New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1733577 | 37 (0.750) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 10.7% | coding (293/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
? | NC_002947 | = 1733600 | 32 (0.690) | coding (270/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
ACTTCTTCACGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGG > NC_002947/1733430‑1733723 | aCTTCTTCACGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGaa > 8:264432/1‑149 (MQ=255) aCTTCTTCACGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGaa > 6:257824/1‑149 (MQ=255) ttcttcACGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAAct > 8:32811/1‑149 (MQ=255) aCGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCg < 6:236747/148‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAg < 7:264432/149‑1 (MQ=255) cGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGtcggcc < 5:283170‑M2/149‑7 (MQ=255) ccaccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg < 8:75156/149‑1 (MQ=255) accaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGt > 2:272547/1‑149 (MQ=255) accaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGAGGCAAATTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATACCCACCGTCACACGCACGCCCAACTCCTCGGCCAGCCGCGCGACGTCGGCCTggct > 8:219218/1‑147 (MQ=255) ccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAcgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctg > 4:36005‑M1/1‑114 (MQ=255) ccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAcgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctg < 3:36005‑M1/145‑32 (MQ=255) accCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCCCCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg > 4:49164/1‑144 (MQ=255) accCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg < 3:49164/144‑1 (MQ=255) ccGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAcgtcccgcgcctggccgaggagttcggcct < 7:116852‑M1/140‑31 (MQ=255) ccGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAcgtcccgcgcctggccgaggagttcggcct > 8:116852‑M1/1‑110 (MQ=255) cGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTc > 4:72934/1‑149 (MQ=255) accacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCAc < 4:47319/149‑1 (MQ=255) ccacGCTGCGAGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCTGCCTGGGTGCCTTCCACg < 7:219218/149‑1 (MQ=255) acGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGcc > 8:280638/1‑114 (MQ=255) acGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGcc < 7:280638/114‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGta < 3:50909/149‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGta < 8:243184/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGta > 2:130698/1‑148 (MQ=255) cgACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCCTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATAc < 6:159985/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCGAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCg < 3:30135/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGt < 2:33969/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTc < 1:272547/149‑1 (MQ=255) gCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCg < 8:104365/132‑1 (MQ=255) gCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCg > 7:104365/1‑132 (MQ=255) aTTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTc < 5:257824/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGt > 4:38829/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTtcg > 4:209441/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTtc < 3:72934/147‑1 (MQ=255) gTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTcgtcgt < 7:32811/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTg < 1:130698/149‑1 (MQ=255) tGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTgggg > 1:178191/1‑149 (MQ=255) aTCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGttt > 2:56028/1‑104 (MQ=255) aTCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGttt < 1:56028/104‑1 (MQ=255) cATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACt > 8:112959/1‑148 (MQ=255) cccAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCtt > 1:125591/1‑149 (MQ=255) cccAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCtt < 3:209441/149‑1 (MQ=255) cGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGGCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGTGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTc < 3:38829/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTa > 4:294191/1‑127 (MQ=255) gCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTa < 3:294191/127‑1 (MQ=255) cAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGtcggcctgcgggtgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtgg > 4:36005‑M2/1‑31 (MQ=255) cAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGtcggcctgcgggtgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtgg < 3:36005‑M2/145‑115 (MQ=255) cAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGc > 2:279982/1‑149 (MQ=255) aGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGtcggcctgcgggtgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgg < 7:116852‑M2/140‑111 (MQ=255) aGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGtcggcctgcgggtgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgg > 8:116852‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCCGAcgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgcgggtgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtggtggtcg < 5:283170‑M1/149‑144 (MQ=255) cGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAgg > 7:62616/1‑149 (MQ=255) | ACTTCTTCACGGAACAGCGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGG > NC_002947/1733430‑1733723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |