtggaagtgcgtgatgcccagggcgcagtcatcggtactggcaccgtggcgccaaatggcaccttcgtgattgacctggagGCAcc < 7:125932‑M1/5‑1 (MQ=255) ttCCACCTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCAc > 1:290095/1‑147 (MQ=255) ccACCTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCa < 5:290249/147‑1 (MQ=255) aCCTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCAc > 4:247082/1‑149 (MQ=255) cTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGa < 7:241249/149‑1 (MQ=255) ggTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGt > 1:30005/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTtctc < 7:245278/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCa < 2:170114/146‑1 (MQ=255) ggTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGc > 8:31564/1‑149 (MQ=255) ccGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCg < 7:31564/148‑1 (MQ=255) ggAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTg > 4:85533/1‑149 (MQ=255) ggAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTg > 6:150084/1‑149 (MQ=255) gAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGc < 6:284356/149‑1 (MQ=255) gAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGc > 5:70062/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCt < 5:257758/149‑1 (MQ=255) gccgtggcgagcccggtgccacagtggaagtgcgtgatgcccagggcgcagtcatcggtactggcaccgtggcgccaaatggcaccttcgtgattgacctggagGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCa > 2:197542‑M1/105‑146 (MQ=255) ccGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAAt < 3:85533/149‑1 (MQ=255) gTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCa < 6:70062/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCAc > 5:290409/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACg > 3:51798/1‑148 (MQ=255) caccacGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGACAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCAt > 5:93839/1‑149 (MQ=255) cgccgcTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGgc < 3:247082/149‑1 (MQ=255) tCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACg > 8:69565/1‑149 (MQ=255) gggCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACg < 6:93839/147‑1 (MQ=255) gggCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGt < 2:30005/149‑1 (MQ=255) ggCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGaa < 4:84374/127‑1 (MQ=255) ggCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGaa > 3:84374/1‑127 (MQ=255) gCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGc < 7:110058/149‑1 (MQ=255) cagggcgcagtcatcggtactggcaccgtggcgccaaatggcaccttcgtgattgacctggagGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGc > 8:162680‑M1/64‑100 (MQ=255) cagggcgcagtcatcggtactggcaccgtggcgccaaatggcaccttcgtgattgacctggagGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGc < 7:162680‑M1/37‑1 (MQ=255) aGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGAt > 6:253458/1‑149 (MQ=255) cGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCCATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGa < 7:69565/149‑1 (MQ=255) gtgtATGGGCAACTGTCACGCTGACCCAGGCCTAGGTATGGCCGTCGGCATCGGGCTGCACCAGCTCGATGGTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACt < 7:263317/149‑1 (MQ=255) gtgtATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACt > 7:266032/1‑149 (MQ=255) tATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTgc < 4:51798/148‑1 (MQ=255) gCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCCCCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGAGGACTGCGCCCTg > 7:160530/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCCCGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTg < 8:257406/149‑1 (MQ=255) gCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTg > 4:142052/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTggg < 8:266032/149‑1 (MQ=255) ggTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCa < 3:123665/124‑1 (MQ=255) ggTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCa > 4:123665/1‑124 (MQ=255) ggTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCAt > 6:165798/1‑149 (MQ=255) ccccTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTc > 7:137951/1‑148 (MQ=255) cccTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCa < 5:253458/149‑1 (MQ=255) tGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGAt > 3:177381/1‑117 (MQ=255) tGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGAt < 4:177381/117‑1 (MQ=255) ccGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACtgtg < 8:137951/149‑1 (MQ=255) aGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCa > 8:125932/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGc < 3:142052/148‑1 (MQ=255) gCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGCt > 7:247577/1‑149 (MQ=255) gTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGCTCGCCACGGCCAGa > 5:252286/1‑149 (MQ=255) tGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGCTCGCCACGGCCAGacac > 3:296199/1‑149 (MQ=255) | CTTCCACCTGGGTATCTGCCGGTGCGGTACCGGAAACGCTGGAGCCGTCACCGGCCACCACCACGCCGCTCGGGCTTTCGGGCAGCGGTGTATCGGCAACGGTCACGCTGACCCCTGCCGAGGTATTGCCGGCGGCATCGGTCTGCACCAGCACGAGGTTCTCACCTGCGGCCAGCGGTGCCTCCAGGTCAATCACGAAGGTGCCATTTGGCGCCACGGTGCCAGTACCGATGACTGCGCCCTGGGCATCACGCACTTCCACTGTGGCACCGGGCTCGCCACGGCCAGACAC > NC_002947/936300‑936591 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |