New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1446314 = | 39 (0.790) | 8 (0.170) | 6/246 | NT | 16.6% | coding (412/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
? | NC_002947 | 1446376 = | 43 (0.910) | coding (474/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
TTCGGCGATGATGGTGGCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGCCAGTGCCG > NC_002947/1446166‑1446458 | ttCGGCGATGATGGTGGCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTaca > 6:265272/1‑149 (MQ=255) acgcagggcctcgaccaccaccccggcaaacacgccaaagcgctggtacagggcgttgcgcattgcggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccata > 1:50235‑M1/149‑149 (MQ=255) cgcagggcctcgaccaccaccccggcaaacacgccaaagcgctggtacagggcgttgcgcattgcggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatAc > 7:65630‑M1/148‑149 (MQ=255) cGGCGATGATGGTGGCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTacac < 6:116305/148‑1 (MQ=255) atgGTGGCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCgat < 7:94217/149‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCgat > 4:190968/1‑148 (MQ=255) cgcTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGc < 1:137947/149‑1 (MQ=255) cgcTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGc < 3:242772/149‑1 (MQ=255) caccccggcaaacacgccaaagcgctggtacggggcgttgcgcattgcggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGcc < 4:199013‑M1/19‑1 (MQ=255) caccccggcaaacacgccaaagcgctggtacagggcgttgcgcattgcggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGcc < 8:201232‑M1/19‑1 (MQ=255) aTCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGcc < 7:9321/149‑1 (MQ=255) aTCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGtgct < 5:282408/149‑1 (MQ=255) tCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCga > 7:290737/1‑126 (MQ=255) tCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCga < 8:290737/126‑1 (MQ=255) caaagcgctggtacagggcgttgcgcattgcggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAacac < 3:264336‑M1/36‑1 (MQ=255) gCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTacac < 7:236653/114‑1 (MQ=255) gCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTacac > 8:236653/1‑114 (MQ=255) acacCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGAc > 1:136658/1‑149 (MQ=255) tttCTGCCCAGCCTGGCGCTTTGGGAGGGCCTGTTCTCGGCCGGTTCCAAGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACAGCAGCGATGATCGGCCCGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGtt < 1:203846/146‑1 (MQ=255) tttCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCAt < 3:190968/149‑1 (MQ=255) tCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATg > 7:246093/1‑148 (MQ=255) gCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGc > 3:123466/1‑109 (MQ=255) gCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGc < 4:123466/109‑1 (MQ=255) gCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAgg < 7:49281/137‑1 (MQ=255) gCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAgg > 8:49281/1‑137 (MQ=255) cccgCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCg < 4:90850/146‑1 (MQ=255) ccgCCGGGCGCGGTGGGTGGGCCTGTGCGCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCGGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATg < 8:130512/140‑1 (MQ=255) cAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATg > 7:130512/1‑142 (MQ=255) gCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTa < 5:265272/149‑1 (MQ=255) cggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATg > 4:264336‑M1/84‑148 (MQ=255) ggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggc > 7:201232‑M1/83‑149 (MQ=255) ggcactggccgactgcggcaggatcgcggcactgacgaaggtcgacaccagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggc > 3:199013‑M1/83‑149 (MQ=255) gcgcTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcg > 3:283749/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcg > 2:19129/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcgggcg > 1:201573/1‑149 (MQ=255) ggtgggCCTGTGCTCGGCCGGTTCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCTGGCGCTg < 2:136658/148‑1 (MQ=255) ggtgggCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTgg < 8:273183/149‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcggg > 6:211/1‑136 (MQ=255) cTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcggg < 5:211/136‑1 (MQ=255) ggTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTACATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCt < 1:222424/149‑1 (MQ=255) gTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTg < 1:19129/149‑1 (MQ=255) cATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGgtgt > 6:19464/1‑149 (MQ=255) ccGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCg > 5:126187/1‑149 (MQ=255) ccGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCg > 1:95277/1‑149 (MQ=255) cagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcggg < 2:143988‑M1/70‑1 (MQ=255) cagaatacccagggcgatttccagcgcccgccatACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATggcggg > 1:143988‑M1/35‑104 (MQ=255) ccTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGAGCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATc < 8:246093/149‑1 (MQ=255) cTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATcc > 4:151622/1‑149 (MQ=255) tGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTg < 2:143946/148‑1 (MQ=255) tGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTg > 1:143946/1‑148 (MQ=255) gctggctgGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGATATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCgg > 5:95273/1‑149 (MQ=255) ctggctggCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGc < 4:283749/149‑1 (MQ=255) tggctACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGCCAGTg > 6:235512/1‑149 (MQ=255) gctACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGCCAGTGcc > 6:73290/1‑149 (MQ=255) tACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGAGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTCGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGCCATTGCCg > 7:138124/1‑148 (MQ=255) cacCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTg < 7:1799/127‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTg > 8:1799/1‑127 (MQ=255) | TTCGGCGATGATGGTGGCGCTGATCGCCATCTTCCCGCAGAACACCGAGCTGTTTCTGCCCAGCCTGGCGCTGTGGGTGGGCCTGTGCTCGGCCGGTGCCATGCGCTACCGCACCTTCCGCGCCTATGGTTTCGTGCTGGCTGGCTACACCGCAGCGATGATCGGCCTGCCGGTGCTGCAACACCCCGACCAGGCGTTCATGGCAGCGGTATGGCGGGCGCTGGAAATCGCCCTGGGTATTCTGGTGTCGACCTTCGTCAGTGCCGCGATCCTGCCGCAGTCGGCCAGTGCCG > NC_002947/1446166‑1446458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |