New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1195712 | 47 (0.950) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (202/426 nt) | xcpP | type II secretion pathway protein XcpP |
? | NC_002947 | = 1195767 | 55 (1.140) | coding (257/426 nt) | xcpP | type II secretion pathway protein XcpP |
TTTCTGCGCAGTGTGTGCTGCAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTT > NC_002947/1195566‑1195860 | tttCTGCGCAGTGTGTGCTGCAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCAGGGCGCCTGGGGGGGCCGACAGCCCGCGGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTg < 5:54098/149‑1 (MQ=255) gtgtgtGCTGCAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTcg < 8:238586/149‑1 (MQ=255) gtgtgCTGCAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTcggc < 6:87092/149‑1 (MQ=255) gctgcAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGcc > 7:34594/1‑149 (MQ=255) gctgcAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGcc > 7:29696/1‑149 (MQ=255) tgcAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCCTCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCt > 1:143010/1‑148 (MQ=255) tgcAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCt > 1:16232/1‑148 (MQ=255) gcAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTc > 2:199286/1‑148 (MQ=255) gCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAg > 6:184109/1‑149 (MQ=255) aGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTg < 1:199286/149‑1 (MQ=255) ccACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGgc > 1:2657/1‑149 (MQ=255) ccACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGgc < 2:16232/149‑1 (MQ=255) cacaCCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgag > 5:66720‑M1/1‑111 (MQ=255) ccGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAg > 8:171508/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTgtggt < 2:2657/149‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTg > 8:34594‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTg > 8:29696‑M2/1‑148 (MQ=255) cGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcgg < 6:66720‑M1/149‑60 (MQ=255) gTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGTCTGATGGTTGGGCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcggca < 4:191829‑M1/149‑62 (MQ=255) tGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTAc < 5:294352/149‑1 (MQ=255) gCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACg < 7:171508/148‑1 (MQ=255) ccGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGc > 5:43233/1‑149 (MQ=255) gACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGc > 4:23984/1‑147 (MQ=255) cccGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAg > 7:74143/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCa > 7:180243/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGccc < 2:143010/148‑1 (MQ=255) tggttggtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcgc < 8:74143/149‑1 (MQ=255) ggtCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGt > 4:63215/1‑147 (MQ=255) tCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCACTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAgc > 7:101623/1‑149 (MQ=255) cACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcgcg > 8:285338/1‑142 (MQ=255) cACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCcgcg < 7:285338/142‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAgcgc > 8:203025/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGcc > 5:165495/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTgg > 1:278651/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGgcgc > 8:115161/1‑147 (MQ=255) gccgccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAg < 7:203025/149‑1 (MQ=255) gccgccCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAg < 7:115161/149‑1 (MQ=255) ccGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATc < 2:278651/149‑1 (MQ=255) acgacgGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGtg > 4:294126/1‑149 (MQ=255) catcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCg > 6:133339/1‑137 (MQ=255) catcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCg < 5:133339/137‑1 (MQ=255) catcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACa > 6:59427/1‑149 (MQ=255) catcaccatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGAGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACa < 5:184109/149‑1 (MQ=255) accatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGa > 4:222905/1‑149 (MQ=255) accatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGa > 8:250290/1‑149 (MQ=255) accatcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGa < 3:63215/149‑1 (MQ=255) catcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGa > 1:76753/1‑147 (MQ=255) catcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGa > 5:38215/1‑147 (MQ=255) tcacTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGc < 6:43233/149‑1 (MQ=255) tCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATc > 7:248088/1‑139 (MQ=255) tCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATc < 8:248088/139‑1 (MQ=255) gTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGc > 4:19792/1‑149 (MQ=255) tCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGcc < 2:76753/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTgcggcagacgagtgatggtgatggcgccgtcgtcgggcggcgcctgccagtgcccaaccatcagaccgggcagcgggctgtcggccac < 4:191829‑M2/149‑89 (MQ=255) ccGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTgcggcagacgagtgatggtgatggcgccgtcgtcgggcggcgcctgccagtgaccaaccatcagcccgggcagcgggctgtcggccaccg < 6:66720‑M2/149‑91 (MQ=255) ccGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGtgctgc > 2:108699/1‑124 (MQ=255) cGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAtt > 7:205354/1‑149 (MQ=255) gCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGc < 4:214332/142‑1 (MQ=255) gCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGc > 3:214332/1‑142 (MQ=255) gCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAttt > 5:83027/1‑149 (MQ=255) cagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcggcagacgagtgatggtgatggcgccgtcgtcgggcggcgcctgccagtgaccaaccatcagcccgggcagcgggctgtcggccaccgcag > 8:29696‑M1/1‑1 (MQ=255) cagcaccaccacactggcggccaatggctgggccttgaggccgccgaggtattgcagcggcagacgagtgatggtgatggcgccgtcgtcgggcggcgcctgccagtgaccaaccatcagcccgggcagcgggctgtcggccaccgcag > 8:34594‑M1/1‑1 (MQ=255) cTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAtttt < 3:294126/149‑1 (MQ=255) cTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGAtttt < 3:23984/149‑1 (MQ=255) | TTTCTGCGCAGTGTGTGCTGCAGTTGAGCCGGCAGCCACACCCGGCCACGGCGCCTGCGGTGGCCGACAGCCCGCTGCCCGGGCTGATGGTTGGTCACTGGCAGGCGCCGCCCGACGACGGCGCCATCACCATCACTCGTCTGCCGCTGCAATACCTCGGCGGCCTCAAGGCCCAGCCATTGGCCGCCAGTGTGGTGGTGCTGCGCTACGGCGAGCAAGTGCGCACCCTGGCCCGCGGTCAGCGCCTGGCGCCAGGGATCGTGCTGCAGGACATCGACAGCGATGGCCTGATTTT > NC_002947/1195566‑1195860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |