New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2491759 | 42 (0.850) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.5% | coding (1182/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 2491788 | 47 (1.010) | coding (1211/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
AACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCG > NC_002947/2491631‑2491905 | aaCGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTAGGTAACAACAACGTCGACAACTGCGCACGGGTATGCCATTCGCACACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCAAGCAAAGCTTCGAATc > 5:156624/1‑149 (MQ=255) agaagCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGa > 1:302571/1‑149 (MQ=255) agaagCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCCCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGa < 2:189415/149‑1 (MQ=255) ccTATCTGGTGCAGCACCTGGTGCGCACGGCGTGGGGTAACAACAACGGCGACACCTGCGCGCGGGGATGCCATACGCCCACCGGTTATGGGCGGAAGCGGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGGACGCGCAGGTTCGAGGCGGTGAGGCAg > 4:228848/1‑149 (MQ=255) tATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggc < 2:188370‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggcc < 8:167550‑M2/149‑5 (MQ=255) tGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCtgcatcaccgagtcgaagctttgcgtgccggccgac > 5:258270‑M1/1‑113 (MQ=255) gTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGCCTCCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCACATCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCtgcatcaccgagtcgaagctttgcgtgccggccgac < 2:250267‑M1/147‑37 (MQ=255) gTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCtgcatcaccgagtcgaagctttgcgtgccggccgactc < 6:258270‑M1/149‑39 (MQ=255) tGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGtt < 5:269507/149‑1 (MQ=255) tGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATACGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGtt < 3:228848/149‑1 (MQ=255) gAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCGGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGc < 3:105895/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGt < 3:204549/149‑1 (MQ=255) cgcACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTg < 1:188370/148‑1 (MQ=255) cgcACGGCATTCGTTAACAACATCGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCGACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTg < 6:156624/148‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGAt > 7:284722/1‑147 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGAt < 8:284722/147‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATgc < 5:81790/149‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCGTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATgc > 8:117997/1‑149 (MQ=255) acacCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGgtg > 2:189319/1‑149 (MQ=255) acCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGCCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGtt > 3:48347/1‑149 (MQ=255) gcACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTc > 6:228273/1‑149 (MQ=255) aCGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCg > 2:112311/1‑148 (MQ=255) ggTATGGCATTCGGCCACCGGTTATGGCGTGAAGCAGTCCCTTGGTGAGTCGGGCGGCACGAAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCaa < 1:109960/148‑1 (MQ=255) gTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg < 3:102734/132‑1 (MQ=255) gTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg > 4:102734/1‑132 (MQ=255) ccATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc < 5:228273/149‑1 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc > 6:51831/1‑141 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc < 5:51831/141‑1 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTg > 1:228210/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGGAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGgc > 1:222989/1‑93 (MQ=255) aCCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGgc < 2:222989/93‑1 (MQ=255) ttATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAg < 1:189319/149‑1 (MQ=255) tATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGc < 6:314612/120‑1 (MQ=255) tGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAggg < 7:167550/148‑1 (MQ=255) ccTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGgcgc > 6:29225/1‑149 (MQ=255) ccTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGgcgc > 1:75141/1‑149 (MQ=255) gCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtga > 1:156766/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgt > 5:197031/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgt > 7:159571/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgtga > 6:192476/1‑149 (MQ=255) gggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcg > 6:14788/1‑143 (MQ=255) gggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcg < 5:14788/143‑1 (MQ=255) ggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGa < 2:302571/149‑1 (MQ=255) gTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCgg > 6:14837/1‑97 (MQ=255) gTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCgg < 5:14837/97‑1 (MQ=255) gAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcac < 6:258270‑M2/149‑112 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcacca > 5:258270‑M2/1‑36 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccgatgtgcgaatggcatacccgtgcgcaggaggcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcac < 2:250267‑M2/147‑112 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCAc < 6:197031/149‑1 (MQ=255) ggCCtgcatcaccgagtcgaagctttgcgtgccggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcaccagat < 8:167550‑M1/149‑146 (MQ=255) gccggcACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTc > 2:108816/1‑87 (MQ=255) gCCtgcatcaccgagtcgaagctttgcgtgccggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcaccagata < 2:188370‑M1/149‑147 (MQ=255) | AACGAAGAAGCCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCG > NC_002947/2491631‑2491905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |