New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2491759 | 42 (0.850) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.5% | coding (1182/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 2491788 | 47 (1.010) | coding (1211/2883 nt) | PP_2185 | formate dehydrogenase subunit alpha |
CCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTGGTCGACTCGCCGCAC > NC_002947/2491641‑2491930 | ccTATCTGGTGCAGCACCTGGTGCGCACGGCGTGGGGTAACAACAACGGCGACACCTGCGCGCGGGGATGCCATACGCCCACCGGTTATGGGCGGAAGCGGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGGACGCGCAGGTTCGAGGCGGTGAGGCAg > 4:228848/1‑149 (MQ=255) tATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggc < 2:188370‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggcc < 8:167550‑M2/149‑5 (MQ=255) tGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGtt < 5:269507/149‑1 (MQ=255) tGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATACGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGtt < 3:228848/149‑1 (MQ=255) gAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCGGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGc < 3:105895/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGt < 3:204549/149‑1 (MQ=255) cgcACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑g < 1:188370/148‑1 (MQ=255) cgcACGGCATTCGTTAACAACATCGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCGACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑g < 6:156624/148‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGAt < 8:284722/147‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGAt > 7:284722/1‑147 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATgc < 5:81790/149‑1 (MQ=255) aacaacGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCGTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATgc > 8:117997/1‑149 (MQ=255) acacCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGgtg > 2:189319/1‑149 (MQ=255) acCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGCCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGtt > 3:48347/1‑149 (MQ=255) gcACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTc > 6:228273/1‑149 (MQ=255) aCGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCg > 2:112311/1‑148 (MQ=255) ggTATGGCATTCGGCCACCGGTTATGGCGTGAAGCAGTCCCTTGGTGAGTCGGGCGGCACGAAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCaa < 1:109960/148‑1 (MQ=255) gTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg < 3:102734/132‑1 (MQ=255) gTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCg > 4:102734/1‑132 (MQ=255) ccATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc < 5:228273/149‑1 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc > 6:51831/1‑141 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAgc < 5:51831/141‑1 (MQ=255) ccACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTg > 1:228210/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGGAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑Ggc > 1:222989/1‑93 (MQ=255) aCCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑Ggc < 2:222989/93‑1 (MQ=255) ttATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAg < 1:189319/149‑1 (MQ=255) tATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGc < 6:314612/120‑1 (MQ=255) tGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAggg < 7:167550/148‑1 (MQ=255) ccTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGgcgc > 1:75141/1‑149 (MQ=255) ccTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGgcgc > 6:29225/1‑149 (MQ=255) gCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtga > 1:156766/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgt > 5:197031/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgt > 7:159571/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgtga > 6:192476/1‑149 (MQ=255) gggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcg > 6:14788/1‑143 (MQ=255) gggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcg < 5:14788/143‑1 (MQ=255) ggTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGa < 2:302571/149‑1 (MQ=255) gTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCgg > 6:14837/1‑97 (MQ=255) gTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCgg < 5:14837/97‑1 (MQ=255) gAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcac < 6:258270‑M2/149‑112 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccggtgggcgaatggcatacccgtgcgcaggtgtcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcacca > 5:258270‑M2/1‑36 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAggccgactcacccagggtctgcttcaggccataaccgatgtgcgaatggcatacccgtgcgcaggaggcgacgttgttgttaccgaaggccgtgcgcaccagtttctgcac < 2:250267‑M2/147‑112 (MQ=255) gTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCAc < 6:197031/149‑1 (MQ=255) gccggcACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTc > 2:108816/1‑87 (MQ=255) cGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGAc < 1:112311/149‑1 (MQ=255) gCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTa > 6:215385/1‑143 (MQ=255) gCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTa < 5:215385/143‑1 (MQ=255) aaaGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTg > 5:202392/1‑149 (MQ=255) aaaGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTg < 5:192476/149‑1 (MQ=255) aGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgtg < 7:90803/123‑1 (MQ=255) aGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCtgatcgtg > 8:90803/1‑123 (MQ=255) cGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTGGTCGa < 2:156766/147‑1 (MQ=255) ggTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATTGGGCGCAAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAAATCAAGCGCCGCATGCGCCAAGGGGCGAGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTGGTCGCATcgccg > 1:202837/1‑149 (MQ=255) tGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTGGTCGACTCGCCGCAc < 8:159571/149‑1 (MQ=255) | CCTATCTGGTGCAGAAACTGGTGCGCACGGCCTTCGGTAACAACAACGTCGACACCTGCGCACGGGTATGCCATTCGCCCACCGGTTATGGCCTGAAGCAGACCCTGGGTGAGTCGGCCGGCACGCAAAGCTTCGACTCGGTGATGCAGGCCGACGTTGTGCTGGTGATT‑GGCGCCAACCCCACCGATGCGCACCCGGTGTTCGGCTCGCAACTCAAGCGCCGCCTGCGCCAAGGGGCGCGGCTGATCGTGATCGACCCACGGCGTATCGACCTGGTCGACTCGCCGCAC > NC_002947/2491641‑2491930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |